More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0903 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0441  transaldolase  93.73 
 
 		 367 aa  706    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.23069  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0903  transaldolase  100 
 
 		 367 aa  744    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15970  transaldolase  59.45 
 
 		 373 aa  417  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0310395  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19950  transaldolase  59.07 
 
 		 378 aa  416  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.55857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5187  transaldolase  58.5 
 
 		 370 aa  411  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1556  transaldolase  57.85 
 
 		 377 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.538221  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3693  transaldolase  58.66 
 
 		 371 aa  402  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.995782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2096  transaldolase  58.2 
 
 		 371 aa  404  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.968254  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2719  transaldolase  57.66 
 
 		 372 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122475 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2453  transaldolase  58.38 
 
 		 372 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2413  transaldolase  58.38 
 
 		 372 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1935  transaldolase  56.22 
 
 		 376 aa  396  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1837  transaldolase  58.08 
 
 		 371 aa  397  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000480192 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2459  transaldolase  58.38 
 
 		 372 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.815589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2213  transaldolase  56.35 
 
 		 373 aa  395  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0219745  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2245  transaldolase  57.78 
 
 		 366 aa  392  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148922 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2261  transaldolase  57.34 
 
 		 369 aa  393  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00484192  normal  0.0538935 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6014  Transaldolase  57.3 
 
 		 367 aa  390  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.05295  normal  0.727575 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2003  transaldolase  55.59 
 
 		 368 aa  391  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11476  transaldolase  56.42 
 
 		 373 aa  389  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00336068  normal  0.323964 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2373  transaldolase  58.29 
 
 		 372 aa  391  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.397929  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1126  transaldolase  56.68 
 
 		 372 aa  389  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0230919 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2421  transaldolase  55.12 
 
 		 371 aa  382  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2975  transaldolase  55.83 
 
 		 368 aa  383  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3317  transaldolase  54.79 
 
 		 392 aa  380  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.706771  hitchhiker  0.00145949 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3090  transaldolase  54.2 
 
 		 392 aa  380  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.480745 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3642  transaldolase  54.37 
 
 		 384 aa  375  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0794941  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11420  transaldolase  53.87 
 
 		 372 aa  377  1e-103  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.212185  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2523  transaldolase  55.59 
 
 		 368 aa  372  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.634836  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1648  transaldolase  55.03 
 
 		 371 aa  372  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.178896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2074  transaldolase  54.47 
 
 		 369 aa  365  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.195671  normal  0.0887759 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2923  transaldolase  53.78 
 
 		 373 aa  364  1e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2540  transaldolase  52.97 
 
 		 370 aa  361  9e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2057  transaldolase  54.78 
 
 		 367 aa  358  9.999999999999999e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180522  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13200  transaldolase  54.14 
 
 		 387 aa  355  8.999999999999999e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.223243  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1981  transaldolase  52.34 
 
 		 368 aa  353  2e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.430126  normal  0.891493 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15260  transaldolase  54.77 
 
 		 371 aa  353  4e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.295076  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2162  transaldolase  51.5 
 
 		 383 aa  350  2e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.774645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4155  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  47.49 
 
 		 950 aa  309  5e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1509  transaldolase  46.63 
 
 		 374 aa  308  1.0000000000000001e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0933746  normal  0.056885 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1622  transaldolase  45.79 
 
 		 377 aa  305  6e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.632626  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0048  transaldolase  44.72 
 
 		 365 aa  305  6e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2810  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  46.44 
 
 		 958 aa  300  3e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0413323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0683  transaldolase  43.05 
 
 		 380 aa  292  5e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0936811 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6706  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  47.06 
 
 		 940 aa  292  6e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4691  transaldolase  45.86 
 
 		 920 aa  291  1e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.671284 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0269  transaldolase  42.5 
 
 		 376 aa  290  2e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4502  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  46.26 
 
 		 941 aa  290  3e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1497  transaldolase  40.8 
 
 		 383 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000044524 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4965  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  46.26 
 
 		 941 aa  290  3e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.205823 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3474  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  44.88 
 
 		 950 aa  290  4e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.438566 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4869  transaldolase  43.98 
 
 		 446 aa  288  1e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1892  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  44.69 
 
 		 950 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3269  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  43.61 
 
 		 950 aa  286  4e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3670  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  44.69 
 
 		 950 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0665  transaldolase  42.42 
 
 		 359 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.117486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1681  transaldolase  42.35 
 
 		 381 aa  283  5.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5018  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  45.4 
 
 		 940 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.391428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2306  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  45.79 
 
 		 948 aa  282  7.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0592269 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3428  transaldolase  40.72 
 
 		 388 aa  279  5e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0766776  normal  0.365924 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1090  transaldolase  40.86 
 
 		 381 aa  279  6e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2641  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  42.78 
 
 		 965 aa  278  1e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0221  transaldolase  45.45 
 
 		 381 aa  274  2.0000000000000002e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.108518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2719  transaldolase  42.34 
 
 		 373 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2349  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  41.9 
 
 		 955 aa  270  2e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.36478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6315  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  43.58 
 
 		 948 aa  267  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7445  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  43.21 
 
 		 942 aa  266  4e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0581  transaldolase  43.68 
 
 		 363 aa  265  1e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0419  transaldolase  43.68 
 
 		 363 aa  265  1e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.332774  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3220  transaldolase  43.93 
 
 		 648 aa  265  1e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0412  transketolase  43.27 
 
 		 1053 aa  265  1e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2057  transaldolase  39.78 
 
 		 376 aa  261  1e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000591024  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1277  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  41.05 
 
 		 943 aa  258  9e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0170  transaldolase  40.51 
 
 		 365 aa  253  3e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.127604  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2062  transaldolase  39.89 
 
 		 366 aa  251  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4495  transaldolase  39.15 
 
 		 368 aa  247  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.595041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3246  transaldolase  39.04 
 
 		 383 aa  246  6e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1198  transaldolase  37.78 
 
 		 368 aa  239  6.999999999999999e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.178231  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1009  transaldolase  38.57 
 
 		 357 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3708  transaldolase  37.78 
 
 		 360 aa  232  8.000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1953  transaldolase  38.61 
 
 		 382 aa  230  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0088  transaldolase  36.64 
 
 		 361 aa  226  6e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.40765 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1380  transaldolase  32.4 
 
 		 374 aa  195  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.562389  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2902  transaldolase  32.79 
 
 		 374 aa  193  4e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.71293e-17 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1306  transaldolase  32.56 
 
 		 334 aa  160  3e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0464  transaldolase  31.21 
 
 		 326 aa  155  1e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00318422  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1660  transaldolase  31.27 
 
 		 332 aa  150  3e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.165433  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0334  transaldolase  32.58 
 
 		 331 aa  146  6e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0209  transaldolase  32.58 
 
 		 331 aa  143  5e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0341921  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3390  Transaldolase  29.7 
 
 		 371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0169943  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1583  transaldolase  30.4 
 
 		 330 aa  130  3e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6478  transaldolase  30.82 
 
 		 399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0329  transaldolase  29.51 
 
 		 325 aa  120  3e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1690  transaldolase  27.51 
 
 		 325 aa  120  3e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0307  transaldolase  29.86 
 
 		 325 aa  120  3.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1366  transaldolase  27.84 
 
 		 323 aa  100  4e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.693972  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3832  Transaldolase  33.11 
 
 		 346 aa  99.4  8e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.310987  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1925  transaldolase  29.25 
 
 		 400 aa  78.2  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0587  transaldolase B  32.74 
 
 		 327 aa  70.5  0.00000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03321  transaldolase B  34.13 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>