99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3390 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3390  Transaldolase  100 
 
 
371 aa  737    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0169943  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0048  transaldolase  41.55 
 
 
365 aa  248  1e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0269  transaldolase  31.52 
 
 
376 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3246  transaldolase  34.57 
 
 
383 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4155  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  32.16 
 
 
950 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2641  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  31.37 
 
 
965 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4869  transaldolase  32.49 
 
 
446 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2213  transaldolase  33.78 
 
 
373 aa  162  7e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0219745  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2074  transaldolase  34.85 
 
 
369 aa  162  9e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.195671  normal  0.0887759 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1892  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  32.16 
 
 
950 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5187  transaldolase  34.58 
 
 
370 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3269  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  31.58 
 
 
950 aa  160  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15970  transaldolase  33.15 
 
 
373 aa  160  4e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0310395  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6315  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  32.88 
 
 
948 aa  160  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1198  transaldolase  34.89 
 
 
368 aa  159  9e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.178231  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4965  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  31.67 
 
 
941 aa  157  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.205823 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3474  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  31.89 
 
 
950 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.438566 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4502  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  31.67 
 
 
941 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270677  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5018  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  31.59 
 
 
940 aa  157  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.391428  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1935  transaldolase  34.33 
 
 
376 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18854  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1837  transaldolase  33.43 
 
 
371 aa  155  7e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000480192 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1648  transaldolase  32.43 
 
 
371 aa  155  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.178896  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3642  transaldolase  33.62 
 
 
384 aa  155  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0794941  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2373  transaldolase  33.71 
 
 
372 aa  155  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.397929  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2096  transaldolase  33.06 
 
 
371 aa  154  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.968254  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6014  Transaldolase  32.78 
 
 
367 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.05295  normal  0.727575 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2923  transaldolase  32.86 
 
 
373 aa  154  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1497  transaldolase  30.79 
 
 
383 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000044524 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2261  transaldolase  31.27 
 
 
369 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00484192  normal  0.0538935 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0665  transaldolase  33.43 
 
 
359 aa  152  7e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.117486  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1981  transaldolase  33.91 
 
 
368 aa  152  7e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.430126  normal  0.891493 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2003  transaldolase  33.51 
 
 
368 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1126  transaldolase  32.38 
 
 
372 aa  152  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0230919 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3670  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  31.28 
 
 
950 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1681  transaldolase  28.13 
 
 
381 aa  152  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3428  transaldolase  28.81 
 
 
388 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0766776  normal  0.365924 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13200  transaldolase  33.05 
 
 
387 aa  151  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.223243  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11420  transaldolase  35.62 
 
 
372 aa  150  3e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.212185  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1090  transaldolase  27.42 
 
 
381 aa  149  6e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2421  transaldolase  30.3 
 
 
371 aa  149  7e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3220  transaldolase  34.96 
 
 
648 aa  149  9e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1277  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  32.35 
 
 
943 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2245  transaldolase  32.27 
 
 
366 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000148922 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2062  transaldolase  32.37 
 
 
366 aa  145  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6706  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  33.33 
 
 
940 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2349  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  28.84 
 
 
955 aa  144  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.36478  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2523  transaldolase  33.15 
 
 
368 aa  143  5e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.634836  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7445  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  32.77 
 
 
942 aa  142  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0221  transaldolase  33.33 
 
 
381 aa  142  9e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.108518  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0683  transaldolase  28.27 
 
 
380 aa  142  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0936811 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2540  transaldolase  33.55 
 
 
370 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0170  transaldolase  29.94 
 
 
365 aa  142  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.127604  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2453  transaldolase  32.29 
 
 
372 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210707  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2413  transaldolase  32.29 
 
 
372 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3708  transaldolase  29.72 
 
 
360 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2057  transaldolase  31.73 
 
 
367 aa  141  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180522  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2810  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  28.42 
 
 
958 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0413323  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2459  transaldolase  32.29 
 
 
372 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.815589  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0441  transaldolase  30.52 
 
 
367 aa  140  3e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.23069  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2719  transaldolase  32.03 
 
 
372 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.122475 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2719  transaldolase  34.1 
 
 
373 aa  140  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3693  transaldolase  34.19 
 
 
371 aa  139  6e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.995782  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2975  transaldolase  30.81 
 
 
368 aa  139  7e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3090  transaldolase  31.14 
 
 
392 aa  139  7.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.480745 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4495  transaldolase  32.67 
 
 
368 aa  139  8.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.595041  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3317  transaldolase  31.43 
 
 
392 aa  137  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.706771  hitchhiker  0.00145949 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0581  transaldolase  29.59 
 
 
363 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0419  transaldolase  29.59 
 
 
363 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.332774  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19950  transaldolase  30.23 
 
 
378 aa  136  5e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.55857  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11476  transaldolase  30.19 
 
 
373 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00336068  normal  0.323964 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15260  transaldolase  30.85 
 
 
371 aa  132  9e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.295076  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1622  transaldolase  29.38 
 
 
377 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.632626  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0903  transaldolase  29.7 
 
 
367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2057  transaldolase  26.95 
 
 
376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000591024  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2162  transaldolase  34.32 
 
 
383 aa  130  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.774645  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1009  transaldolase  32.3 
 
 
357 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1509  transaldolase  29.67 
 
 
374 aa  129  6e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0933746  normal  0.056885 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0412  transketolase  31.41 
 
 
1053 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0088  transaldolase  28.34 
 
 
361 aa  126  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.40765 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4691  transaldolase  31.53 
 
 
920 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.671284 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1380  transaldolase  31.17 
 
 
374 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.562389  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2306  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  28.18 
 
 
948 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0592269 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1953  transaldolase  27.17 
 
 
382 aa  119  7.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2902  transaldolase  30.27 
 
 
374 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.71293e-17 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1556  transaldolase  31.8 
 
 
377 aa  113  5e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.538221  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0464  transaldolase  25.07 
 
 
326 aa  95.9  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00318422  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1306  transaldolase  25.64 
 
 
334 aa  85.5  0.000000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1583  transaldolase  27.88 
 
 
330 aa  84  0.000000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0334  transaldolase  23.5 
 
 
331 aa  81.3  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0209  transaldolase  24.93 
 
 
331 aa  81.3  0.00000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0341921  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1660  transaldolase  31.58 
 
 
332 aa  77.8  0.0000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.165433  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6478  transaldolase  29.63 
 
 
399 aa  74.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0329  transaldolase  21.7 
 
 
325 aa  74.3  0.000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1690  transaldolase  21.41 
 
 
325 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0307  transaldolase  21.41 
 
 
325 aa  70.1  0.00000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1175  transaldolase  30.81 
 
 
371 aa  54.7  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1366  transaldolase  24.48 
 
 
323 aa  53.9  0.000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.693972  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3832  Transaldolase  26.39 
 
 
346 aa  53.9  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.310987  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1925  transaldolase  26.18 
 
 
400 aa  46.2  0.0009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>