229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1366 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1366  transaldolase  100 
 
 		 323 aa  641    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.693972  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0307  transaldolase  71.56 
 
 		 325 aa  444  1.0000000000000001e-124  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0329  transaldolase  70.95 
 
 		 325 aa  442  1e-123  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1690  transaldolase  70.64 
 
 		 325 aa  439  9.999999999999999e-123  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0334  transaldolase  48.94 
 
 		 331 aa  293  4e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1660  transaldolase  47.24 
 
 		 332 aa  281  8.000000000000001e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.165433  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1306  transaldolase  47.08 
 
 		 334 aa  271  1e-71  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1583  transaldolase  48.01 
 
 		 330 aa  270  2e-71  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0209  transaldolase  46.06 
 
 		 331 aa  267  2e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0341921  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0464  transaldolase  44.85 
 
 		 326 aa  249  6e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00318422  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0170  transaldolase  32.95 
 
 		 365 aa  158  1e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.127604  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1198  transaldolase  30.69 
 
 		 368 aa  151  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.178231  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3269  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  32.06 
 
 		 950 aa  145  8.000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1622  transaldolase  30.08 
 
 		 377 aa  144  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.632626  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2349  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  29.01 
 
 		 955 aa  143  4e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.36478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6315  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  30.03 
 
 		 948 aa  142  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11420  transaldolase  26.61 
 
 		 372 aa  142  8e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.212185  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3670  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  29.48 
 
 		 950 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2641  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  32.33 
 
 		 965 aa  140  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1892  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  32.67 
 
 		 950 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0665  transaldolase  28.33 
 
 		 359 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.117486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2719  transaldolase  28.98 
 
 		 373 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4155  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  30.39 
 
 		 950 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3246  transaldolase  26.26 
 
 		 383 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1556  transaldolase  27.17 
 
 		 377 aa  136  4e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.538221  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1277  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  28.9 
 
 		 943 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2245  transaldolase  28.41 
 
 		 366 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148922 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2923  transaldolase  28.45 
 
 		 373 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3474  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  32.01 
 
 		 950 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.438566 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2975  transaldolase  28.12 
 
 		 368 aa  134  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2373  transaldolase  28.43 
 
 		 372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.397929  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0048  transaldolase  26.99 
 
 		 365 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1953  transaldolase  29.15 
 
 		 382 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4691  transaldolase  28.12 
 
 		 920 aa  130  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.671284 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15260  transaldolase  27.2 
 
 		 371 aa  129  9.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.295076  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1509  transaldolase  26.06 
 
 		 374 aa  128  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0933746  normal  0.056885 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15970  transaldolase  26.12 
 
 		 373 aa  126  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0310395  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2421  transaldolase  29.63 
 
 		 371 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2003  transaldolase  26.7 
 
 		 368 aa  124  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2810  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  29.01 
 
 		 958 aa  124  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0413323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2062  transaldolase  27.87 
 
 		 366 aa  124  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5018  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  31.23 
 
 		 940 aa  124  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.391428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1009  transaldolase  27.14 
 
 		 357 aa  123  3e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5187  transaldolase  29.55 
 
 		 370 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2306  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  29.69 
 
 		 948 aa  123  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0592269 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2719  transaldolase  27.35 
 
 		 372 aa  122  8e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6014  Transaldolase  25.78 
 
 		 367 aa  122  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.05295  normal  0.727575 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4965  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  30.95 
 
 		 941 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.205823 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1981  transaldolase  25.92 
 
 		 368 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.430126  normal  0.891493 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4502  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  30.95 
 
 		 941 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0581  transaldolase  27.43 
 
 		 363 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0419  transaldolase  27.43 
 
 		 363 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.332774  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11476  transaldolase  25.29 
 
 		 373 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00336068  normal  0.323964 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2261  transaldolase  25.71 
 
 		 369 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00484192  normal  0.0538935 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6706  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  28.65 
 
 		 940 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2413  transaldolase  25.21 
 
 		 372 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2459  transaldolase  25.21 
 
 		 372 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.815589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2453  transaldolase  25.21 
 
 		 372 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1497  transaldolase  29.62 
 
 		 383 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000044524 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7445  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  29.41 
 
 		 942 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1648  transaldolase  26.97 
 
 		 371 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.178896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3708  transaldolase  32.16 
 
 		 360 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13200  transaldolase  26.2 
 
 		 387 aa  118  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.223243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2213  transaldolase  25 
 
 		 373 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0219745  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3693  transaldolase  26.57 
 
 		 371 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.995782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0683  transaldolase  29.46 
 
 		 380 aa  117  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0936811 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0221  transaldolase  26.93 
 
 		 381 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.108518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19950  transaldolase  24.58 
 
 		 378 aa  117  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.55857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1837  transaldolase  27.76 
 
 		 371 aa  117  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000480192 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2096  transaldolase  28.21 
 
 		 371 aa  117  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.968254  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2074  transaldolase  26.6 
 
 		 369 aa  116  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.195671  normal  0.0887759 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3428  transaldolase  28.49 
 
 		 388 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0766776  normal  0.365924 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2523  transaldolase  26.8 
 
 		 368 aa  116  5e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.634836  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0088  transaldolase  31.96 
 
 		 361 aa  115  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.40765 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4495  transaldolase  25.88 
 
 		 368 aa  115  8.999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.595041  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1090  transaldolase  26.46 
 
 		 381 aa  114  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3090  transaldolase  25.5 
 
 		 392 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.480745 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1681  transaldolase  31.1 
 
 		 381 aa  113  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2540  transaldolase  25.41 
 
 		 370 aa  113  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3642  transaldolase  27.3 
 
 		 384 aa  113  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0794941  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0269  transaldolase  27.64 
 
 		 376 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2162  transaldolase  26.76 
 
 		 383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.774645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0903  transaldolase  27.84 
 
 		 367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1935  transaldolase  25.28 
 
 		 376 aa  110  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4869  transaldolase  27.27 
 
 		 446 aa  109  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0441  transaldolase  27.01 
 
 		 367 aa  108  9.000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.23069  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3220  transaldolase  26.09 
 
 		 648 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1126  transaldolase  25.91 
 
 		 372 aa  108  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0230919 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0412  transketolase  29.14 
 
 		 1053 aa  105  9e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2057  transaldolase  27.33 
 
 		 376 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000591024  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3317  transaldolase  26.8 
 
 		 392 aa  104  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.706771  hitchhiker  0.00145949 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1380  transaldolase  24.09 
 
 		 374 aa  102  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.562389  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2902  transaldolase  29.15 
 
 		 374 aa  98.2  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.71293e-17 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2057  transaldolase  25.39 
 
 		 367 aa  97.4  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180522  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3832  Transaldolase  26.56 
 
 		 346 aa  84.7  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.310987  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3390  Transaldolase  24.35 
 
 		 371 aa  70.1  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0169943  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1925  transaldolase  24.2 
 
 		 400 aa  64.7  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0688  transaldolase B  34.01 
 
 		 317 aa  62  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0573478  hitchhiker  0.00205888 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0803  transaldolase B  32.17 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.240224  normal  0.311976 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3472  transaldolase B  32.17 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.179148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>