140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2238 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1248  hypothetical protein  81.88 
 
 		 617 aa  988    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.531682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3348  hypothetical protein  91.25 
 
 		 628 aa  1092    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989133  normal  0.0467064 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2116  hypothetical protein  85.59 
 
 		 583 aa  1038    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2094  hypothetical protein  90.39 
 
 		 582 aa  1084    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1508  hypothetical protein  82.91 
 
 		 584 aa  1003    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496743  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3526  hypothetical protein  82.38 
 
 		 583 aa  969    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.543626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5753  hypothetical protein  60.27 
 
 		 612 aa  646    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.985257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2238  protein of unknown function DUF87  100 
 
 		 583 aa  1175    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5744  hypothetical protein  55.5 
 
 		 590 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575418 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2804  hypothetical protein  42.83 
 
 		 693 aa  462  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2009  hypothetical protein  46.47 
 
 		 662 aa  451  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1486  hypothetical protein  43.58 
 
 		 560 aa  442  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2792  protein of unknown function DUF87  44.63 
 
 		 679 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.744858  normal  0.636348 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2533  protein of unknown function DUF87  43.52 
 
 		 674 aa  435  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1803  hypothetical protein  42.88 
 
 		 626 aa  429  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321314  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1359  hypothetical protein  43.44 
 
 		 570 aa  409  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997931 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2640  hypothetical protein  39.18 
 
 		 569 aa  353  4e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  37.64 
 
 		 544 aa  353  4e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0605  hypothetical protein  37.2 
 
 		 569 aa  347  3e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1238  protein of unknown function DUF87  32.39 
 
 		 575 aa  235  2.0000000000000002e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  30.52 
 
 		 550 aa  234  3e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  30.17 
 
 		 709 aa  220  5e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  30.31 
 
 		 593 aa  218  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1674  protein of unknown function DUF87  28.4 
 
 		 591 aa  217  5.9999999999999996e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1078  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1687  hypothetical protein  31.82 
 
 		 546 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  28.38 
 
 		 623 aa  213  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0931  domain of unknown function protein  29.27 
 
 		 607 aa  196  9e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  27.91 
 
 		 599 aa  194  4e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0451  protein of unknown function DUF87  29.4 
 
 		 526 aa  180  8e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3687  hypothetical protein  26.98 
 
 		 594 aa  171  4e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0286808  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0961  protein of unknown function DUF87  24.3 
 
 		 595 aa  167  5.9999999999999996e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000841984  hitchhiker  0.00444389 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1949  hypothetical protein  27.86 
 
 		 591 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1394  hypothetical protein  30.96 
 
 		 559 aa  162  1e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0239  hypothetical protein  26.02 
 
 		 579 aa  158  3e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0482  protein of unknown function DUF87  27.02 
 
 		 577 aa  157  6e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  26.64 
 
 		 579 aa  140  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  37.2 
 
 		 679 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4448  hypothetical protein  33.33 
 
 		 587 aa  126  9e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278839 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3715  hypothetical protein  27.01 
 
 		 601 aa  123  9e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3200  ATPase-like protein  32.38 
 
 		 659 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0135  protein of unknown function DUF87  25.78 
 
 		 520 aa  108  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0231678  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  26.43 
 
 		 616 aa  105  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  25.39 
 
 		 564 aa  105  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0203  protein of unknown function DUF87  31.75 
 
 		 670 aa  103  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.187802 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4054  protein of unknown function DUF87  36.31 
 
 		 709 aa  102  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0459328  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  23.68 
 
 		 496 aa  102  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1044  ATPase-like protein  30.71 
 
 		 674 aa  102  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0709  protein of unknown function DUF87  27.78 
 
 		 714 aa  100  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2465  protein of unknown function DUF87  25.43 
 
 		 600 aa  99.8  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  36.25 
 
 		 605 aa  98.2  3e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  26.46 
 
 		 496 aa  98.2  4e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5073  ATPase-like  24.81 
 
 		 567 aa  97.1  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  25.37 
 
 		 531 aa  96.3  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0326  hypothetical protein  27.11 
 
 		 497 aa  95.9  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519227  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  35 
 
 		 611 aa  94.7  4e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0511  hypothetical protein  27.11 
 
 		 497 aa  94  6e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  24.95 
 
 		 608 aa  93.6  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2356  hypothetical protein  30.05 
 
 		 603 aa  90.9  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4576  ATPase-like protein  30.86 
 
 		 664 aa  90.9  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26835  normal  0.0312719 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0760  hypothetical protein  26.47 
 
 		 492 aa  90.1  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.360251  normal  0.0367515 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4332  hypothetical protein  25.49 
 
 		 427 aa  87.4  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  24.1 
 
 		 557 aa  86.7  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1416  protein of unknown function DUF87  34.03 
 
 		 617 aa  86.7  0.000000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  37.39 
 
 		 563 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  33.33 
 
 		 560 aa  84.7  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  31.65 
 
 		 557 aa  84.3  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  40.68 
 
 		 559 aa  83.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3486  ATPase-like protein  26.08 
 
 		 574 aa  83.2  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123894  normal  0.207133 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3925  protein of unknown function DUF87  32.26 
 
 		 581 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1408  hypothetical protein  35.71 
 
 		 497 aa  80.5  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.502855  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  25.25 
 
 		 500 aa  79.3  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  34.68 
 
 		 493 aa  77.8  0.0000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  40.57 
 
 		 628 aa  75.5  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1243  hypothetical protein  28.47 
 
 		 510 aa  74.3  0.000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0443  protein of unknown function DUF87  34.38 
 
 		 360 aa  73.6  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0177789  normal  0.220913 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  23.81 
 
 		 524 aa  73.6  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  33.33 
 
 		 508 aa  72.4  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2030  hypothetical protein  39.18 
 
 		 589 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309935 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4980  hypothetical protein  35.11 
 
 		 570 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2549  hypothetical protein  23.96 
 
 		 542 aa  71.6  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.170922  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1138  hypothetical protein  35.71 
 
 		 561 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0326  hypothetical protein  22.42 
 
 		 530 aa  67.4  0.0000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2366  protein of unknown function DUF87  37.5 
 
 		 592 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.250268  normal  0.14702 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0306  hypothetical protein  22.42 
 
 		 530 aa  65.9  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2954  hypothetical protein  23.73 
 
 		 589 aa  63.9  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000103337 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_268  hypothetical protein  21.12 
 
 		 530 aa  63.5  0.000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3279  hypothetical protein  24.56 
 
 		 590 aa  62  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1440  hypothetical protein  25.42 
 
 		 539 aa  61.2  0.00000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.828058  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1482  hypothetical protein  23.23 
 
 		 546 aa  60.8  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.431628  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1752  protein of unknown function DUF87  37 
 
 		 643 aa  60.1  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  42.25 
 
 		 523 aa  60.1  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1389  hypothetical protein  31.41 
 
 		 606 aa  59.3  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.103576 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0018  protein of unknown function DUF87  32.03 
 
 		 537 aa  58.5  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.989354  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0074  hypothetical protein  41.77 
 
 		 495 aa  58.5  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0871233  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1515  protein of unknown function DUF87  30 
 
 		 530 aa  58.2  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.649754  normal  0.132485 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0753  protein of unknown function DUF87  37.07 
 
 		 506 aa  57.4  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0799035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0937  hypothetical protein  27.07 
 
 		 540 aa  57.4  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0147133  normal  0.254287 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2149  ATPase  33.33 
 
 		 605 aa  57  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4844  hypothetical protein  35.59 
 
 		 579 aa  56.6  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.415691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1701  hypothetical protein  34.11 
 
 		 539 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.016697  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>