182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3317 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3317  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 355 aa  715    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.355052 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0055  radical SAM domain-containing protein  81.97 
 
 		 355 aa  605  9.999999999999999e-173  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3708  Radical SAM domain protein  60.45 
 
 		 354 aa  436  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000832138  hitchhiker  0.000000507033 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1107  radical SAM domain-containing protein  51.72 
 
 		 374 aa  363  3e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.614864  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0196  radical SAM domain-containing protein  43.37 
 
 		 297 aa  122  7e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1030  radical SAM domain-containing protein  29.25 
 
 		 295 aa  121  1.9999999999999998e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1252  radical SAM domain-containing protein  40.96 
 
 		 298 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2091  Radical SAM domain protein  29.92 
 
 		 295 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000137131  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0268  radical SAM domain-containing protein  40.64 
 
 		 301 aa  120  3e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.698085  normal  0.0396119 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0620  radical SAM family Fe-S protein  36.32 
 
 		 350 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0015  Radical SAM domain protein  35.55 
 
 		 363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.811476  hitchhiker  0.00130653 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0685  radical SAM domain-containing protein  41.62 
 
 		 294 aa  114  3e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0316247 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4095  radical SAM domain-containing protein  37.25 
 
 		 362 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0547  radical SAM domain-containing protein  39 
 
 		 362 aa  110  5e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0708  Radical SAM domain protein  35.48 
 
 		 306 aa  109  8.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2545  radical SAM family protein  34.63 
 
 		 417 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0182  radical SAM domain-containing protein  30.39 
 
 		 256 aa  108  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2980  Radical SAM domain protein  33.97 
 
 		 381 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0187919 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1419  radical SAM domain-containing protein  37.91 
 
 		 359 aa  107  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1617  radical SAM family protein  36.26 
 
 		 415 aa  106  6e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1003  hypothetical protein  30.77 
 
 		 381 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_004310  BR0387  hypothetical protein  35.35 
 
 		 390 aa  104  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2292  Radical SAM domain protein  28.1 
 
 		 298 aa  105  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.699414  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1011  radical SAM domain-containing protein  35 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1782  radical SAM domain-containing protein  35.38 
 
 		 281 aa  105  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.425379  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0399  hypothetical protein  35.35 
 
 		 390 aa  104  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0452  radical SAM domain-containing protein  35.44 
 
 		 385 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.290609 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0707  radical SAM domain-containing protein  34.3 
 
 		 421 aa  104  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0399019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2341  hypothetical protein  33 
 
 		 377 aa  103  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0183  radical SAM domain-containing protein  33.15 
 
 		 289 aa  103  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0619  hypothetical protein  32.22 
 
 		 290 aa  103  6e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0959  radical SAM domain-containing protein  33.68 
 
 		 258 aa  103  6e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00609549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1946  radical SAM domain-containing protein  34.86 
 
 		 437 aa  103  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041965 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1080  radical SAM family protein  32.51 
 
 		 386 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.981176  normal  0.301506 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3135  radical SAM family protein  35.1 
 
 		 365 aa  102  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.787669  normal  0.057986 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0047  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.03 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2549  radical SAM domain-containing protein  30.22 
 
 		 385 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22398  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2862  radical SAM domain-containing protein  33 
 
 		 383 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22952  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0508  radical SAM domain-containing protein  33 
 
 		 390 aa  101  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.233922  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0870  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 374 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0400323  normal  0.723126 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2530  radical SAM domain-containing protein  32.22 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138868  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0406  radical SAM domain-containing protein  30.22 
 
 		 374 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2972  radical SAM domain-containing protein  33 
 
 		 385 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1658  radical SAM domain-containing protein  32.51 
 
 		 376 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0799  Radical SAM domain protein  33 
 
 		 374 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.737474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0587  radical SAM family protein  32.06 
 
 		 392 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1025  radical SAM domain-containing protein  32.06 
 
 		 388 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1066  radical SAM domain-containing protein  32.06 
 
 		 392 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1761  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 360 aa  100  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2509  hypothetical protein  33.01 
 
 		 366 aa  100  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.690045 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0923  radical SAM domain-containing protein  30.22 
 
 		 385 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2923  radical SAM domain-containing protein  33 
 
 		 385 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0224  radical SAM domain-containing protein  30.22 
 
 		 385 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4466  radical SAM domain-containing protein  35 
 
 		 353 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1768  radical SAM domain-containing protein  33.99 
 
 		 374 aa  100  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.938086 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0928  hypothetical protein  33.5 
 
 		 375 aa  100  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2237  radical SAM domain-containing protein  33.01 
 
 		 392 aa  100  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2104  Radical SAM domain protein  33.99 
 
 		 380 aa  100  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.124136  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1206  radical SAM family protein  32.51 
 
 		 393 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.649327 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2670  Radical SAM domain protein  26.18 
 
 		 290 aa  99.8  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4180  radical SAM family protein  32.06 
 
 		 391 aa  99.8  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1225  Radical SAM domain protein  32.51 
 
 		 386 aa  99.4  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.931656  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0742  radical SAM family protein  32.76 
 
 		 361 aa  99.4  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.669971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0083  radical SAM family protein  35.09 
 
 		 352 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0767  radical SAM domain-containing protein  30.39 
 
 		 386 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.338567 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1693  Radical SAM domain protein  36.99 
 
 		 364 aa  99  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637102  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0289  radical SAM family protein  35.68 
 
 		 352 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3325  radical SAM family protein  34.63 
 
 		 368 aa  97.8  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000113455 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0117  radical SAM domain-containing protein  35.5 
 
 		 352 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.190485 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1773  radical SAM family protein  32.83 
 
 		 378 aa  97.4  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.680102  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4362  radical SAM family protein  32.51 
 
 		 387 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16102  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0946  radical SAM domain-containing protein  31.58 
 
 		 392 aa  97.8  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3183  Radical SAM domain protein  32.26 
 
 		 370 aa  97.1  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177318 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1485  radical SAM domain-containing protein  31.53 
 
 		 373 aa  97.1  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1266  radical SAM family protein  35.09 
 
 		 360 aa  96.7  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.249898 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0398  radical SAM domain-containing protein  30.3 
 
 		 372 aa  97.1  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1488  Radical SAM domain protein  32.12 
 
 		 368 aa  96.7  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000243834 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3517  Radical SAM domain protein  36 
 
 		 390 aa  96.7  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.546912  normal  0.918389 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1963  radical SAM domain-containing protein  32.47 
 
 		 389 aa  96.7  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.003672  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0099  radical SAM domain protein  34.85 
 
 		 352 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0290614 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1743  Radical SAM domain protein  34.09 
 
 		 375 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.106017  normal  0.444535 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0114  radical SAM domain-containing protein  34.85 
 
 		 352 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2403  radical SAM domain-containing protein  39.29 
 
 		 389 aa  96.3  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2123  radical SAM domain-containing protein  34.17 
 
 		 362 aa  96.3  8e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5254  radical SAM domain protein  33.99 
 
 		 352 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0937  hypothetical protein  35.09 
 
 		 385 aa  95.9  9e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388526  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0327  Radical SAM domain protein  31.61 
 
 		 281 aa  95.9  9e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1829  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 		 276 aa  95.9  9e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2803  radical SAM domain-containing protein  33.99 
 
 		 402 aa  95.9  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.246146 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0798  radical SAM domain-containing protein  35.23 
 
 		 362 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.442309 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2293  Radical SAM domain protein  33.99 
 
 		 385 aa  95.9  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.972622  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2600  DNA repair photolyase  30.83 
 
 		 386 aa  94.7  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.64054  normal  0.361396 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0942  radical SAM domain-containing protein  31.1 
 
 		 392 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1433  Radical SAM domain protein  33.5 
 
 		 395 aa  94.7  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.908326 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0334  Radical SAM domain protein  32.2 
 
 		 357 aa  94.4  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05793  radical SAM domain protein  31.58 
 
 		 375 aa  94.7  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0113  radical SAM domain-containing protein  34.34 
 
 		 352 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412834 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1137  Radical SAM domain protein  27.19 
 
 		 357 aa  93.6  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03695  radical SAM domain protein  28.09 
 
 		 356 aa  93.6  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3344  Radical SAM domain protein  31.6 
 
 		 362 aa  93.6  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000768449  normal  0.0781434 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>