More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1769 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1769  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  667    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.416782  normal  0.417571 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5514  hypothetical protein  52.42 
 
 		 330 aa  325  8.000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5624  hypothetical protein  44.55 
 
 		 321 aa  290  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4537  hypothetical protein  36.6 
 
 		 319 aa  202  5e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000308592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1801  hypothetical protein  36.07 
 
 		 343 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.939675  normal  0.361643 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  37.54 
 
 		 322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5147  extra-cytoplasmic solute receptor  34.77 
 
 		 320 aa  193  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.698563  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4305  hypothetical protein  32.4 
 
 		 327 aa  192  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3537  hypothetical protein  34.77 
 
 		 322 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2451  hypothetical protein  36.28 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3797  extra-cytoplasmic solute receptor  34.27 
 
 		 320 aa  186  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  35.09 
 
 		 332 aa  186  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6186  hypothetical protein  35.81 
 
 		 327 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  35.2 
 
 		 331 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  34.53 
 
 		 333 aa  182  5.0000000000000004e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1315  hypothetical protein  36.88 
 
 		 328 aa  182  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39846  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  34.48 
 
 		 334 aa  182  7e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  34.87 
 
 		 331 aa  182  9.000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  34.28 
 
 		 325 aa  182  9.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4788  hypothetical protein  34.65 
 
 		 328 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0126294  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0208  hypothetical protein  34.36 
 
 		 335 aa  180  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0236  hypothetical protein  36.05 
 
 		 329 aa  180  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  34.41 
 
 		 328 aa  179  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  33.33 
 
 		 349 aa  180  4e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3862  hypothetical protein  34.36 
 
 		 339 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.915599  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2753  hypothetical protein  34.36 
 
 		 327 aa  179  4.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1370  hypothetical protein  36.16 
 
 		 338 aa  178  9e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4467  hypothetical protein  30.27 
 
 		 328 aa  178  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0114308  normal  0.0574707 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  32.2 
 
 		 328 aa  177  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4796  hypothetical protein  33.89 
 
 		 331 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  41.49 
 
 		 322 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0187  hypothetical protein  33.11 
 
 		 332 aa  177  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  33.12 
 
 		 326 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0796  hypothetical protein  33.33 
 
 		 340 aa  176  5e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.980673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  33.12 
 
 		 327 aa  176  6e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  35.15 
 
 		 353 aa  176  7e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5315  hypothetical protein  33.33 
 
 		 332 aa  176  7e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.248972  normal  0.736345 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  32.99 
 
 		 339 aa  175  9e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3576  hypothetical protein  32.04 
 
 		 330 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.37147  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0578  hypothetical protein  31.35 
 
 		 327 aa  175  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3868  hypothetical protein  34.8 
 
 		 324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0125  hypothetical protein  34.13 
 
 		 324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2006  hypothetical protein  35.82 
 
 		 345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.88077 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1547  hypothetical protein  33.44 
 
 		 324 aa  174  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2999  hypothetical protein  32.88 
 
 		 324 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.272534 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3870  hypothetical protein  32.66 
 
 		 315 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0646118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4082  hypothetical protein  33.45 
 
 		 331 aa  174  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1449  twin-arginine translocation pathway signal  33.75 
 
 		 331 aa  173  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0404058  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  30.53 
 
 		 328 aa  173  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3721  extra-cytoplasmic solute receptor  32.92 
 
 		 345 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0143  hypothetical protein  33.79 
 
 		 324 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.169608  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  32.99 
 
 		 324 aa  172  6.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  34.25 
 
 		 331 aa  172  7.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4405  hypothetical protein  35.81 
 
 		 329 aa  172  9e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3311  hypothetical protein  31.76 
 
 		 324 aa  172  9e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.187965 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4115  hypothetical protein  34.59 
 
 		 336 aa  172  9e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  32.99 
 
 		 334 aa  172  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4980  hypothetical protein  35.98 
 
 		 321 aa  172  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.790818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3797  twin-arginine translocation pathway signal  35.54 
 
 		 329 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.800124  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  33.77 
 
 		 332 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  32.5 
 
 		 322 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  32.5 
 
 		 358 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2663  hypothetical protein  31.76 
 
 		 324 aa  171  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  33.65 
 
 		 324 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  33.44 
 
 		 335 aa  171  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5507  hypothetical protein  33.99 
 
 		 319 aa  170  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1578  hypothetical protein  33.03 
 
 		 395 aa  170  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383459 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  33.68 
 
 		 343 aa  170  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4337  extra-cytoplasmic solute receptor  35.8 
 
 		 335 aa  170  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2502  hypothetical protein  33.56 
 
 		 333 aa  170  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0326182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1607  hypothetical protein  33.44 
 
 		 333 aa  169  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0198  twin-arginine translocation pathway signal  34.35 
 
 		 328 aa  169  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.297337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  29.91 
 
 		 328 aa  169  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  30 
 
 		 327 aa  169  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2871  hypothetical protein  33 
 
 		 305 aa  169  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0136  hypothetical protein  34.97 
 
 		 355 aa  169  7e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  31.86 
 
 		 330 aa  169  7e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  32.88 
 
 		 328 aa  169  7e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  31.86 
 
 		 330 aa  169  8e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  31.27 
 
 		 327 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  32.12 
 
 		 324 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0567  hypothetical protein  30.38 
 
 		 329 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0712  hypothetical protein  37.1 
 
 		 324 aa  168  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.780507 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1840  hypothetical protein  33.56 
 
 		 326 aa  167  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0526902  normal  0.401977 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  34.33 
 
 		 330 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0805  hypothetical protein  34.01 
 
 		 328 aa  167  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  33.33 
 
 		 698 aa  167  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1674  hypothetical protein  33.85 
 
 		 326 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0696411  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2668  hypothetical protein  33.12 
 
 		 336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  32.6 
 
 		 339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  34.52 
 
 		 321 aa  167  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  32.99 
 
 		 314 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1930  hypothetical protein  33.77 
 
 		 330 aa  166  4e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.886467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3801  hypothetical protein  32.69 
 
 		 335 aa  166  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.694709  normal  0.119002 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  33.8 
 
 		 304 aa  166  4e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  33.68 
 
 		 339 aa  166  4e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2752  hypothetical protein  31.63 
 
 		 325 aa  166  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.299516 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  30.31 
 
 		 327 aa  166  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  32.87 
 
 		 325 aa  166  5e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  33.13 
 
 		 332 aa  166  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>