More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1114 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1114  major facilitator transporter  100 
 
 		 395 aa  757    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00877  multidrug resistance 1 transmembrane protein  52.84 
 
 		 405 aa  322  6e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00243064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0587  major facilitator transporter  36.84 
 
 		 392 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0110  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0106  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 413 aa  90.9  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  24.37 
 
 		 387 aa  85.9  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  24.65 
 
 		 413 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3215  major facilitator transporter  27.35 
 
 		 411 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0334409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 406 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  32.41 
 
 		 397 aa  82  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 416 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0032  tetracycline resistance protein, class A  35.92 
 
 		 399 aa  80.9  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6539  major facilitator transporter  28.98 
 
 		 420 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.497614 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1351  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  27.03 
 
 		 416 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0854503  normal  0.0233504 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  23.88 
 
 		 406 aa  79.7  0.00000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00896  transport transmembrane protein  26.14 
 
 		 406 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4868  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 418 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  23.97 
 
 		 411 aa  79.3  0.0000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0042  tetracycline repressor protein TetA, class A  35.44 
 
 		 424 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0153  tetracycline resistance protein, class A  35.44 
 
 		 424 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2319  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 407 aa  78.6  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  25 
 
 		 411 aa  77.8  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  22.19 
 
 		 388 aa  77.4  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  22.19 
 
 		 388 aa  77.4  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1203  major facilitator superfamily MFS_1  23.73 
 
 		 410 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  27.71 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1774  major facilitator superfamily MFS_1  27.63 
 
 		 430 aa  75.5  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6951  major facilitator superfamily MFS_1  29.91 
 
 		 436 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  25.32 
 
 		 399 aa  75.1  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  30.14 
 
 		 398 aa  75.1  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  24.26 
 
 		 402 aa  75.5  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  23.99 
 
 		 408 aa  73.6  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  26.1 
 
 		 428 aa  73.2  0.000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  23.46 
 
 		 404 aa  72  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2068  major facilitator transporter  32.12 
 
 		 395 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.731019  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2032  multidrug-efflux transporter quinolene resistance protein NorA  28.28 
 
 		 396 aa  70.9  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.810377 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 		 397 aa  71.2  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  31.95 
 
 		 397 aa  69.7  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  35.03 
 
 		 421 aa  69.3  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  27.27 
 
 		 394 aa  69.3  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1645  major facilitator superfamily permease  22.14 
 
 		 409 aa  69.3  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2577  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 		 395 aa  68.9  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363231  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  33.17 
 
 		 406 aa  67.8  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  23.9 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0973  major facilitator transporter  35.21 
 
 		 406 aa  67.4  0.0000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0924739  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  31.76 
 
 		 414 aa  67.8  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0266  tetracycline resistance protein  25.63 
 
 		 405 aa  67  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.968173  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  31.76 
 
 		 414 aa  67.4  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  31.13 
 
 		 416 aa  67  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 407 aa  66.6  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1917  major facilitator family transporter  25.88 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.405488  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2146  major facilitator superfamily MFS_1  27.88 
 
 		 438 aa  65.1  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1931  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 395 aa  63.9  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0709998  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2077  drug efflux system protein MdtG  23.53 
 
 		 408 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.894184 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  26.79 
 
 		 392 aa  63.9  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  21.88 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  29.24 
 
 		 405 aa  63.9  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  23.1 
 
 		 387 aa  63.5  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01049  predicted drug efflux system  23.53 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2593  major facilitator superfamily MFS_1  23.53 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.288035  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4248  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 452 aa  63.5  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.718043  unclonable  0.0000000000020202 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2547  drug efflux system protein MdtG  23.53 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0112458  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3850  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1174  drug efflux system protein MdtG  23.53 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.571838  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01057  hypothetical protein  23.53 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.276646  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0509  major facilitator superfamily permease  23.46 
 
 		 403 aa  63.2  0.000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 386 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3953  major facilitator transporter  24.18 
 
 		 431 aa  62.8  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.690116  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  25.42 
 
 		 407 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.58 
 
 		 392 aa  61.6  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  24 
 
 		 410 aa  62  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  21.8 
 
 		 406 aa  61.6  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  23.91 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0070  major facilitator transporter  32.94 
 
 		 438 aa  61.2  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  28.34 
 
 		 405 aa  61.2  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  25.98 
 
 		 416 aa  61.2  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 395 aa  60.8  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1926  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 396 aa  60.8  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6748  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 426 aa  60.5  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  27.5 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 		 408 aa  60.5  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0276  major facilitator superfamily MFS_1  27.57 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03040  putative MFS transporter  33.73 
 
 		 501 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479989  hitchhiker  0.0000743098 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1648  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0811808 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3022  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 472 aa  60.1  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.358015  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2249  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  30.19 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0638588  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0923  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 406 aa  59.7  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.311973  normal  0.133556 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3274  major facilitator superfamily MFS_1  26.06 
 
 		 454 aa  59.7  0.00000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2425  major facilitator transporter  23.14 
 
 		 458 aa  59.3  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1175  drug efflux system protein MdtG  23.75 
 
 		 409 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.504278  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0410  multidrug-efflux transporter  27.18 
 
 		 433 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  28.49 
 
 		 409 aa  58.5  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  22.35 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  29.7 
 
 		 401 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6108  major facilitator transporter  25.73 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0314  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 418 aa  58.9  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0010  multidrug-efflux transporter  27.32 
 
 		 430 aa  58.5  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0726  putative multidrug resistance protein  23.55 
 
 		 487 aa  58.2  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>