More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1551 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1551  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  100 
 
 		 263 aa  524  1e-148  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  58.02 
 
 		 263 aa  298  8e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  56.65 
 
 		 263 aa  291  9e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  55.73 
 
 		 263 aa  288  7e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  55.13 
 
 		 261 aa  288  7e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  56.65 
 
 		 263 aa  287  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  55.89 
 
 		 263 aa  286  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  59.13 
 
 		 262 aa  282  5.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.17 
 
 		 257 aa  275  4e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  56.92 
 
 		 260 aa  271  9e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  59.51 
 
 		 261 aa  269  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  53.36 
 
 		 263 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  53.36 
 
 		 263 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  53.36 
 
 		 263 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  53.36 
 
 		 263 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  53.36 
 
 		 263 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  53.36 
 
 		 263 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  53.36 
 
 		 263 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  52.61 
 
 		 263 aa  260  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  55.42 
 
 		 280 aa  258  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  57.03 
 
 		 263 aa  257  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0903  enoyl-CoA hydratase  58.73 
 
 		 276 aa  256  3e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  52.08 
 
 		 263 aa  252  4.0000000000000004e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  52.09 
 
 		 264 aa  251  6e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  58.57 
 
 		 263 aa  251  8.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  49.43 
 
 		 264 aa  245  4.9999999999999997e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  49.22 
 
 		 262 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0656  enoyl-CoA hydratase  54.33 
 
 		 262 aa  243  3e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  52.71 
 
 		 261 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.16 
 
 		 270 aa  238  5e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2261  enoyl-CoA hydratase  51.15 
 
 		 262 aa  238  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  51.54 
 
 		 262 aa  237  1e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.03 
 
 		 259 aa  235  4e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3078  enoyl-CoA hydratase  52.47 
 
 		 263 aa  234  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0533946 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2251  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  51.15 
 
 		 262 aa  232  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1481  enoyl-CoA hydratase  51.15 
 
 		 262 aa  232  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2564  enoyl-CoA hydratase  52.61 
 
 		 263 aa  228  8e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0541  enoyl-CoA hydratase  52.61 
 
 		 263 aa  228  8e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306395  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0468  enoyl-CoA hydratase  53.58 
 
 		 263 aa  227  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  54.2 
 
 		 266 aa  227  2e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3628  enoyl-CoA hydratase  52.61 
 
 		 263 aa  226  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00340574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2853  enoyl-CoA hydratase  53.21 
 
 		 263 aa  225  7e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00948295  normal  0.659081 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0513  enoyl-CoA hydratase  52.08 
 
 		 263 aa  224  8e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193795  normal  0.618251 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2863  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.69 
 
 		 257 aa  223  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  46.07 
 
 		 263 aa  222  4e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  49.43 
 
 		 261 aa  222  4e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0446  enoyl-CoA hydratase  52.45 
 
 		 263 aa  222  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3488  enoyl-CoA hydratase  53.96 
 
 		 263 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0585408  hitchhiker  0.000267739 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0471  enoyl-CoA hydratase  52.08 
 
 		 263 aa  219  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0802767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2691  enoyl-CoA hydratase  53.21 
 
 		 263 aa  218  7e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2750  enoyl-CoA hydratase  53.99 
 
 		 262 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00030401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.59 
 
 		 264 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1238  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.91 
 
 		 267 aa  215  7e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2873  enoyl-CoA hydratase  53.61 
 
 		 262 aa  214  8e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00237837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3115  enoyl-CoA hydratase  53.23 
 
 		 262 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000284376  normal  0.0714988 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0568  enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.34 
 
 		 260 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1674  enoyl-CoA hydratase  45.83 
 
 		 284 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.18 
 
 		 260 aa  211  9e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3363  enoyl-CoA hydratase  57.14 
 
 		 261 aa  210  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.62 
 
 		 265 aa  210  2e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0681  enoyl-CoA hydratase  51.71 
 
 		 263 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2749  enoyl-CoA hydratase  46.27 
 
 		 267 aa  208  8e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258906  normal  0.025664 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3015  enoyl-CoA hydratase  55.73 
 
 		 274 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.66 
 
 		 259 aa  207  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  38.49 
 
 		 265 aa  205  5e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1753  enoyl-CoA hydratase  49.05 
 
 		 258 aa  204  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.228549 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1130  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  46.39 
 
 		 259 aa  202  4e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2154  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  48.29 
 
 		 258 aa  202  5e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.182629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.28 
 
 		 273 aa  202  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0984  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  53.94 
 
 		 266 aa  202  6e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.540223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1171  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.81 
 
 		 258 aa  201  9e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.372212  normal  0.332854 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  46.39 
 
 		 260 aa  199  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  43.12 
 
 		 266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3979  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.05 
 
 		 256 aa  199  3.9999999999999996e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.776051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1292  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.29 
 
 		 258 aa  198  7e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.886446  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1958  enoyl-CoA hydratase  42.38 
 
 		 266 aa  194  9e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1862  enoyl-CoA hydratase  42.38 
 
 		 266 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0819441  normal  0.192366 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0629  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.53 
 
 		 265 aa  192  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.78613  normal  0.0668742 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.02 
 
 		 255 aa  192  3e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1758  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.11 
 
 		 263 aa  192  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.599113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2918  enoyl-CoA hydratase  42.7 
 
 		 264 aa  192  6e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1707  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.27 
 
 		 256 aa  191  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.349226  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3018  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.39 
 
 		 273 aa  191  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.66 
 
 		 267 aa  189  4e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.18 
 
 		 260 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8421  enoyl-CoA hydratase  48.65 
 
 		 261 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.629328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1911  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.23 
 
 		 270 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0903  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.54 
 
 		 270 aa  186  4e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.048792  normal  0.959739 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  40.07 
 
 		 260 aa  185  6e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2405  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.9 
 
 		 272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.777114 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  41.8 
 
 		 262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.47 
 
 		 260 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.163737  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19430  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  46.36 
 
 		 271 aa  181  8.000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0126218 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  43.7 
 
 		 269 aa  181  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.08 
 
 		 261 aa  181  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4359  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.61 
 
 		 268 aa  180  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1205  enoyl-CoA hydratase  44.32 
 
 		 264 aa  180  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.755368  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7538  enoyl-CoA hydratase  41.96 
 
 		 264 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0691  enoyl-CoA hydratase  41.48 
 
 		 270 aa  178  9e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  40.54 
 
 		 261 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>