More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6019 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012852  Rleg_6019  ABC transporter related  100 
 
 		 219 aa  435  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6284  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  65.6 
 
 		 218 aa  292  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3022  ABC transporter related  64.98 
 
 		 229 aa  279  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000385784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1542  ABC transporter, ATPase subunit  65.44 
 
 		 226 aa  259  2e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0193  ABC transporter related  65.44 
 
 		 226 aa  259  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.334053  normal  0.472012 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3354  predicted ATPase involved in cell division FtsE  61.01 
 
 		 218 aa  257  8e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.506202 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4396  ABC transporter related  59.45 
 
 		 255 aa  254  6e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.758539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3743  ABC transporter  59.17 
 
 		 222 aa  254  8e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.153359  normal  0.0240293 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1638  ABC transporter, ATP-binding protein  58.99 
 
 		 222 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0346  ABC transporter related  57.14 
 
 		 227 aa  252  3e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.11442  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0686  ABC transporter ATP-binding protein  59.17 
 
 		 229 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2553  ABC transporter related  58.8 
 
 		 218 aa  250  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5296  ABC transporter related  57.87 
 
 		 217 aa  247  9e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2670  ABC transporter, ATPase subunit  57.6 
 
 		 236 aa  246  3e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.983501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0257  ABC transporter related  58.33 
 
 		 222 aa  245  3e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4686  ABC transporter related  59.45 
 
 		 230 aa  238  5e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2171  ABC transporter related  55.56 
 
 		 221 aa  237  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.675184 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2028  ABC transporter related  55.09 
 
 		 221 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3735  ABC transporter ATP-binding protein  55.09 
 
 		 221 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0080  ABC transporter related  58.06 
 
 		 217 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2026  ABC transporter-like  55.56 
 
 		 217 aa  228  4e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1178  ABC transporter related  51.61 
 
 		 220 aa  217  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00268171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2955  ABC transporter, ATP-binding protein  48.17 
 
 		 250 aa  199  3e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.186741 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  43.78 
 
 		 226 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2023  ABC transporter, ATP-binding protein  48.85 
 
 		 223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.366076  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1777  ABC transporter related  48.17 
 
 		 231 aa  196  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1920  ABC transporter related  46.79 
 
 		 235 aa  192  4e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1393  ABC transporter related  44.7 
 
 		 230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0086  ABC transporter related  43.98 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1835  ABC transporter-related protein  49.1 
 
 		 227 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0817226  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1689  ABC transporter related protein  49.11 
 
 		 242 aa  188  5e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0942959 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3686  ABC transporter related  50.25 
 
 		 202 aa  188  5.999999999999999e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0833  ABC transporter related  45.16 
 
 		 236 aa  188  7e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3507  ABC transporter related  45.16 
 
 		 236 aa  188  7e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1920  ABC transporter related  49.1 
 
 		 227 aa  187  8e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0842487  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0868  ABC transporter related  44.7 
 
 		 236 aa  187  9e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0856  ABC transporter related  44.7 
 
 		 236 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1758  ABC transporter related  44.75 
 
 		 241 aa  186  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.101671 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5470  ABC transporter related  46.3 
 
 		 231 aa  186  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0589089  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4362  ABC transporter related  45.83 
 
 		 230 aa  186  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2458  ABC transporter related  48.34 
 
 		 225 aa  186  3e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0699  ABC transporter related  47.09 
 
 		 233 aa  186  3e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.664628  normal  0.709936 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3993  ABC transporter related  45.83 
 
 		 260 aa  186  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.622959 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1236  ABC transporter, ATP-binding protein  44.5 
 
 		 227 aa  185  4e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0708266  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1972  ABC transporter related  45.66 
 
 		 228 aa  185  4e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2043  ABC transporter, ATPase subunit  49.1 
 
 		 227 aa  185  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.062878  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0198  ABC transporter related  47 
 
 		 251 aa  185  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2114  ABC efflux transporter, ATPase subunit  45.16 
 
 		 229 aa  184  7e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  43.38 
 
 		 225 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2238  hypothetical protein  44.09 
 
 		 227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11004  adhesion ABC transporter ATP-binding protein  44.76 
 
 		 237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.7798e-57  normal  0.515996 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  41.94 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2435  ABC transporter related  44.91 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1578  ABC transporter ATP-binding protein  46.73 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0711118  normal  0.124176 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0627  ABC transporter related  43.58 
 
 		 222 aa  182  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  44.95 
 
 		 229 aa  182  3e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2317  ABC transporter ATP-binding protein  46.08 
 
 		 228 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0467206  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_004310  BR0086  ABC transporter, ATP-binding protein  44.55 
 
 		 242 aa  182  4.0000000000000006e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0857  ABC transporter, ATP-binding protein  45.41 
 
 		 223 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2288  ABC transporter, ATPase subunit  45.45 
 
 		 228 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.979484  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2270  ABC transporter related  45.66 
 
 		 234 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00112546  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0759  ABC transporter related  42.01 
 
 		 230 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0004925  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0084  ABC transporter, ATP-binding protein  44.55 
 
 		 242 aa  182  4.0000000000000006e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3452  ABC transporter related  46.08 
 
 		 228 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0356163  hitchhiker  0.0000197884 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2210  hypothetical protein  43.64 
 
 		 227 aa  182  5.0000000000000004e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003770  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  46.08 
 
 		 223 aa  182  5.0000000000000004e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1759  ABC transporter related  45.62 
 
 		 227 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432501  hitchhiker  0.0000000000939298 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1015  ABC transporter related  45.66 
 
 		 228 aa  181  6e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5301  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2017  ABC transporter related  46.61 
 
 		 234 aa  181  7e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000531605 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0570  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  47.91 
 
 		 228 aa  181  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.661781 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0553  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  47.91 
 
 		 228 aa  181  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00446  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  46.19 
 
 		 228 aa  181  8.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3115  ABC transporter related protein  46.19 
 
 		 228 aa  181  8.000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0573  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  46.19 
 
 		 228 aa  181  8.000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0544  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  46.19 
 
 		 228 aa  181  8.000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0599  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  46.19 
 
 		 228 aa  181  8.000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.962067 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1534  ABC transporter related  47.17 
 
 		 217 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.598778  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0534  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  46.19 
 
 		 228 aa  181  8.000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3121  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  46.19 
 
 		 228 aa  181  8.000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114112 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0430  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  46.19 
 
 		 228 aa  181  8.000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.811195  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00451  hypothetical protein  46.19 
 
 		 228 aa  181  8.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0560  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  47.91 
 
 		 228 aa  181  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0614  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  47.91 
 
 		 228 aa  180  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  44.95 
 
 		 245 aa  180  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02649  hypothetical protein  45.16 
 
 		 223 aa  181  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3651  ABC transporter component  47.26 
 
 		 237 aa  181  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2131  ABC transporter, ATP-binding protein  48.18 
 
 		 238 aa  180  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.152618  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2210  ABC transporter related protein  46.15 
 
 		 234 aa  181  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0388  putative ABC transporter, ATP-binding protein  45.62 
 
 		 235 aa  180  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  41.74 
 
 		 225 aa  180  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2730  ABC transporter related  45 
 
 		 225 aa  181  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  44.91 
 
 		 227 aa  180  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0555  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  47.91 
 
 		 228 aa  180  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1293  ABC transporter-related protein  47.39 
 
 		 235 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0186144  normal  0.521274 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  45.33 
 
 		 279 aa  180  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1217  ABC transporter, ATP-binding protein  47.27 
 
 		 238 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1450  ABC transporter, ATP-binding protein  47.27 
 
 		 238 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.100396  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0531  ABC transporter related  45.37 
 
 		 246 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3362  ABC transporter, ATP-binding protein  47.27 
 
 		 238 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793068  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1943  ABC transporter, ATP-binding protein  47.27 
 
 		 238 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>