More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5367 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5367  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 		 264 aa  530  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.35499 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4756  transcriptional regulator, DeoR family  77.19 
 
 		 264 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.275318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  35.43 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  35.95 
 
 		 258 aa  142  6e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3701  transcriptional regulator, DeoR family  34.48 
 
 		 269 aa  139  6e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  31.6 
 
 		 254 aa  138  7e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3534  transcriptional regulator, DeoR family  33.47 
 
 		 257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.2 
 
 		 269 aa  137  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.557659 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  33.6 
 
 		 269 aa  135  8e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  33.6 
 
 		 269 aa  135  8e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.6 
 
 		 269 aa  135  8e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.6 
 
 		 269 aa  135  8e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.6 
 
 		 269 aa  135  8e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.6 
 
 		 269 aa  135  8e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  33.6 
 
 		 269 aa  135  8e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  38.22 
 
 		 256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.2 
 
 		 269 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 266 aa  132  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0729  transcriptional regulator, DeoR family  36.4 
 
 		 256 aa  132  7.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103564 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0650  transcriptional regulator, DeoR family  33.77 
 
 		 276 aa  132  7.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  36.51 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0478  DeoR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 254 aa  130  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  38.43 
 
 		 266 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03769  predicted DNA-binding transcriptional regulator  37.75 
 
 		 261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.723341  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4102  transcriptional regulator, DeoR family  37.75 
 
 		 261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4269  DeoR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4407  DeoR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2385  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.6 
 
 		 269 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03718  hypothetical protein  37.75 
 
 		 261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.658927  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0693  transcriptional regulator, DeoR family  32.64 
 
 		 269 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.511847  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5331  transcriptional regulator, DeoR/GntR family  37.75 
 
 		 269 aa  129  6e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.464213 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 274 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4349  glycerol-3-phosphate regulon repressor  39.22 
 
 		 267 aa  128  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4303  glycerol-3-phosphate regulon repressor  39.22 
 
 		 267 aa  128  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.922526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4236  glycerol-3-phosphate regulon repressor  39.22 
 
 		 267 aa  128  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.627699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4258  glycerol-3-phosphate regulon repressor  39.22 
 
 		 267 aa  128  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4414  glycerol-3-phosphate regulon repressor  39.22 
 
 		 267 aa  128  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4141  DeoR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.767927 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4348  transcriptional regulator, DeoR/GntR family  38.39 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4102  DeoR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  32.94 
 
 		 253 aa  126  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  36.89 
 
 		 257 aa  126  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1101  transcriptional regulator, DeoR family  35.78 
 
 		 257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 254 aa  125  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3115  DeoR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 252 aa  125  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189997  hitchhiker  0.000781627 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1265  DeoR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 285 aa  125  7e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.940164  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0179  DeoR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0188  DeoR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.333156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0183  DeoR-family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.341023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0196  DeoR-family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.841984  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  33.61 
 
 		 258 aa  124  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 258 aa  124  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0180  DeoR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.214924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  33.61 
 
 		 258 aa  124  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5910  transcriptional regulator, DeoR family  35.32 
 
 		 254 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.874866 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 		 254 aa  124  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2030  DeoR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 258 aa  124  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1034  DeoR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 268 aa  124  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.631262  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  32 
 
 		 256 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 258 aa  123  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0631  glycerol-3-phosphate regulon repressor  35.29 
 
 		 257 aa  123  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2235  DeoR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 259 aa  122  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.859699  normal  0.0514044 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  34.63 
 
 		 258 aa  121  9e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 251 aa  121  9e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02550  hypothetical protein  34.04 
 
 		 265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02585  predicted DNA-binding transcriptional regulator  34.04 
 
 		 265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0953  transcriptional regulator, DeoR family  34.04 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2210  DeoR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3139  transcriptional regulator, DeoR family  34.04 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3738  DeoR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.387174  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  32.6 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2651  transcriptional regulator, DeoR family  32.89 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3172  transcriptional regulator, DeoR family  35.91 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.465579 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2873  DeoR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0977  DeoR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.96922  normal  0.682272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  31.47 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3032  DeoR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 267 aa  120  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3382  DeoR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 263 aa  119  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0722  DeoR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 253 aa  120  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0738  regulatory protein DeoR  30.53 
 
 		 253 aa  120  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3507  regulatory protein DeoR  32.8 
 
 		 254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  34.17 
 
 		 262 aa  119  4.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0566  DeoR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 248 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4905  transcriptional regulator, DeoR family  34.5 
 
 		 289 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.23552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0552  transcription repressor of fructose operon fruR  30.84 
 
 		 248 aa  119  6e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0922  DeoR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 251 aa  118  7.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.519346  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  33.07 
 
 		 282 aa  118  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  32.64 
 
 		 248 aa  118  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1048  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1059  transcriptional regulator, DeoR family  34.87 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0079  putative transcriptional regulator IolR  27.2 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4973  transcriptional regulator, DeoR family  35.83 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0890746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1449  DeoR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  30.71 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0357  DeoR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 252 aa  116  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.912716  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0289  DeoR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 261 aa  116  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.228369 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>