More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4940 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_4940  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
484 aa  991    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  26.27 
 
 
449 aa  141  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1262  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 
424 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00529057  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  27.74 
 
 
422 aa  113  7.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  27.51 
 
 
422 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  27.29 
 
 
422 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0547  ABC-type sugar / sn-glycerol 3-phosphate transport protein  26.76 
 
 
447 aa  107  6e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2058  extracellular solute-binding protein family 1  25.28 
 
 
435 aa  105  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.617385 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4845  extracellular solute-binding protein  25.87 
 
 
434 aa  104  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.834917  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2870  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 
447 aa  103  8e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0915  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  24.45 
 
 
443 aa  102  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.779259 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0158  extracellular solute-binding protein family 1  26.29 
 
 
435 aa  101  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.317406 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1711  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 
450 aa  100  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.827618 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  26.13 
 
 
431 aa  100  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3567  ABC transporter substrate binding protein (sorbitol)  24.04 
 
 
439 aa  99.8  9e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3348  extracellular solute-binding protein family 1  23.35 
 
 
443 aa  99.8  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0459  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 
436 aa  98.6  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.420805  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5638  extracellular solute-binding protein family 1  24.66 
 
 
443 aa  97.8  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3999  extracellular solute-binding protein family 1  24.86 
 
 
452 aa  97.4  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220113  normal  0.250177 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0091  ABC sorbitol/mannitol transporter, periplasmic binding protein  23.71 
 
 
436 aa  97.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.126585  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0974  extracellular solute-binding protein family 1  22.69 
 
 
435 aa  97.4  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606433  normal  0.163223 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  25.91 
 
 
428 aa  97.1  7e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4181  extracellular solute-binding protein  24.61 
 
 
435 aa  97.1  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000770865  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1727  extracellular solute-binding protein  23.71 
 
 
436 aa  96.7  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5309  extracellular solute-binding protein family 1  23.11 
 
 
447 aa  95.9  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574903  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2821  extracellular solute-binding protein  24.31 
 
 
428 aa  95.1  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.858803  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0431  extracellular solute-binding protein  23.5 
 
 
435 aa  95.5  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1108  extracellular solute-binding protein family 1  25.11 
 
 
436 aa  95.5  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.633554  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3450  extracellular solute-binding protein family 1  22.98 
 
 
436 aa  95.9  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0889  extracellular solute-binding protein  25.66 
 
 
435 aa  94.7  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2610  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
477 aa  94.7  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  23.67 
 
 
419 aa  94.7  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2358  extracellular solute-binding protein  22.81 
 
 
441 aa  94.7  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3854  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 
439 aa  94.4  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4978  extracellular solute-binding protein family 1  24.08 
 
 
437 aa  93.2  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.346425  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4116  extracellular solute-binding protein  22.8 
 
 
447 aa  93.2  9e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000719407  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2463  extracellular solute-binding protein  23.66 
 
 
437 aa  93.2  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1094  extracellular solute-binding protein  24.09 
 
 
439 aa  92.8  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.962008  normal  0.028756 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0303  extracellular solute-binding protein family 1  24.77 
 
 
478 aa  92.8  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3752  extracellular solute-binding protein family 1  22.77 
 
 
436 aa  91.7  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1681  extracellular solute-binding protein  22.64 
 
 
436 aa  91.3  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.901925  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0699  extracellular solute-binding protein  23.14 
 
 
443 aa  90.9  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  22.14 
 
 
440 aa  90.9  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3683  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 
432 aa  90.1  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0633  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 
436 aa  90.1  8e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6371  extracellular solute-binding protein  24.59 
 
 
443 aa  90.1  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.970426 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2511  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 
441 aa  90.1  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0464819  normal  0.359234 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2643  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 
441 aa  90.1  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0222782  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3246  extracellular solute-binding protein family 1  26.46 
 
 
440 aa  89.7  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00178427  normal  0.716937 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1985  extracellular solute-binding protein  26.65 
 
 
441 aa  89.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0378619  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2595  extracellular solute-binding protein  26.65 
 
 
441 aa  89.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13364  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2619  extracellular solute-binding protein  26.65 
 
 
441 aa  89.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.925096  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1179  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  27.01 
 
 
423 aa  89  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0916647  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0258  extracellular solute-binding protein family 1  23.57 
 
 
477 aa  89  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5738  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.68 
 
 
452 aa  89  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599702  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1073  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.63 
 
 
399 aa  88.2  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1390  extracellular solute-binding protein  23.79 
 
 
444 aa  87.8  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00129811  normal  0.103249 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4078  extracellular solute-binding protein family 1  23.52 
 
 
474 aa  87.8  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.305211  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5926  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.59 
 
 
441 aa  87.4  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.517551  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0720  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.62 
 
 
440 aa  86.7  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000241977  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3584  hypothetical protein  22.69 
 
 
484 aa  87  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.638591  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2064  extracellular solute-binding protein  25.8 
 
 
449 aa  86.7  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0548204 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0702  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 
440 aa  86.7  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.812706  normal  0.378032 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0287  extracellular solute-binding protein family 1  23.2 
 
 
477 aa  86.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.635572  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  20.83 
 
 
415 aa  86.3  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0333  maltose/mannitol ABC transporter, periplasmic maltose/mannitol-binding protein, putative  25.15 
 
 
442 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00410857  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1034  extracellular solute-binding protein  25.15 
 
 
442 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0230  putative transporter periplasmic binding protein  24.88 
 
 
426 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2796  extracellular solute-binding protein family 1  24.17 
 
 
468 aa  85.9  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3777  extracellular solute-binding protein  23.21 
 
 
436 aa  85.5  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.253936  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3793  extracellular solute-binding protein  23.21 
 
 
437 aa  85.5  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.8374  normal  0.742912 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0079  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  25.15 
 
 
442 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0065  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.88 
 
 
426 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0631  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  25.15 
 
 
442 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0490  extracellular solute-binding protein  24.41 
 
 
440 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000283806  hitchhiker  0.00214005 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0354  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.88 
 
 
426 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.824168  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2465  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  25.15 
 
 
442 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0872  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  25.15 
 
 
442 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0876  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  25.15 
 
 
442 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0755942  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1650  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.88 
 
 
426 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.572617  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1232  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.88 
 
 
426 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.715088  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3459  extracellular solute-binding protein family 1  24.38 
 
 
458 aa  84.7  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.725469  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1739  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.63 
 
 
426 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  26.04 
 
 
428 aa  83.2  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03340  extracellular solute-binding protein family 1  21.74 
 
 
439 aa  83.2  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 
455 aa  82.8  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2144  sugar-binding periplasmic signal peptide protein  26.87 
 
 
441 aa  82.4  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000125903  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3065  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.17 
 
 
421 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 
428 aa  82.4  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2286  extracellular solute-binding protein family 1  23.23 
 
 
484 aa  81.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.322369 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0695  mannitol ABC transporter, periplasmic mannitol-binding protein  25.14 
 
 
441 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0305  extracellular solute-binding protein  22.55 
 
 
428 aa  81.3  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.937006  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6665  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 
423 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99524  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0804  extracellular solute-binding protein  23.64 
 
 
434 aa  80.9  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.793174  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2902  extracellular solute-binding protein  23.25 
 
 
439 aa  80.5  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.489617 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  26.02 
 
 
411 aa  80.5  0.00000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5596  extracellular solute-binding protein  24.09 
 
 
436 aa  80.5  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.198436  normal  0.412169 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27400  periplasmic mannitol-binding protein of mannitol ABC transporter  23.48 
 
 
438 aa  80.5  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4357  extracellular solute-binding protein  24.5 
 
 
455 aa  80.5  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4443  extracellular solute-binding protein  24.5 
 
 
455 aa  80.5  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0226595 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>