231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3154 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3154  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 392 aa  782    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.358247 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2890  FAD dependent oxidoreductase  83.16 
 
 		 392 aa  621  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0610119 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3358  oxidoreductase  59.49 
 
 		 417 aa  425  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4487  FAD dependent oxidoreductase  56.8 
 
 		 376 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0139  FAD dependent oxidoreductase  39.13 
 
 		 348 aa  213  3.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.297271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0146  FAD dependent oxidoreductase  37.4 
 
 		 346 aa  187  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00168666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2540  FAD dependent oxidoreductase  37.23 
 
 		 353 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0170113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0880  oxidoreductase  37.23 
 
 		 353 aa  184  3e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0153  FAD dependent oxidoreductase  41.55 
 
 		 352 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2335  FAD dependent oxidoreductase  39.08 
 
 		 338 aa  179  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0387808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0141  FAD dependent oxidoreductase  37.77 
 
 		 353 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0136  FAD dependent oxidoreductase  27.97 
 
 		 361 aa  104  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2172  FAD dependent oxidoreductase  26.99 
 
 		 380 aa  96.7  6e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  28.33 
 
 		 378 aa  93.2  7e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  29.17 
 
 		 368 aa  91.3  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  28.38 
 
 		 376 aa  90.5  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  30.79 
 
 		 361 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  26.94 
 
 		 367 aa  82.8  0.000000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  27.3 
 
 		 374 aa  82  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  28.77 
 
 		 375 aa  81.3  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  34.62 
 
 		 365 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  34.13 
 
 		 365 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1624  FAD dependent oxidoreductase  27.47 
 
 		 363 aa  78.6  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.909673  hitchhiker  0.0000164974 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1956  oxidoreductase, FAD-binding  27.47 
 
 		 363 aa  78.6  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.034563  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  25.83 
 
 		 372 aa  74.7  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  28.02 
 
 		 363 aa  74.7  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  35.05 
 
 		 365 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0721  FAD dependent oxidoreductase  35.29 
 
 		 367 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0817  oxidoreductase, FAD-binding protein  33.33 
 
 		 367 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4841  FAD dependent oxidoreductase  34.93 
 
 		 366 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.388467  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4550  glycine oxidase ThiO  35.23 
 
 		 365 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  32.95 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  20.8 
 
 		 428 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  25.69 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  25.69 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  27.08 
 
 		 378 aa  66.2  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  34.12 
 
 		 364 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  24.52 
 
 		 369 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  25.69 
 
 		 369 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  25.69 
 
 		 369 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  24.79 
 
 		 369 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  28.53 
 
 		 382 aa  65.1  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  25.48 
 
 		 369 aa  64.7  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  26.93 
 
 		 405 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10140  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  27.34 
 
 		 371 aa  63.5  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.502087 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  25.14 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  24.52 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3234  glycine oxidase ThiO  27.05 
 
 		 372 aa  63.5  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  36.88 
 
 		 404 aa  62.8  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  25.48 
 
 		 369 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  29.08 
 
 		 375 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3170  FAD dependent oxidoreductase  28.22 
 
 		 477 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540221 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1783  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 		 381 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.359042  normal  0.766074 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  23.71 
 
 		 369 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  37.27 
 
 		 398 aa  57.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  35.62 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3417  FAD dependent oxidoreductase  35.65 
 
 		 471 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000555141  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2489  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  23.92 
 
 		 371 aa  57.8  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000926626  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0969  FAD dependent oxidoreductase  22.06 
 
 		 434 aa  57.4  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  28.32 
 
 		 385 aa  57.4  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  31.76 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2529  DadA family oxidoreductase  23.63 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0933493  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2715  DadA family oxidoreductase  23.63 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2728  oxidoreductase, DadA family  23.63 
 
 		 371 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000981681 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2454  D-amino acid dehydrogenase small subunit  23.92 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295637  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  31.78 
 
 		 360 aa  56.6  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2732  oxidoreductase, DadA family  23.63 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2569  oxidoreductase, DadA family  23.63 
 
 		 371 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0599885 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  27.32 
 
 		 372 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2777  oxidoreductase, DadA family  23.34 
 
 		 371 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.848486  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2464  FAD dependent oxidoreductase  35.94 
 
 		 338 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.750874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1415  glycine oxidase ThiO  28.77 
 
 		 377 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31544  predicted protein  30.67 
 
 		 1033 aa  55.1  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2891  FAD dependent oxidoreductase  31.75 
 
 		 443 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2483  glycine oxidase ThiO  27.86 
 
 		 385 aa  54.3  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0717  D-amino acid oxidase family protein  25.98 
 
 		 428 aa  54.3  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  25.2 
 
 		 411 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3075  FAD dependent oxidoreductase  23.87 
 
 		 425 aa  54.7  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.769709  normal  0.0446875 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  25.7 
 
 		 428 aa  53.9  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  26.5 
 
 		 379 aa  54.3  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4343  FAD dependent oxidoreductase  33.89 
 
 		 375 aa  53.9  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290425  normal  0.660783 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2752  sarcosine oxidase beta subunit family protein  27.5 
 
 		 417 aa  53.5  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0860  FAD dependent oxidoreductase  21.97 
 
 		 471 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2742  DadA family oxidoreductase  23.34 
 
 		 371 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00153462  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  27.57 
 
 		 391 aa  53.1  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3991  sarcosine oxidase, beta subunit family  27.14 
 
 		 417 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2861  FAD dependent oxidoreductase  31.75 
 
 		 468 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8584  sarcosine oxidase, beta subunit family  27.75 
 
 		 417 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.738598  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7089  FAD dependent oxidoreductase  27.76 
 
 		 459 aa  53.1  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10152 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2905  FAD dependent oxidoreductase  31.75 
 
 		 468 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0519998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  29.31 
 
 		 371 aa  52.8  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  26.75 
 
 		 385 aa  52.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0775  putative FAD dependent oxidoreductase  24.4 
 
 		 425 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.476626 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2715  oxidoreductase, FAD-binding  28.26 
 
 		 361 aa  52.4  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725073  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2891  glycine oxidase ThiO  32.68 
 
 		 338 aa  51.6  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.894969  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4885  glycine oxidase ThiO  33.09 
 
 		 384 aa  51.6  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  24.8 
 
 		 435 aa  52  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3428  glycine oxidase ThiO  28.57 
 
 		 369 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4031  sarcosine oxidase, beta subunit family  27.14 
 
 		 417 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0964  glycine oxidase ThiO  34.38 
 
 		 373 aa  51.2  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>