More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2703 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2703  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 296 aa  595  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2432  LysR family transcriptional regulator  81.97 
 
 		 296 aa  494  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3347  hypothetical protein  74.58 
 
 		 296 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.244923 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0991  LysR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 302 aa  156  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0795  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.66 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1114  putative transcriptional regulator  35.1 
 
 		 301 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12140  putative transcriptional regulator  34.15 
 
 		 297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1845  LysR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 303 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4649  transcriptional activator  34.43 
 
 		 282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12309  normal  0.140815 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0877  transcriptional regulator, LysR family  32.67 
 
 		 287 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.672229  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4825  transcriptional regulator, LysR family  30.66 
 
 		 293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0864247  normal  0.0253512 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1838  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.8381  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0818  transcriptional regulator, LysR family  30.83 
 
 		 280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0971009  normal  0.428032 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1273  transcriptional regulator, LysR family  30.39 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0230632  normal  0.266535 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0087  LysR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3618  transcriptional regulator, LysR family  31.27 
 
 		 284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3319  transcriptional regulator, LysR family  30.14 
 
 		 284 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.914032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3244  transcriptional regulator, LysR family  32.73 
 
 		 280 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.386133  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0804  LysR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 288 aa  112  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0513022 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4450  LysR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 283 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2477  LysR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 290 aa  112  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4590  LysR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 318 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3363  LysR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1431  LysR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5004  LysR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.492991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2757  LysR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.486201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5283  LysR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2962  LysR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.710612 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2824  LysR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 306 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1974  transcriptional regulator, LysR family  32.74 
 
 		 281 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.601585  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3829  LysR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.19019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1479  LysR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0277632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2531  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0607  transcriptional regulator, LysR family  29.39 
 
 		 298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0160  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 291 aa  110  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2045  transcriptional regulator, LysR family  30.94 
 
 		 285 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000182672 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2046  LysR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 287 aa  109  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396353  normal  0.96684 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1284  LysR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 283 aa  109  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32576  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0683  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 283 aa  109  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2019  LysR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 285 aa  109  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2402  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 298 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114186  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0405  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2354  LysR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 288 aa  108  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0615  transcription regulator protein  31.87 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.528971 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0765  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 322 aa  107  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3079  LysR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 345 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4358  transcriptional regulator, LysR family  32.63 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261709  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4935  LysR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 285 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.929926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2713  LysR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 281 aa  106  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0696841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0666  LysR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 294 aa  106  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.659834  normal  0.452137 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0384  LysR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 316 aa  106  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26470  LysR family transcriptional regulator protein  34.18 
 
 		 317 aa  106  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0106  LysR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 283 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4134  LysR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 291 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.949354 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0800  LysR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 298 aa  106  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4785  LysR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 291 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2662  LysR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 307 aa  106  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27280  LysR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 284 aa  106  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3382  LysR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 291 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0438  transcriptional regulator, LysR family  29.3 
 
 		 322 aa  106  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1269  LysR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 291 aa  106  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0299945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3317  LysR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 291 aa  106  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.176434 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2882  LysR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 315 aa  106  6e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.241105  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5162  LysR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 291 aa  106  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2995  LysR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 321 aa  105  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1817  LysR-family transcriptional regulatory protein  28.11 
 
 		 309 aa  105  8e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1452  transcriptional regulator LrhA  28.11 
 
 		 309 aa  105  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0717  transcriptional regulator, LysR family  32.79 
 
 		 292 aa  105  8e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5203  LysR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 291 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.715781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2309  putative transcriptional regulator  29.75 
 
 		 284 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0482  transcriptional regulator, LysR family  29.3 
 
 		 322 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2821  LysR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 291 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2002  transcriptional regulator, LysR family  32.08 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4357  transcriptional regulator, LysR family  30.72 
 
 		 283 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1559  LysR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 310 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.30474  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5091  LysR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0219442 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3993  LysR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1319  transcriptional regulator, LysR family  32.5 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.131151 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4068  LysR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 292 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2512  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 278 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0095  LysR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 291 aa  103  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5053  transcriptional regulator, LysR family  29.25 
 
 		 295 aa  103  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.426603  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1683  LysR substrate-binding  31.74 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1220  transcriptional regulator, LysR family  25.87 
 
 		 289 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.286254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5814  LysR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.282606 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0996  LysR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.257819  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2980  LysR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 311 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0695506  normal  0.804372 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1461  transcriptional regulator, LysR family  30.39 
 
 		 301 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1003  LysR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 298 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1961  LysR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 298 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0525  LysR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 316 aa  103  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1157  LysR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 298 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3803  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 285 aa  103  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180645 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3081  LysR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 323 aa  103  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0276  LysR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 298 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000191888  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0953  LysR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 298 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0872  LysR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 298 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1230  LysR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 284 aa  102  6e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.69463  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2674  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 294 aa  102  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4883  transcriptional regulator, LysR family  32.02 
 
 		 301 aa  102  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>