More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2458 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2458  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 138 aa  283  8e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2175  NUDIX hydrolase  73.68 
 
 		 133 aa  200  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.523963 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0504  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 		 101 aa  96.7  9e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163605  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5041  NUDIX hydrolase  36.52 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.216707 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0592  hypothetical protein  36.09 
 
 		 316 aa  74.7  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5556  NUDIX hydrolase  41.44 
 
 		 130 aa  72  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.239043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4458  NUDIX hydrolase  40.8 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  36.61 
 
 		 319 aa  64.7  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0830  NUDIX hydrolase  35.88 
 
 		 291 aa  64.7  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2650  hypothetical protein  37.61 
 
 		 315 aa  61.6  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3209  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3115  NUDIX hydrolase  39.09 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  33.65 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  37.12 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0325  NUDIX hydrolase  38.52 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.849393  normal  0.626146 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  33.04 
 
 		 318 aa  60.1  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  34.31 
 
 		 302 aa  60.1  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3770  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.96 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1687  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.41 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  29.63 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4321  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0575  MutT/nudix family protein  34.26 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  31.06 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  33.33 
 
 		 325 aa  58.2  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5598  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  34.81 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3006  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  34.38 
 
 		 329 aa  57.4  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  34.38 
 
 		 329 aa  57.4  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.21 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30.97 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4152  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641206  decreased coverage  0.0000968848 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1194  NUDIX hydrolase  35.19 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317663  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2831  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  37.61 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0396301  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2605  mutator MutT protein  31.48 
 
 		 128 aa  57  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.402694  hitchhiker  0.00000000101323 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4229  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 150 aa  57  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0351267  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  35.63 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  36.7 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  35.63 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  38.18 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1106  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000361121  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4976  NUDIX hydrolase  30.5 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  34.62 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  32.59 
 
 		 570 aa  55.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3657  NUDIX hydrolase  37.89 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279088  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1931  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000285208  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  34.62 
 
 		 314 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0101  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.97 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708829  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1038  NUDIX hydrolase  35.78 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.38743 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30.91 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0996  NUDIX hydrolase  35.78 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30.91 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0620  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3508  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30.91 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116101  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  36.46 
 
 		 314 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  39.76 
 
 		 312 aa  55.1  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  34.62 
 
 		 321 aa  55.1  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  32.11 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2463  NUDIX hydrolase  34.58 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.101073  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  34.62 
 
 		 314 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  30.56 
 
 		 473 aa  55.5  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3076  NUDIX hydrolase  39.58 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2293  mutator MutT protein  30.53 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.192428  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2654  NUDIX hydrolase  28.45 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1843  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30.09 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.910246  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2711  NUDIX hydrolase  39.58 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0762  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00100  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase, marked preference for dGTP  31.87 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.126012  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  45.61 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3501  mutator MutT protein  31.87 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00099  hypothetical protein  31.87 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.146865  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3558  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.87 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.016637  hitchhiker  0.00136766 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0831  NUDIX hydrolase  47.37 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.556383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0090  NUDIX hydrolase  37.89 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0542  NUDIX hydrolase  37.89 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184867  normal  0.118986 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0572  NUDIX hydrolase  37.89 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.546019  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0503  putative mutator mutt protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  37.11 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.213775 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  32.79 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0533  NUDIX hydrolase  31.73 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0228598  normal  0.521082 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0093  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.87 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000316081  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0799  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.544133  normal  0.428384 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1867  NUDIX hydrolase  38 
 
 		 183 aa  53.9  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2341  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  26.67 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000814495  normal  0.025223 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  35 
 
 		 316 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1977  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  26.67 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2086  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  26.67 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  35 
 
 		 316 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0105  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.87 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000458525  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  25.93 
 
 		 134 aa  53.5  0.0000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1564  Mutator protein MutT  25.93 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  26.15 
 
 		 131 aa  53.5  0.0000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2154  NUDIX hydrolase  28.99 
 
 		 206 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114898  hitchhiker  0.00867781 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0107  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.87 
 
 		 132 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000992989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1154  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271981  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  28.89 
 
 		 138 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  28.89 
 
 		 138 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0511972 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>