70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1259 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1259  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 295 aa  568  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.33673 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1110  protein of unknown function DUF6 transmembrane  72.95 
 
 		 293 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.815288  normal  0.766233 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0809  hypothetical protein  61.54 
 
 		 300 aa  341  7e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.817612 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2581  hypothetical protein  37.02 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0869086  normal  0.0298393 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1060  hypothetical protein  34.51 
 
 		 301 aa  124  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4912  membrane protein  32.88 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4489  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.45 
 
 		 301 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0464  membrane protein  34.15 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6434  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.27 
 
 		 301 aa  96.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443844 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0340  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.89 
 
 		 285 aa  92  9e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.129691  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2687  hypothetical protein  29.73 
 
 		 295 aa  90.5  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.42391  normal  0.0677006 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.69 
 
 		 282 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15861  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2506  hypothetical protein  27.94 
 
 		 337 aa  81.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2425  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.69 
 
 		 282 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.425846  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2394  hypothetical protein  30.04 
 
 		 281 aa  80.1  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.319154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1435  hypothetical protein  32.69 
 
 		 327 aa  80.1  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2032  hypothetical protein  25.85 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0029442  normal  0.0470657 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  28.17 
 
 		 307 aa  72  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2138  hypothetical protein  30.36 
 
 		 280 aa  65.1  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00025642  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  30.3 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04860  membrane protein  29.34 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.36 
 
 		 302 aa  55.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1917  hypothetical protein  26.09 
 
 		 297 aa  55.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.208195 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1705  hypothetical protein  26.76 
 
 		 305 aa  55.1  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1162  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 359 aa  51.6  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.902863 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1716  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.09 
 
 		 307 aa  50.1  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00280057  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.98 
 
 		 302 aa  49.7  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.66 
 
 		 300 aa  49.3  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0309  hypothetical protein  27.64 
 
 		 299 aa  48.9  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2761  hypothetical protein  33.94 
 
 		 316 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.79 
 
 		 302 aa  48.5  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0578  hypothetical protein  26.38 
 
 		 305 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.242573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2925  hypothetical protein  25.98 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0149695  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1024  ribosomal protein S6  29.79 
 
 		 293 aa  48.9  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2308  hypothetical protein  26.72 
 
 		 308 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2007  hypothetical protein  25.68 
 
 		 291 aa  48.9  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.28787  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1251  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.88 
 
 		 294 aa  47.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0738172  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3544  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.43 
 
 		 293 aa  48.1  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340303  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1947  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.11 
 
 		 298 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3390  hypothetical protein  26.94 
 
 		 302 aa  47.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2557  hypothetical protein  23.53 
 
 		 294 aa  47.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.209114  hitchhiker  0.00319477 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1520  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.77 
 
 		 295 aa  47  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00453579 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  25.34 
 
 		 308 aa  47  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.11 
 
 		 311 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  26.07 
 
 		 305 aa  46.6  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  24.27 
 
 		 303 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2973  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.13 
 
 		 325 aa  45.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2169  permease; drug/metabolite exporter family protein  27.5 
 
 		 294 aa  45.8  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101612  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0056  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.19 
 
 		 304 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2745  hypothetical protein  25.37 
 
 		 291 aa  45.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.097  normal  0.319975 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  23.46 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0312  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.97 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1531  hypothetical protein  22.9 
 
 		 267 aa  44.3  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0755616 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2208  permease; drug/metabolite exporter family protein  27 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749629  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2431  hypothetical protein  27 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.295627 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0543  hypothetical protein  27.93 
 
 		 271 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.530705 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  23.43 
 
 		 303 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  28.88 
 
 		 294 aa  44.3  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  23.85 
 
 		 303 aa  44.3  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2413  hypothetical protein  27 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2249  hypothetical protein  27 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00767545  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  24.37 
 
 		 292 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5204  hypothetical protein  35.11 
 
 		 325 aa  43.1  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0704393 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0873  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.12 
 
 		 305 aa  42.7  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0967  hypothetical protein  34.07 
 
 		 286 aa  42.7  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2511  protein of unknown function DUF6 transmembrane  18.72 
 
 		 290 aa  42.7  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000710736  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1001  hypothetical protein  34.07 
 
 		 307 aa  42.7  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  24.6 
 
 		 292 aa  42.7  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.87 
 
 		 302 aa  42.4  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0816  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.24 
 
 		 259 aa  42.4  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>