More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0959 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0959  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 219 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.783426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0839  transcriptional regulator, TetR family  92.54 
 
 		 203 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4262  TetR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 226 aa  198  6e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4047  TetR family transcriptional regulator  47.74 
 
 		 205 aa  185  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.866362  normal  0.450827 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6901  TetR family transcriptional regulator  47.74 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.165859 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2727  transcriptional regulator, TetR family  40.31 
 
 		 213 aa  122  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0989177  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3676  TetR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.508637  decreased coverage  0.00105541 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4123  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1076  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 206 aa  112  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3494  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 210 aa  111  9e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3254  TetR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 224 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0716  TetR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1072  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000136093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1144  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 206 aa  108  6e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00178929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2793  TetR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 214 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1186  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3182  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3326  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3183  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1253  transcriptional regulator, TetR family  34.8 
 
 		 210 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0477994 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0815  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 196 aa  105  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.642279  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1495  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000123966  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5165  transcriptional regulator, TetR family  36.41 
 
 		 194 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.707616 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2227  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 209 aa  102  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4399  transcriptional regulator, TetR family  34.54 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0178  TetR family transcriptional regulator  36.98 
 
 		 203 aa  100  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0120  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 227 aa  99.8  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.555065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 213 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3238  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 198 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210945  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 213 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1348  TetR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 217 aa  99  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.054525 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0960  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 219 aa  99  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.115896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3078  regulatory protein, TetR  29.74 
 
 		 203 aa  98.6  7e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.745436  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5597  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 198 aa  98.2  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2260  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 214 aa  98.2  8e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0561114  normal  0.813784 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1774  TetR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 207 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2386  TetR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 207 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5198  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 193 aa  96.7  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1617  TetR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 202 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0133761 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2298  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 219 aa  96.7  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 218 aa  95.9  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2431  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 204 aa  95.1  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.547738  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2295  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 204 aa  94.7  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3430  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 195 aa  94.7  9e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0716  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 215 aa  94.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0418191  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3330  transcriptional regulator, TetR family  34.54 
 
 		 219 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5712  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0620  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 210 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3140  TetR family transcriptional regulator  37 
 
 		 221 aa  92.8  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.263348  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26140  putative transcriptional regulator  35.06 
 
 		 196 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287141  normal  0.149256 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2545  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 194 aa  92  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0293  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 203 aa  91.7  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000668888 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2156  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 211 aa  92  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000133556 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0796  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 203 aa  91.7  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.091153  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3244  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 221 aa  90.9  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4065  transcriptional regulator, TetR family  38.59 
 
 		 195 aa  90.9  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1327  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128792 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1289  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1312  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000673566 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3137  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1972  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 211 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.134426  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1394  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 214 aa  90.1  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0481  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 211 aa  90.5  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1087  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 222 aa  90.1  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00014413  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3046  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 199 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5842  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 188 aa  89  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25935  normal  0.516433 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0900  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 193 aa  88.2  8e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308807  normal  0.448888 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4307  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 200 aa  88.2  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0504608 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3418  regulatory protein TetR  36.04 
 
 		 222 aa  88.2  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  0.510685 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1901  TetR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 201 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.665453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0385  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 219 aa  87.8  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.464521 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5345  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 198 aa  87.4  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.922777  normal  0.179588 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2906  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 205 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0722139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3093  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 201 aa  87  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0252517 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3305  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 195 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4180  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 204 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0804485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1874  putative regulatory protein  32.35 
 
 		 198 aa  86.7  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885441  normal  0.710734 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1626  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 211 aa  85.9  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3984  transcriptional regulator, TetR family protein  29.84 
 
 		 211 aa  85.9  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4357  regulatory protein TetR  34.01 
 
 		 201 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4319  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 207 aa  85.1  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0944  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 193 aa  84.7  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5542  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 194 aa  84.3  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.789571  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2955  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4571  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 199 aa  84.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0493  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 206 aa  84.7  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010676  Bphyt_5463  transcriptional regulator, TetR family  40.18 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008146  Mmcs_0833  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 182 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_3927  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.375374  normal  0.0268365 
 
 
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NC_008705  Mkms_0851  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 182 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.45674  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_8807  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009077  Mjls_0851  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 182 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.780744  normal  1 
 
 
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NC_010335  Caul_5116  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011894  Mnod_7468  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.23471  n/a   
 
 
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NC_007952  Bxe_B1146  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390773  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_3310  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0639272  normal  1 
 
 
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NC_010676  Bphyt_7235  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013132  Cpin_5500  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 190 aa  82  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161362  decreased coverage  0.000153945 
 
 
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