More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6207 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6207  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 390 aa  800    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287429  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6404  lytic transglycosylase catalytic  36.24 
 
 		 362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0649822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  32.88 
 
 		 228 aa  101  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9819  type IV system transglycosylase  34.86 
 
 		 362 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  42.74 
 
 		 222 aa  99.4  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  43.85 
 
 		 242 aa  97.8  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1332  Lytic transglycosylase catalytic  47.01 
 
 		 194 aa  97.8  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0695277  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  39.01 
 
 		 235 aa  93.6  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  47.79 
 
 		 202 aa  93.6  6e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  43.9 
 
 		 283 aa  92.8  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4176  lytic transglycosylase, catalytic  43.59 
 
 		 354 aa  92.8  9e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500833  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  42.86 
 
 		 216 aa  91.3  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  45.08 
 
 		 217 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4016  lytic transglycosylase, catalytic  37.5 
 
 		 239 aa  91.7  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0926261  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  42.74 
 
 		 243 aa  90.5  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0352  lytic transglycosylase  47.15 
 
 		 273 aa  90.5  5e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  36.43 
 
 		 233 aa  90.5  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  42.62 
 
 		 261 aa  90.1  6e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0393  lytic transglycosylase, catalytic  47.15 
 
 		 305 aa  90.1  6e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.168274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3860  lytic transglycosylase, catalytic  45.45 
 
 		 329 aa  90.1  7e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2008  transglycosylase SLT domain-containing protein  38.06 
 
 		 214 aa  88.6  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  40.94 
 
 		 207 aa  87.8  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  40.83 
 
 		 280 aa  87.8  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  45.53 
 
 		 211 aa  87.4  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0476  lytic transglycosylase, catalytic  38.06 
 
 		 256 aa  85.5  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6408  lytic transglycosylase catalytic  42.17 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  40.74 
 
 		 191 aa  85.1  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  38.36 
 
 		 196 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  38.1 
 
 		 202 aa  85.1  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4180  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 		 210 aa  85.1  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  43.97 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  46.23 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4378  lytic transglycosylase catalytic  40.48 
 
 		 251 aa  84  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  40.44 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3607  lytic transglycosylase, catalytic  42.86 
 
 		 326 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4205  Lytic transglycosylase catalytic  40.48 
 
 		 251 aa  84  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4244  lytic transglycosylase catalytic  40.48 
 
 		 251 aa  84  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2959  lytic transglycosylase catalytic  40.31 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4561  lytic transglycosylase catalytic  39.55 
 
 		 360 aa  83.2  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.000593543  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2441  lytic transglycosylase, catalytic  39.85 
 
 		 300 aa  82.4  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0168706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  40.98 
 
 		 245 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  35.2 
 
 		 202 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  37.14 
 
 		 209 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3830  lytic transglycosylase, catalytic  39.84 
 
 		 239 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.582426 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3923  lytic transglycosylase, catalytic  39.84 
 
 		 239 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  39.84 
 
 		 239 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3220  lytic transglycosylase, catalytic  35.36 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2357  lytic transglycosylase, catalytic  37.06 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500098  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0096  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  39.53 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1919  Lytic transglycosylase catalytic  39.42 
 
 		 199 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1380  Lytic transglycosylase catalytic  33.12 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033505 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4565  lytic transglycosylase catalytic  45.38 
 
 		 314 aa  80.5  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0155983  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2342  lytic transglycosylase, catalytic  36.69 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03735  putative soluble lytic murein transglycosylase  42.4 
 
 		 576 aa  80.1  0.00000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5361  lytic transglycosylase, catalytic  35.85 
 
 		 333 aa  79.7  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.716209 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3807  lytic transglycosylase, catalytic  41.67 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3738  Lytic transglycosylase catalytic  41.26 
 
 		 655 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0927783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  37.98 
 
 		 218 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  37.98 
 
 		 197 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  40.16 
 
 		 239 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3164  lytic transglycosylase, catalytic  35 
 
 		 284 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.611179  normal  0.205276 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1871  lytic transglycosylase, catalytic  41.07 
 
 		 281 aa  79.3  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000100876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1200  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 279 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  42.59 
 
 		 368 aa  79.3  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  36.18 
 
 		 196 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  35.88 
 
 		 188 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  42.06 
 
 		 657 aa  78.6  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1866  lytic transglycosylase, catalytic  37.41 
 
 		 664 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  40.98 
 
 		 237 aa  79  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3631  Lytic transglycosylase catalytic  36.43 
 
 		 209 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0198  transglycosylase  41.26 
 
 		 655 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  42.28 
 
 		 678 aa  78.2  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  41.03 
 
 		 244 aa  78.2  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3705  Lytic transglycosylase catalytic  36.43 
 
 		 209 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  42.06 
 
 		 657 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0748  lytic transglycosylase, catalytic  38.84 
 
 		 146 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00376609  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0011  putative soluble lytic murein transglycosylase  38.81 
 
 		 643 aa  78.2  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.868574  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  39.82 
 
 		 198 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00442  soluble lytic murein transglycosylase  41.54 
 
 		 328 aa  77.4  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0367  lytic transglycosylase, catalytic  36.29 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  41.88 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3687  lytic transglycosylase, catalytic  37.23 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  37.9 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2520  lytic transglycosylase, catalytic  37.04 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2611  lytic transglycosylase catalytic  38.97 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.59616 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1424  lytic transglycosylase, catalytic  37.3 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0284128  normal  0.0259883 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  37.98 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  40.18 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  38.1 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  36.59 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  38.33 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1881  lytic transglycosylase catalytic  42.98 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.520099  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1946  soluble lytic murein transglycosylase precursor  42.98 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378225  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  39.29 
 
 		 282 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1911  soluble lytic murein transglycosylase  38.12 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0241391  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9824  type IV system transglycosylase  43.65 
 
 		 322 aa  76.3  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0306  lytic transglycosylase, catalytic  37.35 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  38.57 
 
 		 203 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>