More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4838 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4838  ABC transporter related  100 
 
 
260 aa  533  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.322693  normal  0.0389371 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6258  ABC transporter related  65.74 
 
 
257 aa  355  3.9999999999999996e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000084841  normal  0.418068 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5261  ABC transporter related  59.2 
 
 
279 aa  314  9e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3232  ABC transporter related  59.2 
 
 
279 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.611643 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4584  ABC transporter related  61.04 
 
 
255 aa  300  2e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394882  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  52.99 
 
 
258 aa  264  1e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  52.19 
 
 
259 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  52.21 
 
 
252 aa  262  4.999999999999999e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  53.49 
 
 
249 aa  261  1e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  51.38 
 
 
267 aa  259  3e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5811  ABC transporter related  51.98 
 
 
268 aa  259  3e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.306389  normal  0.349168 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24330  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.97 
 
 
273 aa  258  6e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0478381  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  54.44 
 
 
246 aa  258  7e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  50.39 
 
 
254 aa  257  1e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  50.97 
 
 
256 aa  257  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  52.8 
 
 
244 aa  257  1e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  51.76 
 
 
262 aa  256  3e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3147  ABC transporter related  50.8 
 
 
247 aa  256  3e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.383516  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  53.25 
 
 
242 aa  254  9e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  51.59 
 
 
242 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  50 
 
 
252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2851  ABC transporter related  52.02 
 
 
257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0959  ABC transporter related  51.81 
 
 
260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  49.19 
 
 
240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  53.12 
 
 
257 aa  252  4.0000000000000004e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  54.4 
 
 
257 aa  252  4.0000000000000004e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  52.99 
 
 
259 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1152  ABC transporter related  51.2 
 
 
252 aa  251  6e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  52.8 
 
 
244 aa  251  7e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2175  ABC transporter related  50.2 
 
 
260 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.240046  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0468  ABC transporter related  52.42 
 
 
240 aa  251  8.000000000000001e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3597  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.2 
 
 
260 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.345291  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1467  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein, GlnQ putative  51.41 
 
 
246 aa  251  9.000000000000001e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2319  ABC transporter related  49.4 
 
 
260 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328452  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  49.4 
 
 
256 aa  250  1e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3208  ABC transporter-related protein  50.2 
 
 
261 aa  250  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  50.4 
 
 
240 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  52.4 
 
 
249 aa  249  2e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  49.6 
 
 
248 aa  250  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  50.4 
 
 
241 aa  249  3e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  48.63 
 
 
253 aa  249  3e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  53.23 
 
 
241 aa  249  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0280  ABC transporter related  49.41 
 
 
261 aa  249  4e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  52.23 
 
 
253 aa  249  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0749  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  48.02 
 
 
282 aa  249  4e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000330465  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  51.41 
 
 
253 aa  248  5e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  47.79 
 
 
242 aa  248  5e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  51.15 
 
 
260 aa  248  5e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  50.59 
 
 
257 aa  248  9e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0210  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.22 
 
 
248 aa  247  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.770881  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  51.2 
 
 
244 aa  247  1e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2223  amino acid permease ATP-binding protein  49.4 
 
 
251 aa  247  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0257  ATP-binding protein  51.22 
 
 
248 aa  247  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000197314 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  50 
 
 
244 aa  247  1e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1462  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  50.81 
 
 
246 aa  247  1e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.837039  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2139  ABC transporter-related protein  50 
 
 
251 aa  246  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4158  ABC transporter related  52.24 
 
 
254 aa  246  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  49.4 
 
 
242 aa  246  3e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  50 
 
 
241 aa  246  3e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  50 
 
 
241 aa  246  3e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  50.99 
 
 
260 aa  246  3e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.4 
 
 
244 aa  246  4e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
241 aa  246  4e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2606  ABC transporter related  50.4 
 
 
254 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.442816  normal  0.0103017 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2806  ABC transporter related protein  49 
 
 
247 aa  246  4e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.237976 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  51.61 
 
 
241 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3136  ABC transporter related  53.04 
 
 
269 aa  245  6e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2389  ABC transporter related  48.83 
 
 
266 aa  245  6e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  50 
 
 
241 aa  245  6e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  49.6 
 
 
241 aa  244  6.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  50 
 
 
241 aa  244  8e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2812  ABC transporter related  49 
 
 
260 aa  244  8e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.844738  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.4 
 
 
240 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2796  ABC transporter related  49.61 
 
 
266 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0227  ABC transporter-like  47.81 
 
 
265 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244915  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  50.4 
 
 
240 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  49.6 
 
 
241 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  49.6 
 
 
241 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.39 
 
 
240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.39 
 
 
240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  49.4 
 
 
245 aa  243  1.9999999999999999e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  50.2 
 
 
252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  48.46 
 
 
254 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3170  hypothetical protein  49.41 
 
 
261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1125  ABC transporter-like protein  48.05 
 
 
250 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.168368 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.01 
 
 
251 aa  243  3e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  48.41 
 
 
244 aa  243  3e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  48.79 
 
 
242 aa  243  3e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  51.41 
 
 
241 aa  243  3e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1656  ABC transporter related  50.61 
 
 
255 aa  242  3.9999999999999997e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00836866  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1592  ABC transporter related  50 
 
 
253 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.537453  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5772  ABC transporter related  49.41 
 
 
336 aa  242  3.9999999999999997e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000320033 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  49.6 
 
 
251 aa  242  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  50.4 
 
 
244 aa  242  3.9999999999999997e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  51.21 
 
 
243 aa  242  3.9999999999999997e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3012  phosphate ABC transporter ATPase  51.69 
 
 
269 aa  242  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0453567  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  48.81 
 
 
247 aa  242  5e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  48.61 
 
 
242 aa  242  5e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  46.85 
 
 
254 aa  241  6e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  46.85 
 
 
254 aa  241  6e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>