More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1460 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1460  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
317 aa  654    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100669  normal  0.0942184 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1643  NAD-dependent epimerase/dehydratase  89.91 
 
 
317 aa  590  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.369842 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5301  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.87 
 
 
321 aa  360  1e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.65 
 
 
315 aa  354  1e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0625265  normal  0.5655 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4006  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.19 
 
 
337 aa  301  1e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.271886  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.04 
 
 
331 aa  104  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.03 
 
 
336 aa  100  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.09 
 
 
336 aa  100  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0557769  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27320  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.16 
 
 
329 aa  97.8  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.572933 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
327 aa  83.6  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.596937  normal  0.966404 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0403  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.36 
 
 
342 aa  79.3  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.27 
 
 
335 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.293726  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1826  mRNA-binding protein  26.03 
 
 
313 aa  77.8  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.334449 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.78 
 
 
339 aa  76.6  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.5 
 
 
299 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.97 
 
 
310 aa  74.7  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.01826  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2545  putative mRNA-binding protein  24.51 
 
 
327 aa  74.3  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0962067  hitchhiker  0.000986877 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0263  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.63 
 
 
338 aa  72.8  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.55 
 
 
309 aa  72  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2758  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.44 
 
 
311 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.15 
 
 
339 aa  71.2  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.550308  hitchhiker  0.00907782 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2001  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.15 
 
 
309 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.15 
 
 
309 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.81324 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2101  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.91 
 
 
313 aa  69.7  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798646 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0315  oxidoreductase domain-containing protein  27.73 
 
 
694 aa  67.8  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596905  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.01 
 
 
327 aa  67  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0776  nucleotide sugar epimerase  26.01 
 
 
306 aa  65.1  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4508  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.36 
 
 
316 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5980  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.16 
 
 
292 aa  65.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853501  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08581  putative mRNA binding protein  21.29 
 
 
306 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.69 
 
 
304 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.365657  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0365  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.47 
 
 
333 aa  65.1  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0805  putative mRNA binding protein  21.86 
 
 
306 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.788288  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08611  putative mRNA binding protein  21.29 
 
 
306 aa  63.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.330884  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09641  putative mRNA binding protein  22.33 
 
 
323 aa  62.8  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.513424  hitchhiker  0.0042312 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.46 
 
 
328 aa  62  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0763  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.32 
 
 
320 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0963  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.14 
 
 
330 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409004  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0593  UDP-glucose 4-epimerase  27.11 
 
 
339 aa  60.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.37 
 
 
353 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2506  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.99 
 
 
321 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17471  putative mRNA binding protein  23.79 
 
 
341 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2691  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.75 
 
 
310 aa  60.5  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1503  UDP-glucose 4-epimerase  24.63 
 
 
324 aa  59.7  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.615148  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0368  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.6 
 
 
347 aa  59.7  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0497868  normal  0.291666 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.02 
 
 
350 aa  59.3  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.83 
 
 
336 aa  59.3  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250908  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  27.22 
 
 
330 aa  59.3  0.00000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  27.22 
 
 
330 aa  59.3  0.00000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5032  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.48 
 
 
286 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.575929  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  19.5 
 
 
305 aa  57.4  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.04 
 
 
311 aa  57  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1463  UDP-glucose 4-epimerase  28.24 
 
 
320 aa  57  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612123  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  19.76 
 
 
316 aa  57  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0445125  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  24.63 
 
 
330 aa  57  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  24.78 
 
 
334 aa  57  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  24.06 
 
 
333 aa  57  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.15 
 
 
304 aa  56.6  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.41 
 
 
309 aa  57  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.79 
 
 
292 aa  57  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.39 
 
 
313 aa  56.6  0.0000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
292 aa  56.2  0.0000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3989  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.4 
 
 
332 aa  56.2  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5712  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.08 
 
 
303 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.33 
 
 
340 aa  56.2  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.08 
 
 
303 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.14 
 
 
317 aa  56.2  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336095  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1148  UDP-glucose 4-epimerase  20.93 
 
 
328 aa  56.2  0.0000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.602539  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.8 
 
 
309 aa  56.2  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8736  hypothetical protein  25.74 
 
 
324 aa  55.8  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1249  UDP-glucose 4-epimerase  19.59 
 
 
328 aa  55.5  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.19 
 
 
329 aa  55.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.170606  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  28.49 
 
 
318 aa  55.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3721  putative epimerase/dehydratase  25.81 
 
 
384 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  23.12 
 
 
331 aa  55.5  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1920  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.76 
 
 
346 aa  55.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.892292  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  22.12 
 
 
333 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07841  putative mRNA binding protein  20.78 
 
 
306 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  25.45 
 
 
320 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.15 
 
 
292 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2555  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.28 
 
 
336 aa  54.7  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6794  NAD dependent epimerase/dehydratase family  26.7 
 
 
331 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1139  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.12 
 
 
328 aa  54.7  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.123868  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.3 
 
 
310 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1762  HrEpiB  21.17 
 
 
313 aa  54.7  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.54 
 
 
311 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0803  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.88 
 
 
315 aa  55.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0943322  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1204  NAD dependent epimerase/dehydratase family  21.41 
 
 
334 aa  54.7  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.573318  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1657  UDP-glucose 4-epimerase  28.04 
 
 
322 aa  54.3  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.408778  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1273  UDP-glucose 4-epimerase  20.64 
 
 
328 aa  54.3  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.138557  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1066  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.02 
 
 
321 aa  54.3  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1335  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.06 
 
 
338 aa  54.3  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0357756 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.3 
 
 
298 aa  54.3  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1425  HrEpiB  21.75 
 
 
312 aa  54.3  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0205  putative mRNA binding protein  21.2 
 
 
307 aa  53.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  19.38 
 
 
308 aa  53.5  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000799266 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  23.53 
 
 
332 aa  53.9  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1877  nucleotide sugar epimerase  23.6 
 
 
301 aa  53.5  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.964376  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.55 
 
 
303 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247898  normal  0.37073 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0590  UDP-glucose 4-epimerase  20.64 
 
 
328 aa  53.1  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>