More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4205 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_4205  thiolase  100 
 
 		 413 aa  842    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5101  Thiolase  60.64 
 
 		 413 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5033  thiolase  60.1 
 
 		 413 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5827  thiolase  60.1 
 
 		 413 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4352  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  59.85 
 
 		 413 aa  497  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6395  thiolase  58.88 
 
 		 413 aa  490  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0582995  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1838  thiolase  57.18 
 
 		 413 aa  478  1e-133  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2744  thiolase  57 
 
 		 412 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0790  thiolase  54.21 
 
 		 414 aa  423  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1472  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  48.92 
 
 		 417 aa  385  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0113  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  41.61 
 
 		 465 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0040  thiolase  45.54 
 
 		 421 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  43.8 
 
 		 392 aa  311  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0558  thiolase  40.49 
 
 		 407 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12803  lipid-transfer protein  38.52 
 
 		 401 aa  241  1e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00155026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2025  lipid-transfer protein  37.62 
 
 		 395 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.957629  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4396  lipid-transfer protein  37.56 
 
 		 397 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4174  lipid-transfer protein  37.56 
 
 		 397 aa  233  5e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4240  lipid-transfer protein  37.56 
 
 		 397 aa  233  5e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.256435  normal  0.231931 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  35.58 
 
 		 383 aa  231  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2338  lipid-transfer protein  37.5 
 
 		 396 aa  228  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544781 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2532  lipid-transfer protein  37.86 
 
 		 395 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.101901  normal  0.217151 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4694  lipid-transfer protein  35.66 
 
 		 406 aa  223  4e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2149  lipid-transfer protein  40.05 
 
 		 397 aa  222  9e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  37.38 
 
 		 387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4309  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.43 
 
 		 378 aa  220  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3870  thiolase  38.83 
 
 		 384 aa  219  7.999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.28834 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2740  lipid-transfer protein  36.9 
 
 		 395 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.527886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  37.25 
 
 		 390 aa  218  2e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4757  lipid-transfer protein  37.97 
 
 		 395 aa  216  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  37.06 
 
 		 387 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2602  thiolase  35.19 
 
 		 382 aa  216  8e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5826  lipid-transfer protein  38.21 
 
 		 394 aa  216  8e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0178  lipid-transfer protein  37.56 
 
 		 395 aa  215  9e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.925449 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  36.25 
 
 		 388 aa  215  9.999999999999999e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4167  lipid-transfer protein  37.1 
 
 		 396 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  36.5 
 
 		 386 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  36.66 
 
 		 390 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3832  lipid-transfer protein  37.68 
 
 		 394 aa  212  9e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0669  lipid-transfer protein  36.54 
 
 		 389 aa  211  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2725  lipid-transfer protein  36.3 
 
 		 394 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  34.26 
 
 		 388 aa  210  4e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  36.84 
 
 		 394 aa  209  6e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0155  lipid-transfer protein  34.59 
 
 		 395 aa  208  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4071  lipid-transfer protein  36.54 
 
 		 395 aa  207  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4354  thiolase  35.82 
 
 		 387 aa  207  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1512  lipid-transfer protein  35.89 
 
 		 409 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2529  lipid-transfer protein  35.55 
 
 		 397 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.46014  normal  0.613077 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5025  lipid-transfer protein  36.73 
 
 		 395 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000479532  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1541  lipid-transfer protein  35.89 
 
 		 395 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1564  lipid-transfer protein  35.89 
 
 		 395 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4119  lipid-transfer protein  37.03 
 
 		 401 aa  206  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2474  lipid-transfer protein  37.25 
 
 		 394 aa  205  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.33 
 
 		 387 aa  205  1e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  36.08 
 
 		 387 aa  205  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5103  lipid-transfer protein  35.94 
 
 		 393 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4078  lipid-transfer protein  36.12 
 
 		 394 aa  203  5e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0450  lipid-transfer protein  37.38 
 
 		 396 aa  203  5e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.607099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  34.24 
 
 		 387 aa  202  8e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3986  lipid-transfer protein  34.47 
 
 		 394 aa  202  8e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1814  thiolase  35.06 
 
 		 417 aa  201  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4153  thiolase family protein  35.18 
 
 		 387 aa  201  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  35 
 
 		 388 aa  200  5e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1529  thiolase  31.58 
 
 		 390 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.380974 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0378  acetyl-CoA acetyltransferase  35.06 
 
 		 392 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.855021  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  34.66 
 
 		 388 aa  198  1.0000000000000001e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3814  lipid-transfer protein  36.04 
 
 		 394 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0363497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5768  lipid-transfer protein  34.62 
 
 		 397 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0932  lipid-transfer protein  32.51 
 
 		 393 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.64 
 
 		 392 aa  196  5.000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4151  thiolase  33.65 
 
 		 386 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.64 
 
 		 392 aa  195  1e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.33 
 
 		 392 aa  195  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0459  acetyl-CoA acetyltransferase  33.91 
 
 		 392 aa  195  2e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1611  lipid-transfer protein  33.58 
 
 		 394 aa  194  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0527  acetyl-CoA acetyltransferase  34.06 
 
 		 392 aa  193  6e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.191077  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1460  acetyl-CoA acetyltransferase  32.35 
 
 		 392 aa  189  7e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  32.01 
 
 		 387 aa  188  1e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3722  lipid-transfer protein  34.45 
 
 		 394 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0743  lipid-transfer protein  34 
 
 		 389 aa  186  5e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0597  Thiolase  33.58 
 
 		 387 aa  186  5e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1006  Thiolase  34.73 
 
 		 388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.63654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3781  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.93 
 
 		 388 aa  183  5.0000000000000004e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000395838  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04353  sterol carrier protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06380)  34.15 
 
 		 458 aa  182  7e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.784343  normal  0.238789 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2477  3-ketoacyl-CoA thiolase  33.42 
 
 		 388 aa  181  2.9999999999999997e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0896  Thiolase  33 
 
 		 388 aa  180  4.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2713  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.23 
 
 		 394 aa  176  5e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00447624  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.52 
 
 		 387 aa  176  8e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4195  Thiolase  33.67 
 
 		 390 aa  176  8e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0815171  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6746  thiolase  33.42 
 
 		 383 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00174625  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3030  lipid-transfer protein  33.65 
 
 		 399 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.463243  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3015  lipid-transfer protein  33.65 
 
 		 399 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.630367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3061  lipid-transfer protein  33.65 
 
 		 399 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.860453 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01840  conserved hypothetical protein  33.41 
 
 		 466 aa  171  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.680862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0021  acetyl-CoA acetyltransferase  30.93 
 
 		 394 aa  171  2e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3907  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.45 
 
 		 381 aa  170  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114937  normal  0.102476 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17880  acetyl-CoA acetyltransferase  31.71 
 
 		 382 aa  170  5e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.241643  normal  0.751852 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  32.16 
 
 		 391 aa  169  6e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3070  acetyl-CoA acetyltransferase  32.06 
 
 		 400 aa  169  7e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.430335 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2462  acetyl-CoA acetyltransferase  34.9 
 
 		 388 aa  169  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>