More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1009 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 268 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  42.35 
 
 		 263 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3255  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.27 
 
 		 263 aa  192  6e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0214768  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  41.57 
 
 		 263 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  42.38 
 
 		 263 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  41.18 
 
 		 263 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  42.21 
 
 		 263 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  42.21 
 
 		 263 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  41.29 
 
 		 264 aa  187  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  42.21 
 
 		 263 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  42.21 
 
 		 263 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  42.21 
 
 		 263 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  42.21 
 
 		 263 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  42.21 
 
 		 263 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  41.18 
 
 		 263 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  40.94 
 
 		 260 aa  186  3e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  39.62 
 
 		 264 aa  186  4e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0444  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.43 
 
 		 268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  40.98 
 
 		 262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  40.08 
 
 		 263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.28 
 
 		 270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  41.2 
 
 		 280 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.78 
 
 		 257 aa  181  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  38.31 
 
 		 263 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  37.7 
 
 		 261 aa  176  4e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  42.47 
 
 		 263 aa  169  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  37.12 
 
 		 262 aa  169  5e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4822  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.15 
 
 		 285 aa  169  5e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564013 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0656  enoyl-CoA hydratase  41.44 
 
 		 262 aa  169  6e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.74 
 
 		 259 aa  166  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  39.11 
 
 		 263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2749  enoyl-CoA hydratase  38.31 
 
 		 267 aa  162  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258906  normal  0.025664 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  38.02 
 
 		 261 aa  160  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2918  enoyl-CoA hydratase  37.25 
 
 		 264 aa  159  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  36.57 
 
 		 261 aa  158  8e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3628  enoyl-CoA hydratase  41.96 
 
 		 263 aa  158  9e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00340574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  36.9 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0446  enoyl-CoA hydratase  42.23 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0471  enoyl-CoA hydratase  42.63 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0802767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2261  enoyl-CoA hydratase  41.67 
 
 		 262 aa  156  4e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1238  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.37 
 
 		 267 aa  156  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  36.26 
 
 		 263 aa  156  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2564  enoyl-CoA hydratase  42.13 
 
 		 263 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0541  enoyl-CoA hydratase  42.13 
 
 		 263 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306395  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2251  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  41.27 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  41.27 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1674  enoyl-CoA hydratase  36.9 
 
 		 284 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2853  enoyl-CoA hydratase  41.73 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00948295  normal  0.659081 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1481  enoyl-CoA hydratase  41.27 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2691  enoyl-CoA hydratase  43.03 
 
 		 263 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  37.75 
 
 		 261 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.88 
 
 		 267 aa  154  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0903  enoyl-CoA hydratase  38.7 
 
 		 276 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  38.7 
 
 		 260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0513  enoyl-CoA hydratase  41.34 
 
 		 263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193795  normal  0.618251 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1958  enoyl-CoA hydratase  36.9 
 
 		 266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3979  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.85 
 
 		 256 aa  152  5e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.776051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1862  enoyl-CoA hydratase  36.51 
 
 		 266 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0819441  normal  0.192366 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0468  enoyl-CoA hydratase  41.83 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3488  enoyl-CoA hydratase  42.63 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0585408  hitchhiker  0.000267739 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0568  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.91 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3078  enoyl-CoA hydratase  41.83 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0533946 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1753  enoyl-CoA hydratase  41.38 
 
 		 258 aa  149  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.228549 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1130  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  37.07 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2154  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  38.08 
 
 		 258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.182629  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2873  enoyl-CoA hydratase  41.06 
 
 		 262 aa  144  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00237837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.51 
 
 		 264 aa  144  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1813  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.07 
 
 		 272 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.591825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1766  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.07 
 
 		 272 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1292  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.46 
 
 		 258 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.886446  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4579  enoyl-CoA hydratase  36.86 
 
 		 278 aa  142  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.781565  normal  0.154982 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.6 
 
 		 268 aa  142  7e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.15 
 
 		 260 aa  142  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1747  enoyl-CoA hydratase  34.7 
 
 		 272 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3115  enoyl-CoA hydratase  40.15 
 
 		 262 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000284376  normal  0.0714988 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06370  Enoyl-CoA hydratase  39.15 
 
 		 283 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.622554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2750  enoyl-CoA hydratase  40.15 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00030401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3015  enoyl-CoA hydratase  38.89 
 
 		 274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.7 
 
 		 261 aa  139  6e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4073  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.25 
 
 		 258 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1911  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 		 270 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  32.22 
 
 		 262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1300  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  36.29 
 
 		 256 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.132411  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.46 
 
 		 266 aa  135  7.000000000000001e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0681  enoyl-CoA hydratase  41.8 
 
 		 263 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0984  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  39.47 
 
 		 266 aa  135  9e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.540223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2405  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.63 
 
 		 272 aa  133  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.777114 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2787  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  34.36 
 
 		 260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0067  enoyl-CoA hydratase  37.55 
 
 		 256 aa  133  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1171  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.92 
 
 		 258 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.372212  normal  0.332854 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3018  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.04 
 
 		 273 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  33.21 
 
 		 259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.18 
 
 		 259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4185  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.09 
 
 		 253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.28293  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0629  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.54 
 
 		 265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.78613  normal  0.0668742 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8421  enoyl-CoA hydratase  36.5 
 
 		 261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.629328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.58 
 
 		 259 aa  130  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4359  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.96 
 
 		 268 aa  130  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4299  enoyl-CoA hydratase  35.91 
 
 		 272 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.621755  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>