210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0653 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0653  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  100 
 
 		 273 aa  545  1e-154  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4131  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  64.96 
 
 		 332 aa  345  6e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.982364 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0490  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  61.77 
 
 		 358 aa  335  5e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4682  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  65.93 
 
 		 263 aa  328  4e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0655  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  60.29 
 
 		 251 aa  271  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.127166 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3287  putative hemolysin  56.72 
 
 		 260 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.131488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0184  hemolysin A  53.93 
 
 		 273 aa  253  3e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0118  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  48.69 
 
 		 302 aa  241  1e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0891926 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3486  hemolysin A  44.65 
 
 		 252 aa  228  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.72701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1448  hemolysin A  46.27 
 
 		 253 aa  221  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.948802  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3843  RNA-binding S4 domain protein  50.37 
 
 		 285 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3916  regulatory protein, DeoR  45.39 
 
 		 262 aa  203  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00126237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2371  hemolysin A  48.33 
 
 		 258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.114514 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4059  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  61.54 
 
 		 333 aa  195  6e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0332012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1825  hemolysin A  44.12 
 
 		 242 aa  191  8e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0615885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5918  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  61.54 
 
 		 400 aa  188  9e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  44.15 
 
 		 367 aa  188  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0598  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  68.09 
 
 		 332 aa  182  7e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0619  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  67.38 
 
 		 332 aa  181  9.000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.109735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1419  hemolysin A  42.42 
 
 		 240 aa  180  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4311  hemolysin A  43.7 
 
 		 250 aa  178  7e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0672112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4680  hemolysin A  42.96 
 
 		 250 aa  177  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.640566  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0086  hemolysin A  42.96 
 
 		 246 aa  176  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.162277  normal  0.205136 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1045  hemolysin A  41.18 
 
 		 252 aa  176  4e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.285224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1510  hemolysin A  43.4 
 
 		 271 aa  176  5e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2834  hemolysin A  43.33 
 
 		 250 aa  175  8e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182775  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0556  hemolysin A  43.61 
 
 		 272 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2654  hemolysin A  42.26 
 
 		 257 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1580  hemolysin A  42.26 
 
 		 257 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1058  rRNA methylase  43.98 
 
 		 252 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00176712  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0782  hemolysin A  41.95 
 
 		 247 aa  172  3.9999999999999995e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.705494  normal  0.486416 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2302  hemolysin A  42.38 
 
 		 316 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2477  putative rRNA methylase  42.01 
 
 		 245 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.382282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2037  hemolysin A  40.38 
 
 		 250 aa  169  5e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00330226  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2981  hemolysin A  43.27 
 
 		 249 aa  168  8e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1601  rRNA methylase  39.41 
 
 		 278 aa  167  1e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4828  hemolysin A  43.7 
 
 		 249 aa  167  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.596006 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0893  hemolysin A  37.92 
 
 		 268 aa  167  2e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00179005  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1239  hemolysin A  39.62 
 
 		 267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0904508  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0718  hemolysin A  43.49 
 
 		 255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1216  hemolysin A  39.62 
 
 		 267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000350473  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1456  hemolysin A  40.15 
 
 		 248 aa  166  5e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.101694  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2072  hemolysin A  36.23 
 
 		 271 aa  165  6.9999999999999995e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.759279  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1786  hemolysin A  36.23 
 
 		 271 aa  165  6.9999999999999995e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.465576  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3080  hemolysin A  41.2 
 
 		 287 aa  165  6.9999999999999995e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3862  hemolysin A  43.02 
 
 		 267 aa  165  8e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199718 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1541  hemolysin A  37.04 
 
 		 266 aa  165  9e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4307  hemolysin A  40.96 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.388226 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1441  hemolysin A  40.21 
 
 		 276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0444  hemolysin A  41.82 
 
 		 253 aa  163  3e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0252  hemolysin A  38.58 
 
 		 282 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04661  rRNA methyltransferase  42.11 
 
 		 267 aa  162  6e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1899  hemolysin A  36.43 
 
 		 270 aa  161  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000632481  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1455  hemolysin A  42.01 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0732885  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0042  hemolysin A  39.11 
 
 		 246 aa  160  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0545179  normal  0.765072 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2875  hemolysin A  40.59 
 
 		 248 aa  160  3e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3487  hemolysin A  39.02 
 
 		 269 aa  160  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000887252  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0583  hypothetical protein  37.59 
 
 		 270 aa  159  4e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0755  rRNA methylase  36.8 
 
 		 270 aa  159  4e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000457361  hitchhiker  0.0000277654 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15831  rRNA methyltransferase  40.82 
 
 		 271 aa  159  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0994  hemolysin A  39.1 
 
 		 264 aa  158  8e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.199053  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16680  hemolysin A  39.42 
 
 		 267 aa  158  8e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.252362 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0443  hemolysin A  37.5 
 
 		 246 aa  158  9e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0606544  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0928  hypothetical protein  37.74 
 
 		 268 aa  158  9e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18631  rRNA methyltransferase  39.1 
 
 		 264 aa  158  9e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.281535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0561  hemolysin A  38.52 
 
 		 248 aa  158  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.613541 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2510  hemolysin A  36.23 
 
 		 266 aa  157  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000179539  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1926  hemolysin A  40.91 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.645328  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2013  hemolysin A  41.04 
 
 		 269 aa  157  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0478155 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1247  hemolysin A  39.55 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.68471 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1180  hemolysin A  38.87 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000850767  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0318  hemolysin A  40.98 
 
 		 264 aa  157  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.996063 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4461  hemolysin A  42.8 
 
 		 246 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1289  hemolysin A  36.98 
 
 		 269 aa  156  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.403831  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22150  hemolysin A  40.07 
 
 		 318 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.324984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4306  hemolysin A  39.25 
 
 		 279 aa  155  6e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000462381  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3918  hemolysin A  39.25 
 
 		 279 aa  155  9e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.3817799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1181  hemolysin, putative  40.38 
 
 		 288 aa  155  9e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0421011  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4080  hemolysin A  39.25 
 
 		 279 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000457386  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3929  hemolysin A  39.25 
 
 		 279 aa  154  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000268336  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4399  hemolysin A  39.25 
 
 		 279 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000782309  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4196  hemolysin A  39.25 
 
 		 279 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.6643e-39 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0454  hemolysin A  37.82 
 
 		 253 aa  154  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0548  hemolysin A  39.11 
 
 		 253 aa  154  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4361  hemolysin A  40.38 
 
 		 266 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06540  hemolysin A  36.47 
 
 		 272 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000376214  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4468  hemolysin A  39.48 
 
 		 252 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2620  hemolysin A  40.52 
 
 		 264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2704  hemolysin A  42.26 
 
 		 249 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4248  hemolysin A  38.87 
 
 		 279 aa  152  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000872961  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1661  hemolysin A  43.18 
 
 		 252 aa  152  4e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0132682  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0491  hemolysin A  39.11 
 
 		 251 aa  153  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4286  hemolysin A  39.25 
 
 		 279 aa  152  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000449467  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0948  hemolysin A  39.25 
 
 		 279 aa  152  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000087786  decreased coverage  0.0000013909 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0956  hemolysin A  38.18 
 
 		 277 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2669  hemolysin A  37.87 
 
 		 251 aa  152  5.9999999999999996e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.116474  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4423  hemolysin A  39.62 
 
 		 266 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.145715 
 
 
-
 
NC_004310  BR0437  hemolysin A  41.82 
 
 		 253 aa  152  7e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1147  hemolysin A  40.37 
 
 		 246 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0499  hemolysin A  40.07 
 
 		 275 aa  152  8e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.298305  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>