221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0323 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0323  alpha/beta hydrolase  100 
 
 		 316 aa  649    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.323866  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1202  hypothetical protein  50.84 
 
 		 306 aa  295  6e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6845  hypothetical protein  50.5 
 
 		 306 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6451  peptidase S15  51.71 
 
 		 295 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0515284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6158  peptidase S15  51.37 
 
 		 295 aa  287  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0594  dienelactone hydrolase  47.12 
 
 		 305 aa  270  2.9999999999999997e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7336  Alpha/beta hydrolase  45.78 
 
 		 315 aa  267  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2878  alpha/beta hydrolase fold protein  48 
 
 		 312 aa  231  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0338969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6460  peptidase S15  43.33 
 
 		 308 aa  226  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412944  normal  0.0890268 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2905  hypothetical protein  37.25 
 
 		 295 aa  198  7.999999999999999e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000728427  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3671  alpha/beta hydrolase fold  39.12 
 
 		 314 aa  187  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.416177 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5227  hypothetical protein  37.76 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.335555 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3976  dienelactone hydrolase  36.64 
 
 		 296 aa  183  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0267  hypothetical protein  37.54 
 
 		 318 aa  182  7e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.586637  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5156  Alpha/beta hydrolase fold  37.38 
 
 		 316 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2852  alpha/beta hydrolase fold  34.46 
 
 		 297 aa  179  7e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142259  normal  0.522222 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2419  alpha/beta hydrolase fold  35.37 
 
 		 295 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.104164  normal  0.0845077 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1972  alpha/beta hydrolase fold  36.91 
 
 		 302 aa  170  4e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0542244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5082  alpha/beta hydrolase fold protein  34.45 
 
 		 321 aa  159  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.94828  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4372  alpha/beta hydrolase fold  32.43 
 
 		 296 aa  156  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2964  alpha/beta hydrolase fold  35.14 
 
 		 295 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3008  alpha/beta hydrolase fold  35.14 
 
 		 295 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1754  alpha/beta hydrolase fold  32.37 
 
 		 313 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1801  alpha/beta hydrolase fold  32.37 
 
 		 313 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.920716  normal  0.37834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1735  alpha/beta hydrolase fold  32.05 
 
 		 313 aa  145  6e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1417  peptidase S15  34.22 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3841  hypothetical protein  29.93 
 
 		 298 aa  142  6e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  34.59 
 
 		 317 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3871  alpha/beta hydrolase fold protein  31.13 
 
 		 313 aa  139  4.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2712  peptidase S15  30.42 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.85912  decreased coverage  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2440  peptidase S15  30.13 
 
 		 298 aa  132  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  30.74 
 
 		 298 aa  132  9e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0081  hydrolase, alpha/beta fold family  28.57 
 
 		 286 aa  130  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0031  alpha/beta fold family hydrolase  27.96 
 
 		 286 aa  130  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0676  peptidase S15  29.62 
 
 		 292 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2027  peptidase S15  33.45 
 
 		 311 aa  122  6e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.501878 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14490  putative hydrolase  28.9 
 
 		 307 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2979  hypothetical protein  29.74 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1832  peptidase S15  27.69 
 
 		 299 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2790  peptidase S15  29.04 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23186 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2886  hypothetical protein  28.77 
 
 		 301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3936  peptidase S15  39.72 
 
 		 309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2670  Alpha/beta hydrolase  28.46 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  29.43 
 
 		 451 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2980  dienelactone hydrolase  30.61 
 
 		 342 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.273684  normal  0.444829 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2708  putative signal peptide protein  32.14 
 
 		 355 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0206  putative signal peptide protein  30.77 
 
 		 342 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3799  hypothetical protein  29.25 
 
 		 342 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851496  hitchhiker  0.000320227 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6854  hypothetical protein  30.72 
 
 		 336 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3497  hypothetical protein  28.46 
 
 		 351 aa  73.6  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2600  dienelactone hydrolase  29.92 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.379294 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0635  putative signal peptide protein  29.84 
 
 		 360 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07083  DltD N-terminal domain protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00380)  25.88 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.727401  normal  0.949036 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0039  conserved hypothetical signal peptide protein  28.21 
 
 		 355 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  36 
 
 		 467 aa  72.8  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1580  hypothetical protein  29.13 
 
 		 342 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.19158  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2457  putative signal peptide protein  28.47 
 
 		 337 aa  72  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.914964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1086  alpha/beta family hydrolase  28.12 
 
 		 354 aa  70.5  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3608  putative signal peptide protein  29.03 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7591  alpha/beta fold family hydrolase  26.88 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0572  twin-arginine translocation pathway signal  31.06 
 
 		 340 aa  67.8  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.165929  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2014  conserved hypothetical signal peptide protein  27.15 
 
 		 345 aa  68.2  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.354348  normal  0.746698 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0047  putative signal peptide protein  29.32 
 
 		 342 aa  67.8  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1459  membrane protein  32.69 
 
 		 329 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0286008 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0698  peptidase S15  27.67 
 
 		 345 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00191719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3071  hypothetical protein  31.45 
 
 		 320 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1794  hypothetical protein  23.43 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0783  conserved hypothetical signal peptide protein  26.63 
 
 		 356 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1165  alpha/beta superfamily hydrolase  28.36 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1264  dienelactone hydrolase domain protein  29.1 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3047  putative signal peptide protein  29.82 
 
 		 355 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2963  hypothetical protein  30.08 
 
 		 312 aa  65.9  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.138316  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1211  hypothetical protein  28.36 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4176  alpha/beta superfamily hydrolase  28.36 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1971  hypothetical protein  32.09 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213035  normal  0.550271 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0764  membrane protein  27.16 
 
 		 330 aa  63.2  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000138363 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1975  hypothetical protein  27.35 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2297  peptidase S15  27.35 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0440  ABC transporter related protein  32.82 
 
 		 868 aa  62.8  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.620247 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4101  peptidase S15  25.64 
 
 		 313 aa  62.8  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.978818  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0778  peptidase S15  27.56 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.398198  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0838  dienelactone hydrolase  29.32 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0271  membrane protein  29.81 
 
 		 320 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.974828  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1693  putative signal peptide protein  28.95 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2038  peptidase S15  25.36 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2117  hypothetical protein  27.5 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5433  hypothetical protein  29.1 
 
 		 132 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.571739  normal  0.957885 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1946  peptidase S15  29.63 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4452  hypothetical protein  30 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0556925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6851  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  33.73 
 
 		 866 aa  60.1  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01305  predicted hydrolase  28.28 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.24888  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2318  conserved hypothetical protein  28.28 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243417  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01315  hypothetical protein  28.28 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.224039  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1443  hypothetical protein  28.28 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0717  hypothetical protein  28.33 
 
 		 378 aa  59.7  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3098  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  28.77 
 
 		 346 aa  59.3  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.610618  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1540  hypothetical protein  27.27 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000424  hydrolase of the alpha/beta superfamily  28.3 
 
 		 367 aa  58.9  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.712062  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1565  hypothetical protein  27.27 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1886  hypothetical protein  29.84 
 
 		 326 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>