221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0319 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0319  OmpW  100 
 
 		 233 aa  471  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.110155  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4189  OmpW family protein  50 
 
 		 236 aa  222  4.9999999999999996e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.370837  normal  0.570233 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5480  OmpW  45.24 
 
 		 234 aa  198  5e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.479641 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3378  OmpW  31.55 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.68852  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3221  OmpW family protein  31.75 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3545  OmpW family protein  31.75 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.506265 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3350  putative outer membrane W signal peptide protein  31.28 
 
 		 241 aa  94  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0426  OmpW family protein  30.19 
 
 		 306 aa  93.2  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0265216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0411  OmpW family protein  29.72 
 
 		 308 aa  91.7  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0130302 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1673  outer membrane protein W  31.42 
 
 		 214 aa  90.9  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0989  OmpW family protein  35.95 
 
 		 241 aa  91.3  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0363  OmpW family outer membrane porin  27.16 
 
 		 241 aa  87.8  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814411  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2790  OmpW family protein  27.97 
 
 		 240 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.888162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1827  OmpW family protein  33.18 
 
 		 229 aa  86.3  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.507852 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3593  OmpW family protein  27.16 
 
 		 241 aa  85.9  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192087  hitchhiker  0.00000065316 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3526  outer membrane protein OmpW  29.03 
 
 		 241 aa  85.1  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2593  OmpW family outer membrane protein  26.37 
 
 		 276 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.964687  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0026  OmpW family outer membrane protein  26.37 
 
 		 276 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000541983  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3516  OmpW family outer membrane protein  26.37 
 
 		 276 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.341116  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3797  ompW family protein  26.37 
 
 		 276 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000517916  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3858  ompW family protein  26.37 
 
 		 276 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00164107  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4566  OmpW family protein  28.92 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3131  OmpW family outer membrane protein  26.37 
 
 		 276 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3525  OmpW family outer membrane protein  26.37 
 
 		 276 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1962  OmpW family outer membrane protein  26.37 
 
 		 276 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2049  outer membrane protein W  29.44 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2322  outer membrane protein W  29.44 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1940  outer membrane protein W  29.44 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218273  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0029  OmpW family outer membrane protein  30.83 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3207  outer membrane protein W  32.12 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000387398  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2534  outer membrane protein W  29.02 
 
 		 218 aa  81.6  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3117  OmpW family outer membrane protein  26.01 
 
 		 276 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00001264  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2738  OmpW family outer membrane protein  28.57 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3720  OmpW family outer membrane protein  28.57 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764905  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3692  ompW family protein  28.57 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1939  outer membrane protein W  31.84 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.940404  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2789  OmpW family outer membrane protein  28.57 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3214  OmpW family outer membrane protein  28.57 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3750  ompW family protein  28.57 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1765  OmpW family outer membrane protein  28.57 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1035  outer membrane protein OprG precursor  30.67 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2674  outer membrane protein W  30.09 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000169515 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3591  outer membrane protein OmpW  24.48 
 
 		 286 aa  79.7  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.921403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11270  outer membrane protein OprG precursor  30.67 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3016  OmpW family outer membrane protein  28.06 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0030  OmpW  26.41 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2601  outer membrane protein W  31.52 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000011484  decreased coverage  0.0000000556975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2668  outer membrane protein W  31.52 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000483878  normal  0.0120446 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2861  outer membrane protein W  32.3 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00340553  unclonable  0.0000000000012731 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3497  OmpW family protein  29.6 
 
 		 243 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1490  outer membrane protein W  32.3 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000649255  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1469  outer membrane protein W  28.76 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000900043  hitchhiker  0.0000643724 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0273  OmpW family outer membrane porin  26.28 
 
 		 274 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000012547  unclonable  0.000000709917 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2589  outer membrane protein W  27.66 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000746821  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3265  OmpW  25.74 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5178  OmpW family protein  25.74 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5103  OmpW family protein  25.74 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2480  OmpW family protein  27.43 
 
 		 211 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.586592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0546  OmpW family protein  25.74 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.768523 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3683  OmpW family protein  25.47 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000286443  unclonable  0.0000000000000106929 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2180  outer membrane protein W  31.72 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.41802  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2787  outer membrane protein W  28.65 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0424619  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5444  OmpW family protein  28.7 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.230976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5040  OmpW family protein  26.01 
 
 		 274 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.29501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5082  OmpW  27.67 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133195  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0370  outer membrane protein W  29.69 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4515  OmpW family protein  26.01 
 
 		 274 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.144856  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4400  OmpW family protein  27.67 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5778  OmpW family protein  27.67 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2417  OmpW family protein  27.89 
 
 		 274 aa  75.9  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.729819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1392  outer membrane protein W  31.14 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00591184  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1859  outer membrane protein W  29 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0303  OmpW family protein  26.2 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1596  outer membrane protein W  29 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.597068 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1086  OmpW family protein  32.69 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.832301 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0155  OmpW family protein  28 
 
 		 255 aa  75.1  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282496 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2023  OmpW family protein  27.89 
 
 		 274 aa  75.1  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  0.457638 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4473  OmpW  30.57 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2554  outer membrane protein W  29.31 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1485  outer membrane protein W  29.65 
 
 		 214 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0850248  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1521  outer membrane protein W  29.65 
 
 		 214 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00262855  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0979  OmpW family protein  27.22 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2000  outer membrane protein W  28.83 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00029  outer membrane protein OmpW  27.35 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1922  outer membrane protein W  29 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0854242  hitchhiker  0.00107444 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1864  outer membrane protein W  29 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.904155 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1371  outer membrane protein W  30.91 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0573693 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1414  outer membrane protein W  28.57 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.157023  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2707  OmpW  28.34 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0259344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0400  OmpW family protein  28.34 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.869895  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0379  OmpW family protein  28.34 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2349  OmpW family protein  25.47 
 
 		 382 aa  72.8  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306712 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1334  outer membrane protein W  27.78 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000150593  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2775  outer membrane protein W  29.13 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00794049  decreased coverage  0.0000209029 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2283  outer membrane protein W  27.39 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1433  OmpW family outer membrane protein  26.26 
 
 		 274 aa  72  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1876  outer membrane protein W  28.57 
 
 		 212 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000262717 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3286  OmpW family protein  25 
 
 		 224 aa  72  0.000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208435  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000903  outer membrane protein W precursor  27.19 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2392  OmpW family protein  28.57 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160177  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>