More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4547 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4547  ATP-dependent DNA helicase RecQ  100 
 
 
556 aa  1119    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0908744  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4797  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.79 
 
 
590 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.58 
 
 
607 aa  450  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138004  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2304  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.81 
 
 
602 aa  448  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6329  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  44.78 
 
 
588 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4005  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.23 
 
 
630 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6295  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  44.32 
 
 
590 aa  377  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2541  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  42.44 
 
 
646 aa  351  2e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3149  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  40.94 
 
 
1376 aa  348  2e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.212538 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1710  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  40.2 
 
 
716 aa  335  2e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000163586  unclonable  9.26658e-25 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2543  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.26 
 
 
543 aa  319  7.999999999999999e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1920  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.1 
 
 
563 aa  317  5e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000199537  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2551  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.44 
 
 
543 aa  315  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.525573  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2506  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.44 
 
 
543 aa  315  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.452  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6833  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  40.56 
 
 
708 aa  314  2.9999999999999996e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4236  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  40.92 
 
 
535 aa  310  4e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0011  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  35.56 
 
 
793 aa  310  5e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00580778  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2792  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  35.94 
 
 
552 aa  307  3e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.825053 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4974  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.11 
 
 
568 aa  303  5.000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581094  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06400  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.61 
 
 
626 aa  292  1e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199854  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0829  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  38.45 
 
 
546 aa  287  4e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5632  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.09 
 
 
545 aa  283  4.0000000000000003e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.185605 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1261  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.8 
 
 
707 aa  281  2e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1056  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  45.48 
 
 
584 aa  277  3e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6470  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.24 
 
 
624 aa  276  5e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0566058 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.15 
 
 
592 aa  276  7e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2826  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.75 
 
 
705 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2842  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.75 
 
 
705 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0115008  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2618  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.75 
 
 
705 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00666767  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3741  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.3 
 
 
705 aa  275  2.0000000000000002e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158627  normal  0.0164028 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2466  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.75 
 
 
705 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.425923  normal  0.631246 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.79 
 
 
617 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2865  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.75 
 
 
705 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000591362  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1919  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.57 
 
 
706 aa  273  6e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77164  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2825  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.75 
 
 
705 aa  273  6e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139283 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2576  ATP-dependent DNA helicase (RecQ)  38.75 
 
 
705 aa  273  7e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238404  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2928  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.27 
 
 
728 aa  272  9e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000212564  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2543  ATP-dependent DNA helicase Q  38.46 
 
 
705 aa  272  1e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1545  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.68 
 
 
592 aa  272  1e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1542  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36 
 
 
592 aa  272  1e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.260757  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2627  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.46 
 
 
705 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2818  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.46 
 
 
705 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.01256  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2232  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.95 
 
 
634 aa  270  5e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.319875  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0495  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.04 
 
 
448 aa  268  2e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00264596  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0744  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.71 
 
 
593 aa  267  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0761  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.71 
 
 
593 aa  267  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.089844  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1003  superfamily II DNA helicase  40.5 
 
 
597 aa  267  2.9999999999999995e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000133719  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0948  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.02 
 
 
562 aa  267  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4553  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.78 
 
 
864 aa  266  7e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0436  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  36.96 
 
 
503 aa  265  1e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0327  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.18 
 
 
724 aa  266  1e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.946569  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1407  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.92 
 
 
509 aa  265  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000181661  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1413  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.81 
 
 
594 aa  264  3e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.9 
 
 
721 aa  264  3e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0060  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.67 
 
 
617 aa  264  3e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.36 
 
 
736 aa  264  3e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.765409 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0332  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.89 
 
 
613 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5465  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  40 
 
 
637 aa  263  4.999999999999999e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0760  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.97 
 
 
479 aa  261  2e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462487  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1951  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.4 
 
 
729 aa  261  3e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1165  hypothetical protein  38.35 
 
 
724 aa  261  3e-68  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.402826 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2193  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  34.08 
 
 
497 aa  261  3e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0053  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.6 
 
 
619 aa  260  4e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2696  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.64 
 
 
718 aa  260  5.0000000000000005e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.820222 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3474  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.18 
 
 
610 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3780  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.57 
 
 
642 aa  260  5.0000000000000005e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0888  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  44.01 
 
 
595 aa  259  6e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0900  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.96 
 
 
605 aa  260  6e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.586975  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0884  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  44.01 
 
 
595 aa  259  8e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.385904  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3602  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.9 
 
 
737 aa  259  1e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.436547 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0825  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  43.38 
 
 
598 aa  258  1e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1075  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  47.2 
 
 
632 aa  259  1e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035291 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0838  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.73 
 
 
527 aa  259  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2398  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.39 
 
 
606 aa  259  1e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1309  hypothetical protein  36.86 
 
 
637 aa  259  1e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1335  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.67 
 
 
592 aa  259  1e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.764051  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3998  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.11 
 
 
597 aa  258  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0373347  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12343  putative ATP-dependent DNA helicase  36.71 
 
 
734 aa  258  2e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.839573  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1367  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.3 
 
 
509 aa  258  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501878  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0137  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.5 
 
 
631 aa  257  4e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.837204  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0297  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.19 
 
 
725 aa  257  4e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09613  ATP-dependent DNA helicase recQ  38.25 
 
 
632 aa  257  4e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0281  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.15 
 
 
731 aa  256  6e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3491  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.34 
 
 
635 aa  256  6e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.394167  normal  0.250752 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3805  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.24 
 
 
509 aa  256  6e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000127885  hitchhiker  1.2294e-16 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0072  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.44 
 
 
674 aa  256  6e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.234386  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.64 
 
 
599 aa  256  7e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372053  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0218  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.81 
 
 
610 aa  256  7e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0555  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.81 
 
 
610 aa  256  7e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0391  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.41 
 
 
607 aa  256  8e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000840098 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0911  superfamily II DNA helicase  43.98 
 
 
621 aa  256  9e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4552  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.71 
 
 
608 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00645821 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3264  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.22 
 
 
731 aa  255  1.0000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1579  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.51 
 
 
509 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.50409e-40 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1646  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.51 
 
 
509 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3822  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.89 
 
 
615 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3830  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.71 
 
 
607 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.912589  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1394  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.03 
 
 
509 aa  254  3e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000165058  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1505  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.03 
 
 
509 aa  254  3e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000020318  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0252  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.39 
 
 
602 aa  254  3e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>