189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4253 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4253  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 		 124 aa  252  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1618  cytochrome c oxidase subunit II  50.4 
 
 		 125 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.464579 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0599  cytochrome c oxidase subunit II  52.14 
 
 		 124 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1408  cytochrome c oxidase family protein  61.29 
 
 		 141 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0216619  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2422  cytochrome c oxidase family protein  61.29 
 
 		 141 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1899  cytochrome c oxidase family protein  61.29 
 
 		 141 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3408  cytochrome c oxidase family protein  61.29 
 
 		 141 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.181168  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2257  putative cytochrome c oxidase subunit  61.29 
 
 		 141 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0923001  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2296  putative cytochrome c oxidase subunit  61.29 
 
 		 141 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.375881  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1172  cytochrome c oxidase family protein  61.29 
 
 		 141 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0182872  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2175  cytochrome c oxidase family protein  61.29 
 
 		 141 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.381678  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02212  putative cytochrome C oxidase polypeptide II oxidoreductase protein  46.32 
 
 		 125 aa  100  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2967  cytochrome c oxidase subunit II  36.47 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000376263 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2412  cytochrome c oxidase subunit II  32.14 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8116  cytochrome c oxidase subunit II  32.93 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1899  cytochrome c oxidase subunit II  29.89 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71816  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1950  cytochrome c oxidase, subunit II  31.46 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2385  cytochrome c oxidase subunit II  28.74 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1874  cytochrome c oxidase, subunit II  37.18 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0884  cytochrome c oxidase, subunit II  29.06 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.555731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 243 aa  53.5  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1491  cytochrome c oxidase, subunit II  32.56 
 
 		 190 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.403979  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1352  cytochrome c oxidase, subunit II  32.56 
 
 		 185 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1358  cytochrome c oxidase, subunit II  32.56 
 
 		 185 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2875  hypothetical protein  32.56 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.902113  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2797  cytochrome c oxidase, subunit II  31.94 
 
 		 249 aa  53.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3756  cytochrome c oxidase subunit II  29.76 
 
 		 300 aa  53.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5762  cytochrome c oxidase subunit II  31.4 
 
 		 195 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3802  cytochrome c oxidase subunit II  30.49 
 
 		 262 aa  52.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0464  cytochrome c oxidase subunit II  28.74 
 
 		 266 aa  52  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  34.33 
 
 		 316 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0933  cytochrome c oxidase, subunit II  28.24 
 
 		 168 aa  50.8  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  32.43 
 
 		 351 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0761  cytochrome c oxidase subunit II  28.57 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.254887  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0809  cytochrome-c oxidase  31.08 
 
 		 247 aa  50.4  0.000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11170  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit II  36.11 
 
 		 315 aa  50.4  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.761021  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  26.67 
 
 		 311 aa  50.4  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  39.06 
 
 		 321 aa  50.4  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2313  cytochrome c oxidase, subunit II  33.67 
 
 		 244 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.210732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  30.21 
 
 		 389 aa  49.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1574  cytochrome c oxidase subunit II  28.44 
 
 		 168 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226069  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  32 
 
 		 288 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1002  cytochrome c oxidase, subunit II  29.73 
 
 		 257 aa  48.9  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3373  cytochrome c oxidase subunit II  27.27 
 
 		 172 aa  49.3  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.208365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0320  cytochrome c oxidase, subunit II  26.04 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2012  Nitrous-oxide reductase  31.78 
 
 		 663 aa  48.9  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0156  cytochrome c oxidase, subunit II  30.26 
 
 		 232 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3849  cytochrome c oxidase, subunit II  31.31 
 
 		 235 aa  48.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.26025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0016  cytochrome c oxidase, subunit II  29.76 
 
 		 186 aa  48.5  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0741  cytochrome c oxidase, subunit II  32.56 
 
 		 287 aa  48.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2345  cytochrome c oxidase subunit II  31.94 
 
 		 271 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.215159  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0348  cytochrome c oxidase subunit II  29.27 
 
 		 190 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0244  nitrous-oxide reductase  30.68 
 
 		 647 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.677359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0563  cytochrome c oxidase subunit II  37.5 
 
 		 394 aa  48.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2021  cytochrome c oxidase subunit II  30.59 
 
 		 160 aa  47.4  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0428  nitrous-oxide reductase  26.37 
 
 		 649 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.859318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0046  cytochrome c oxidase, subunit II  35.94 
 
 		 301 aa  47.8  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0300  cytochrome c oxidase, subunit II  35.29 
 
 		 254 aa  47  0.00008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2667  cytochrome c oxidase, subunit II  29.59 
 
 		 175 aa  47  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000731969  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1767  cytochrome c oxidase, subunit II  30.12 
 
 		 352 aa  47  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204958  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  35.94 
 
 		 314 aa  47  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  37.5 
 
 		 313 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4077  putative cytochrome c oxidase subunit II  28.05 
 
 		 190 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.357197 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0623  cytochrome c oxidase subunit II  28.05 
 
 		 190 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.320942 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2266  cytochrome c, monohaem  31.94 
 
 		 336 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.380948  normal  0.0167103 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  32.84 
 
 		 359 aa  47  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2026  cytochrome c oxidase, subunit II  38.16 
 
 		 346 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000905775 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1402  cytochrome c oxidase, subunit II  26.74 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.290296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0460  cytochrome c oxidase, subunit II  33.75 
 
 		 353 aa  45.4  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354816  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2402  nitrous-oxide reductase  31.82 
 
 		 620 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00162507  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3142  nitrous-oxide reductase  27.47 
 
 		 648 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1538  cytochrome c oxidase, subunit II  31.58 
 
 		 399 aa  46.2  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0730  cytochrome c oxidase, subunit II  38.89 
 
 		 295 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.255439  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1461  Nitrous-oxide reductase  32.95 
 
 		 620 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  29 
 
 		 337 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0697  cytochrome c oxidase, subunit II  36.62 
 
 		 322 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2425  cytochrome c oxidase subunit II  23.26 
 
 		 314 aa  45.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.408327 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2862  cytochrome c oxidase subunit II  31.25 
 
 		 272 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0669  cytochrome c oxidase subunit II  32.88 
 
 		 279 aa  46.2  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1556  Nitrous-oxide reductase  32.95 
 
 		 620 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.298548  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3892  cytochrome c oxidase subunit II  30.61 
 
 		 345 aa  45.4  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.740774  normal  0.178097 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2397  cytochrome c oxidase, subunit II  25.29 
 
 		 177 aa  45.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0467  cytochrome c oxidase, subunit II  28.38 
 
 		 284 aa  45.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.870117  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  31.08 
 
 		 350 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1298  nitrous-oxide reductase  32.22 
 
 		 865 aa  45.1  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000502464  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  29.67 
 
 		 337 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  29 
 
 		 337 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  34.38 
 
 		 362 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  34.38 
 
 		 362 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0162  cytochrome c oxidase subunit II  29.89 
 
 		 179 aa  45.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  34.38 
 
 		 362 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0581  cytochrome c oxidase subunit II  28.38 
 
 		 294 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00300077  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  31.08 
 
 		 350 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  32.79 
 
 		 302 aa  45.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3117  cytochrome c oxidase, subunit II  26.67 
 
 		 316 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.762727  normal  0.80653 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4588  cytochrome-c oxidase  28.95 
 
 		 284 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  34.29 
 
 		 346 aa  45.1  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0096  cytochrome c oxidase, subunit II  36 
 
 		 334 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1565  cytochrome c oxidase subunit II  25.29 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0518  cytochrome c oxidase subunit II  28.38 
 
 		 294 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>