133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4236 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4236  transport-associated protein  100 
 
 		 175 aa  345  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5083  transport-associated protein  38.1 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62690  hypothetical protein  43.37 
 
 		 114 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5456  hypothetical protein  43.37 
 
 		 114 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5244  transport-associated  36.7 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.797989  normal  0.73518 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3412  transport-associated  36.7 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0333  hypothetical protein  40.91 
 
 		 279 aa  54.3  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5879  transport-associated  36.52 
 
 		 115 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6356  transport-associated  31.03 
 
 		 125 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.802203  normal  0.334542 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0262  transport-associated protein  38.64 
 
 		 279 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2719  putative phospholipid-binding protein  43.82 
 
 		 116 aa  52  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2029  transport-associated domain-containing protein  36.99 
 
 		 221 aa  51.6  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.168793  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2719  transport-associated domain-containing protein  36.99 
 
 		 221 aa  51.6  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3148  putative phospholipid-binding protein  38.57 
 
 		 294 aa  51.6  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3201  phospholipid-binding domain-containing protein  38.24 
 
 		 221 aa  51.2  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4971  transport-associated  44.59 
 
 		 115 aa  51.2  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314311  normal  0.115696 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  41.79 
 
 		 205 aa  50.8  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  40.3 
 
 		 201 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  40.3 
 
 		 201 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1642  putative periplasmic protein  41.1 
 
 		 144 aa  50.4  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  40.3 
 
 		 201 aa  50.4  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  40.3 
 
 		 201 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  40.3 
 
 		 201 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  40.3 
 
 		 201 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  40.3 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  40.3 
 
 		 201 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2416  transport-associated  32.99 
 
 		 118 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1376  osmotically inducible protein Y  45.31 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0885  transport-associated domain-containing protein  40 
 
 		 122 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3156  phospholipid-binding domain-containing protein  45.31 
 
 		 246 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3185  transport-associated domain-containing protein  40 
 
 		 122 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0627443  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3027  phospholipid-binding domain-containing protein  45.31 
 
 		 184 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.119447  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1891  putative phospholipid-binding protein  40 
 
 		 122 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.944608  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0177  transport-associated  40.62 
 
 		 276 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  31.09 
 
 		 201 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  28.57 
 
 		 199 aa  48.9  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4015  transport-associated  32.18 
 
 		 118 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1624  putative phospholipid-binding protein  41.54 
 
 		 119 aa  48.9  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0267001  normal  0.292905 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3436  transport-associated  40.62 
 
 		 127 aa  49.3  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.865751  normal  0.0604848 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3603  transport-associated  42.25 
 
 		 116 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.335448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4244  transport-associated protein  44.78 
 
 		 136 aa  49.3  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5453  transport-associated protein  40.3 
 
 		 134 aa  49.3  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.627587  hitchhiker  0.00543554 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43670  Transport-associated protein  36.92 
 
 		 120 aa  48.5  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.226738  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5898  transport-associated  33.33 
 
 		 116 aa  48.9  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5639  transport-associated  37.31 
 
 		 134 aa  48.9  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.149696 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  39.06 
 
 		 204 aa  48.9  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6387  transport-associated  37.31 
 
 		 134 aa  48.9  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.508762 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  40.3 
 
 		 205 aa  48.5  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  40.3 
 
 		 205 aa  48.5  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0010  transport-associated  29.79 
 
 		 101 aa  48.5  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1679  transport-associated protein  41.89 
 
 		 118 aa  48.5  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.3238  normal  0.893681 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  40.3 
 
 		 205 aa  48.5  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  40.3 
 
 		 205 aa  48.5  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2545  transport-associated protein  37.5 
 
 		 120 aa  48.5  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.899169 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  40.3 
 
 		 205 aa  48.5  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  31.93 
 
 		 204 aa  48.1  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  31.93 
 
 		 204 aa  48.1  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  31.93 
 
 		 204 aa  48.1  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0718  transport-associated  43.86 
 
 		 121 aa  47.8  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.523753  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2542  transport-associated protein  35.96 
 
 		 105 aa  47.8  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000702242 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0735  transport-associated  43.86 
 
 		 121 aa  47.8  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.106493 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  39.71 
 
 		 202 aa  47.8  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2047  transport-associated protein  33.8 
 
 		 104 aa  47.4  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2682  transport-associated protein  33.94 
 
 		 116 aa  47.8  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0356  transport-associated  39.06 
 
 		 121 aa  47.8  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.29049  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0839  transport-associated  39.06 
 
 		 121 aa  47.8  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0811  transport-associated  39.06 
 
 		 121 aa  47.8  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.293116  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0321  hypothetical protein  36.62 
 
 		 198 aa  47.4  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3244  transport-associated  31.78 
 
 		 118 aa  47  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.688311  normal  0.631575 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4706  transport-associated  41.1 
 
 		 116 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.275207  normal  0.0404063 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1372  transport-associated  38.81 
 
 		 136 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.389649  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  42.03 
 
 		 232 aa  46.2  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6457  transport-associated  38.81 
 
 		 136 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4984  transport-associated  34.26 
 
 		 113 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0812534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6049  transport-associated  38.81 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0480722 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3063  hypothetical protein  43.08 
 
 		 190 aa  46.2  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2920  hypothetical protein  43.08 
 
 		 190 aa  46.2  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4818  transport-associated protein  41.1 
 
 		 118 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.958315  normal  0.118263 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3026  transport-associated protein  37.89 
 
 		 124 aa  46.2  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311021  normal  0.461623 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0383  phospholipid binding protein  32.14 
 
 		 115 aa  46.2  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3469  transport-associated  33.94 
 
 		 116 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1671  transport-associated  35.09 
 
 		 105 aa  46.2  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4052  transport-associated  33.94 
 
 		 116 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  37.31 
 
 		 202 aa  45.4  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3465  periplasmic protein  32.77 
 
 		 202 aa  45.4  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4411  transport-associated  40 
 
 		 244 aa  45.4  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.128668  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0950  transport-associated  35.82 
 
 		 171 aa  45.1  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.239728  normal  0.788848 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1094  transport-associated  35.82 
 
 		 171 aa  45.1  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3177  transport-associated  35.29 
 
 		 123 aa  45.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944582  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5191  transport-associated  35.29 
 
 		 123 aa  45.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696153 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5086  transport-associated  35.29 
 
 		 123 aa  45.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  29.41 
 
 		 192 aa  44.7  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0264  transport-associated  33.75 
 
 		 187 aa  45.1  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.47721  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5031  transport-associated  39.06 
 
 		 119 aa  44.7  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677375 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04303  putative phospholipid-binding domain family  36.07 
 
 		 120 aa  44.7  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4707  transport-associated protein  31.96 
 
 		 116 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217947 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5544  transport-associated  39.51 
 
 		 216 aa  44.3  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.078197  normal  0.764141 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4572  transport-associated  31.96 
 
 		 116 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.414411  normal  0.472278 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1501  transport-associated protein  40.3 
 
 		 104 aa  44.3  0.0009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5156  transport-associated protein  35.16 
 
 		 115 aa  44.3  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.609853 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>