238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4076 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4076  cytochrome c, class I  100 
 
 		 151 aa  301  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2783  cytochrome c class I  33.77 
 
 		 151 aa  94  6e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.796513  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1563  cytochrome c class I  41.54 
 
 		 147 aa  88.6  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0810  cytochrome c, class I  37.9 
 
 		 158 aa  87.8  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2872  cytochrome c class I  40.62 
 
 		 159 aa  84.7  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1926  cytochrome c class I  41.18 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000015189 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0037  cytochrome c class I  39.81 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.113855  normal  0.0169208 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1925  cytochrome c class I  40.43 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.379147  hitchhiker  0.000000158454 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3813  cytochrome c class I  36.89 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.683358 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4366  cytochrome c, class I  37.5 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.726354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1689  cytochrome c, class I  45.45 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105183  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1369  cytochrome c class I  34.65 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02321  hypothetical protein  39.81 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0244328  normal  0.13211 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0561  cytochrome c class I  41.76 
 
 		 157 aa  71.2  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1432  cytochrome c, class I  40.95 
 
 		 217 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.632156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3309  cytochrome c, class I  36.07 
 
 		 166 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5058  cytochrome c, class I  36.07 
 
 		 166 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.81836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4125  cytochrome c, class I  41.86 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03038  major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  34 
 
 		 510 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.490138  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4015  nitrite reductase, copper-containing  30.33 
 
 		 499 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4128  nitrite reductase, copper-containing  30.33 
 
 		 499 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2127  cytochrome c class I  37.96 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1265  cytochrome c, class I  32.11 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5226  cytochrome c class I  37.65 
 
 		 166 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.895227  normal  0.936592 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3584  cytochrome c class I  35.71 
 
 		 166 aa  67  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.498131 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0251  cytochrome c class I  37.65 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0473  cytochrome c class I  32.79 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1620  outer membrane nitrite reductase, putative  39.25 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.704464  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4349  cytochrome c class I  31.03 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0605  cytochrome c, class I  34.15 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4324  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  33.87 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.753936  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1565  cytochrome c class I  31.82 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4468  cytochrome c, class I  34.43 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4993  cytochrome c class I  34.43 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0594408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2418  nitrite reductase, copper-containing  31.43 
 
 		 479 aa  63.9  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1519  nitrite reductase, copper-containing  33.61 
 
 		 481 aa  63.9  0.0000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0246  cytochrome c class I  33.94 
 
 		 251 aa  61.6  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2442  NHL repeat containing protein  33.96 
 
 		 577 aa  61.2  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0106112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0450  cytochrome c class I  33.71 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0881  mulitcopper oxidase domain-containing protein  30.91 
 
 		 516 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.208672  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4625  cytochrome c class I  37.5 
 
 		 197 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.887243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0431  cytochrome c class I  32.76 
 
 		 232 aa  60.5  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.472304 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3985  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.76 
 
 		 852 aa  59.7  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188405  normal  0.0691409 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0755  putative outer membrane nitrite reductase  30.56 
 
 		 520 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0721126  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0520  putative anaerobically induced outer membrane protein  30.56 
 
 		 520 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1658  putative outer membrane nitrite reductase  30.56 
 
 		 520 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179147  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2012  nitrite reductase, copper-containing  30.56 
 
 		 516 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2107  nitrite reductase, copper-containing  30.56 
 
 		 520 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0593  putative outer membrane nitrite reductase  30.56 
 
 		 520 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0703  putative outer membrane nitrite reductase  30.56 
 
 		 520 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3966  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.54 
 
 		 601 aa  58.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3648  cytochrome c class I  26.79 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00073069  normal  0.303937 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4896  cytochrome c class I  30.56 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3926  cytochrome c family protein  31.11 
 
 		 222 aa  57.4  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4998  cytochrome c class I  29.13 
 
 		 756 aa  55.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0614505  normal  0.826099 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5000  membrane-bound dehydrogenase domain protein  31.78 
 
 		 749 aa  54.3  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.652472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4984  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.03 
 
 		 1055 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.380222 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1660  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  41.86 
 
 		 287 aa  50.1  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0290388  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2513  hypothetical protein  21.17 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1833  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  39.36 
 
 		 287 aa  50.1  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.432152  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1479  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  41.86 
 
 		 287 aa  50.1  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3309  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.57 
 
 		 432 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4608  cytochrome c class I  31.4 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0752945 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0650  putative periplasmic cytochrome c  28.57 
 
 		 432 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.524273  normal  0.460926 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1132  cytochrome c, class I  28.45 
 
 		 214 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.300286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1876  hypothetical protein  29.7 
 
 		 775 aa  48.9  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1153  cytochrome c family protein  27.68 
 
 		 218 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3264  c-type cytochrome  33.33 
 
 		 143 aa  48.9  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4890  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  31.36 
 
 		 436 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0428  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.03 
 
 		 432 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20531  normal  0.416218 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0249  cytochrome c family protein  27.27 
 
 		 432 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.767699  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0915  cytochrome C  27.27 
 
 		 432 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136594  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2461  cytochrome c family protein  27.27 
 
 		 432 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0749  cytochrome c family protein  27.27 
 
 		 432 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2697  cytochrome c family protein  27.27 
 
 		 432 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2380  cytochrome c family protein  27.27 
 
 		 432 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0736  cytochrome c family protein  27.27 
 
 		 432 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0084  Cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  34.88 
 
 		 307 aa  47.4  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000832498  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3907  cytochrome c oxidase, subunit II  31.03 
 
 		 390 aa  47.4  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8114  cytochrome c class I  32.48 
 
 		 419 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719165  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1262  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.83 
 
 		 1068 aa  47.4  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.261876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0027  cytochrome c class I  29.09 
 
 		 548 aa  47  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.16509  normal  0.0410464 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0879  cytochrome c oxidase, subunit II  46.51 
 
 		 373 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6817  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.09 
 
 		 474 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166846  normal  0.164997 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1680  cytochrome c oxidase, subunit II  29.69 
 
 		 402 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450721  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1779  cytochrome c, class I  27.19 
 
 		 214 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0282319 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2986  cytochrome c, class I  30.51 
 
 		 436 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60490  putative cytochrome c  29.69 
 
 		 675 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00637068  normal  0.0584653 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5380  cytochrome c, class I  30.51 
 
 		 436 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0178  cytochrome c oxidase, subunit II  36.36 
 
 		 513 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4654  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.64 
 
 		 429 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0790  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.94 
 
 		 427 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310202  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5997  cytochrome c, class I  26.36 
 
 		 432 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0720  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.94 
 
 		 427 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.690125 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0403  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.72 
 
 		 773 aa  45.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.572265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4245  cytochrome c, class I  33.01 
 
 		 391 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2155  cytochrome c, class I  32.12 
 
 		 728 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0905  cytochrome c oxidase, Cbb3-type, subunit III  40 
 
 		 287 aa  45.8  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.269734  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3181  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor  34.62 
 
 		 398 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3996  cytochrome c, class I  31.53 
 
 		 143 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91399  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>