More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3259 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3259  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 138 aa  286  8e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364539  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3135  ArsR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 106 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3748  ArsR family transcriptional regulator  43.22 
 
 		 118 aa  105  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2632  ArsR family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 127 aa  99.8  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1468  ArsR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 111 aa  97.4  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.19105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1459  ArsR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 129 aa  95.1  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2424  ArsR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 118 aa  94.7  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1608  ArsR family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 113 aa  94.4  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.720333  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3636  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 120 aa  94  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0763  transcriptional regulator, ArsR family  46.32 
 
 		 132 aa  93.6  7e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0757  transcriptional regulator, ArsR family  44.12 
 
 		 129 aa  91.7  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.164852 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2154  transcriptional regulator, ArsR family  45.26 
 
 		 129 aa  90.5  6e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0623  ArsR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 129 aa  88.6  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2529  ArsR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 106 aa  87.8  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2439  ArsR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 108 aa  88.2  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.985775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2313  ArsR family transcriptional regulator  48.42 
 
 		 114 aa  87.4  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1704  transcriptional regulator, ArsR family  42.7 
 
 		 125 aa  85.9  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809199  hitchhiker  0.000421597 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0866  ArsR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 111 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.799603  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1421  regulatory protein, ArsR  47.5 
 
 		 113 aa  82  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2984  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 114 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2826  regulatory protein, ArsR  39.13 
 
 		 112 aa  78.2  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0214569  hitchhiker  0.000742235 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1891  ArsR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1794  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0439  regulatory protein, ArsR  47.5 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1582  ArsR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00023069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4852  transcriptional regulator, ArsR family  35.16 
 
 		 114 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  39.18 
 
 		 109 aa  72  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3756  transcriptional regulator, ArsR family  37.08 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.965498 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3703  transcriptional regulator, ArsR family  37.08 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0938  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  41.38 
 
 		 102 aa  70.1  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0476  transcriptional regulator, ArsR family  35.48 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2040  transcriptional regulator, ArsR family  39.24 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2135  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 97 aa  67.4  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  2.25327e-28  decreased coverage  0.0000795687 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  38.82 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 98 aa  67  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2535  ArsR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 100 aa  65.9  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.02 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0432  ArsR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.714368 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2351  transcriptional regulator, ArsR family  38.64 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000226954  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36710  transcriptional regulator, ArsR family  39.77 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.944272 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1108  ArsR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0454  ArsR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1189  transcriptional regulator, ArsR family  38.03 
 
 		 103 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1702  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000822998 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4684  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.504517  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1557  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0128912  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29211  regulatory proteins, ArsR family protein  40.51 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2011  regulatory protein, ArsR  39.56 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184845  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2205  ArsR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.273096  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4265  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 125 aa  60.1  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783067  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  31.4 
 
 		 93 aa  60.5  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2369  transcriptional regulator, ArsR family  35.37 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000230878  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2002  transcriptional regulator, ArsR family  35.37 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0553  transcriptional regulator, ArsR family  35.9 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1821  ArsR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0345143  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1547  transcriptional regulator, ArsR family  33.71 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3726  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.870281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1770  ArsR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83595  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  33.65 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  37.62 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1372  ArsR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.792915 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3728  regulatory protein, ArsR  39.44 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.369834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0374  transcriptional regulator, ArsR family  32.98 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 218 aa  57.4  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 125 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 125 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 125 aa  57  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 125 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1782  ArsR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 102 aa  57  0.00000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 125 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  32.1 
 
 		 125 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  32.1 
 
 		 125 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  32.1 
 
 		 125 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  32.1 
 
 		 125 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  30.12 
 
 		 98 aa  57  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0544  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 102 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4383  ArsR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  35.11 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1801  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0987  ArsR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.528724  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2402  ArsR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  36.49 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1719  transcriptional regulator, ArsR family  36.11 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1747  regulatory protein, ArsR  36 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000191079  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0548  transcriptional regulator, ArsR family  36.11 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  35.06 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1137  transcriptional regulator, ArsR family  36.11 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  36.49 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2163  ArsR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159359  decreased coverage  0.0016254 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  32.91 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>