92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4389 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3729  radical SAM domain-containing protein  87.28 
 
 		 393 aa  653    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0105628 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4389  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 393 aa  775    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.484216 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1798  Radical SAM domain protein  40.97 
 
 		 377 aa  297  2e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0702083  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2639  hypothetical protein  38.21 
 
 		 417 aa  261  1e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05010  Radical SAM domain protein  36.88 
 
 		 415 aa  257  2e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0108  Radical SAM domain protein  40.63 
 
 		 429 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0246  hypothetical protein  37.18 
 
 		 420 aa  251  2e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0306  hypothetical protein  37.34 
 
 		 418 aa  249  7e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0825598  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0668  Radical SAM domain protein  36.43 
 
 		 419 aa  248  1e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.332892  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12078  hypothetical protein  35.07 
 
 		 420 aa  247  2e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1282  radical SAM domain-containing protein  36.1 
 
 		 432 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0228  hypothetical protein  34.88 
 
 		 417 aa  245  9.999999999999999e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.008996 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1575  hypothetical protein  37.17 
 
 		 420 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00249963  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6622  radical SAM domain-containing protein  42.22 
 
 		 404 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.220752 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3695  Radical SAM domain protein  36.55 
 
 		 435 aa  244  3e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000234809  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1926  Radical SAM domain protein  33.78 
 
 		 415 aa  242  7.999999999999999e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000517647  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0393  Radical SAM domain protein  35.15 
 
 		 397 aa  241  1e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00226682  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3382  radical SAM domain-containing protein  39.69 
 
 		 428 aa  241  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1192  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  34.38 
 
 		 386 aa  241  2e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.052698  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0194  Radical SAM domain protein  35.45 
 
 		 418 aa  241  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.211109 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1900  radical SAM family protein  39.01 
 
 		 412 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.308107 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2003  Radical SAM domain protein  38.4 
 
 		 416 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2166  radical SAM domain-containing protein  41.22 
 
 		 386 aa  239  5.999999999999999e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.978798  hitchhiker  0.00000549931 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1787  radical SAM domain-containing protein  33.82 
 
 		 422 aa  238  1e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1202  Radical SAM domain protein  35.19 
 
 		 418 aa  238  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000160208  normal  0.825886 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1154  radical SAM family protein  37.56 
 
 		 502 aa  238  2e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.848409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2365  radical SAM family protein  36.41 
 
 		 406 aa  238  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0229751  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2501  radical SAM family protein  39.74 
 
 		 409 aa  236  4e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152187  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1724  Radical SAM domain protein  36.55 
 
 		 461 aa  236  6e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.408853  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2262  Radical SAM domain protein  39.42 
 
 		 403 aa  236  7e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.625043  normal  0.275727 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1467  radical SAM domain-containing protein  43.65 
 
 		 386 aa  235  8e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0281391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0407  radical SAM family protein  34.18 
 
 		 435 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00162852  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0320  hypothetical protein  35.84 
 
 		 419 aa  235  1.0000000000000001e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.354274 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2305  radical SAM domain-containing protein  39.42 
 
 		 403 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.146682  hitchhiker  0.00602825 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0124  radical SAM family protein  38.44 
 
 		 431 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0282893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2260  radical SAM domain-containing protein  38.74 
 
 		 406 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.249916  normal  0.262865 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0925  helix-hairpin-helix motif  32.42 
 
 		 425 aa  234  2.0000000000000002e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000510341 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0176  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 413 aa  234  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2258  Elongator protein 3/MiaB/NifB  38.34 
 
 		 414 aa  233  3e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.231457  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2580  radical SAM domain-containing protein  39.31 
 
 		 403 aa  234  3e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.542097 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4056  Radical SAM domain protein  35.79 
 
 		 418 aa  233  6e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0464079 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1155  Radical SAM domain protein  35.14 
 
 		 405 aa  233  6e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00303248  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3329  radical SAM domain-containing protein  38.24 
 
 		 431 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0826  radical SAM family protein  33.07 
 
 		 422 aa  232  9e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.243039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3540  radical SAM domain-containing protein  39.95 
 
 		 403 aa  232  9e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2067  radical SAM family protein  37.14 
 
 		 411 aa  232  1e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.408571  normal  0.630296 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1309  radical SAM domain-containing protein  39.09 
 
 		 423 aa  231  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2984  hypothetical protein  37.5 
 
 		 412 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0923725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4146  radical SAM domain-containing protein  36.7 
 
 		 403 aa  231  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2338  Radical SAM domain protein  38.48 
 
 		 402 aa  230  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.278935  normal  0.595723 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1336  hypothetical protein  34.04 
 
 		 379 aa  229  6e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00270043  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1713  Radical SAM domain protein  37.47 
 
 		 384 aa  229  6e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00398016  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0909  radical SAM domain-containing protein  38.74 
 
 		 406 aa  229  7e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.338541  normal  0.891076 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2852  radical SAM domain-containing protein  38.08 
 
 		 406 aa  229  9e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0978513 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2123  radical SAM domain-containing protein  37.59 
 
 		 406 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0767294  normal  0.422246 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1759  radical SAM family protein  38.7 
 
 		 411 aa  228  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2768  radical SAM domain-containing protein  38.93 
 
 		 406 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.723195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4594  radical SAM domain-containing protein  37.9 
 
 		 434 aa  227  3e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2234  DNA-binding protein  38.22 
 
 		 406 aa  226  6e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.62693  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15350  predicted DNA-binding protein with the helix-hairpin-helix motif  36.34 
 
 		 434 aa  226  6e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000164569  normal  0.0902203 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2924  radical SAM domain protein  38.67 
 
 		 416 aa  226  8e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09110  predicted DNA-binding protein with the helix-hairpin-helix motif protein  36.02 
 
 		 483 aa  224  2e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.567211  normal  0.851078 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7467  hypothetical protein  36.72 
 
 		 410 aa  223  4.9999999999999996e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2714  Radical SAM domain protein  37.34 
 
 		 414 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3469  radical SAM family protein  34.95 
 
 		 406 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2975  Radical SAM domain protein  37.86 
 
 		 414 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300716  normal  0.0745419 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03047  elongator protein 3/MiaB/NifB  37.81 
 
 		 414 aa  220  3e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0347  hypothetical protein  33.68 
 
 		 420 aa  219  7e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01933  Radical SAM  36.11 
 
 		 413 aa  218  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4606  radical SAM domain-containing protein  38.22 
 
 		 410 aa  213  3.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0681  radical SAM domain-containing protein  32.01 
 
 		 370 aa  212  1e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0554713  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0496  radical SAM family protein  34.97 
 
 		 469 aa  210  3e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3584  radical SAM family protein  34.81 
 
 		 413 aa  210  3e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0251  radical SAM domain-containing protein  35.31 
 
 		 372 aa  209  7e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.996674  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2040  radical SAM family protein  35.94 
 
 		 421 aa  209  9e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4849  radical SAM domain-containing protein  37.67 
 
 		 439 aa  205  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0188693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1032  hypothetical protein  37.54 
 
 		 348 aa  179  9e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0388  radical SAM domain-containing protein  40.4 
 
 		 400 aa  177  2e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1942  hypothetical protein  35.77 
 
 		 298 aa  160  3e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0818  radical SAM domain-containing protein  41.21 
 
 		 539 aa  139  7.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1147  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.65 
 
 		 377 aa  49.7  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000413421  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1164  Radical SAM domain protein  25.15 
 
 		 331 aa  47.8  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1756  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  36.92 
 
 		 181 aa  45.8  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2088  Radical SAM domain protein  34.07 
 
 		 351 aa  45.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1699  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  35.38 
 
 		 181 aa  45.1  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1520  Radical SAM domain protein  22.46 
 
 		 310 aa  45.1  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1065  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.09 
 
 		 381 aa  44.7  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1188  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.09 
 
 		 381 aa  44.7  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1668  Elongator protein 3/MiaB/NifB  21.91 
 
 		 612 aa  44.3  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0607785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0705  radical SAM domain-containing protein  22.61 
 
 		 283 aa  43.5  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0513  Radical SAM domain protein  23.04 
 
 		 609 aa  43.5  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2062  radical SAM domain-containing protein  25.35 
 
 		 341 aa  43.1  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.539759 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>