38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2062 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2062  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
341 aa  704    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.539759 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1789  radical SAM domain-containing protein  64.94 
 
 
341 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0106  Radical SAM domain protein  62.8 
 
 
343 aa  415  9.999999999999999e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0784  radical SAM family protein  55.15 
 
 
337 aa  377  1e-103  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00132902  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0117  hypothetical protein  53.61 
 
 
334 aa  363  2e-99  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0273  hypothetical protein  46.18 
 
 
353 aa  295  6e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.888723  normal  0.245364 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0043  radical SAM family Fe-S protein  43.45 
 
 
348 aa  266  5e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0016  radical SAM domain-containing protein  44.21 
 
 
344 aa  245  8e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.238462  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0312  Radical SAM domain protein  40.23 
 
 
332 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.139539 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0772  Radical SAM domain protein  39.09 
 
 
353 aa  233  3e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00827536  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0936  Radical SAM domain protein  39.88 
 
 
343 aa  232  7.000000000000001e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.674566 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1383  Radical SAM domain protein  39.7 
 
 
331 aa  229  4e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632636  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1246  Radical SAM domain protein  36.83 
 
 
346 aa  228  2e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3338  Radical SAM domain protein  38.21 
 
 
331 aa  223  3e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0439  radical SAM domain-containing protein  38.39 
 
 
371 aa  217  2e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0398  radical SAM domain-containing protein  40.43 
 
 
371 aa  211  2e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0698777  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0508  radical SAM domain-containing protein  39.29 
 
 
373 aa  210  3e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1481  radical SAM domain-containing protein  37.65 
 
 
371 aa  210  3e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0924558  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0983  radical SAM domain-containing protein  36.3 
 
 
380 aa  181  1e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.156314  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2157  radical SAM domain-containing protein  35.27 
 
 
343 aa  180  2.9999999999999997e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.350893  hitchhiker  0.000485535 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1063  Radical SAM domain protein  34.71 
 
 
350 aa  178  9e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.540032  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0964  radical SAM domain-containing protein  37.72 
 
 
300 aa  160  3e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0768  radical SAM domain-containing protein  35.13 
 
 
300 aa  159  5e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00853946 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1414  radical SAM domain-containing protein  37.09 
 
 
290 aa  155  7e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1901  radical SAM domain-containing protein  37.68 
 
 
298 aa  155  7e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.844314  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0464  radical SAM domain-containing protein  36.62 
 
 
353 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1369  hypothetical protein  28.86 
 
 
471 aa  108  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1025  Radical SAM domain protein  27.44 
 
 
409 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3410  Radical SAM domain protein  26.48 
 
 
433 aa  62  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.736979  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1387  radical SAM family protein  25.72 
 
 
441 aa  57.8  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2369  Radical SAM domain protein  27.7 
 
 
435 aa  56.2  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0697954  normal  0.318858 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2925  Radical SAM domain protein  25.49 
 
 
440 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000258536  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00200  pyruvate formate-lyase activating-like enzyme  22.22 
 
 
464 aa  49.3  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.158297  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2101  radical SAM family protein  23.22 
 
 
417 aa  48.1  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05050  pyruvate formate-lyase activating-like enzyme  24.83 
 
 
457 aa  44.3  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4389  radical SAM domain-containing protein  25.35 
 
 
393 aa  42.7  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.484216 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0301  radical SAM family Fe-S protein  32.04 
 
 
206 aa  42.7  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.239452  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1782  Radical SAM domain protein  36.07 
 
 
404 aa  42.4  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>