More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4065 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4065  methyltransferase type 11  100 
 
 		 295 aa  595  1e-169  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.991618  normal  0.0815821 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0603  methyltransferase type 11  87.02 
 
 		 288 aa  511  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000027512  unclonable  0.00000842033 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  32.46 
 
 		 237 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  30.06 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  29.15 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  34.96 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3949  methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 513 aa  63.2  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6253  methyltransferase domain-containing protein  27.83 
 
 		 276 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  35.2 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  30.13 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  31.71 
 
 		 711 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0958  Methyltransferase type 11  32.58 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  33.61 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2461  Methyltransferase type 11  30.47 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 		 710 aa  57  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3989  Methyltransferase type 11  29.66 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169635  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  31.9 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  29.75 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  36.67 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0208  methyltransferase type 11  31.62 
 
 		 252 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  37.27 
 
 		 262 aa  55.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  31.75 
 
 		 284 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  26.06 
 
 		 243 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  26.06 
 
 		 243 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72050  hypothetical protein  28.7 
 
 		 278 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.892313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  26.06 
 
 		 243 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0636  Methyltransferase type 11  26.76 
 
 		 228 aa  53.5  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0381586  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20210  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.71 
 
 		 278 aa  53.1  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  34.91 
 
 		 457 aa  53.5  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  39.22 
 
 		 287 aa  53.1  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  38.18 
 
 		 274 aa  53.1  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0264  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 252 aa  53.1  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2218  Methyltransferase type 11  27.2 
 
 		 254 aa  53.1  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5473  methyltransferase type 11  26.36 
 
 		 293 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.418833 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0807  type 11 methyltransferase  31.67 
 
 		 245 aa  52.4  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.887141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  32.52 
 
 		 255 aa  52.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  29.06 
 
 		 241 aa  52  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  24.4 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6255  methyltransferase domain-containing protein  27.27 
 
 		 257 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.88528  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  30.71 
 
 		 240 aa  52  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  30.91 
 
 		 225 aa  52  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  32.14 
 
 		 312 aa  51.6  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1102  methyltransferase type 11  30.1 
 
 		 249 aa  51.6  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  32.73 
 
 		 269 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.97 
 
 		 201 aa  51.2  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  27.42 
 
 		 239 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0218  methyltransferase type 11  30.88 
 
 		 252 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.679298  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  25.45 
 
 		 238 aa  51.6  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0228  methyltransferase type 11  30.88 
 
 		 252 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  29.06 
 
 		 241 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  26.16 
 
 		 238 aa  51.2  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5676  hypothetical protein  22.86 
 
 		 272 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.636295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0854  methyltransferase type 11  49.02 
 
 		 266 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.860107  normal  0.0122771 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5232  methyltransferase type 11  34.43 
 
 		 352 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0251  methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 165 aa  50.4  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.999818 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3035  Methyltransferase type 11  34.58 
 
 		 286 aa  50.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000393102  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.02 
 
 		 230 aa  50.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  37.39 
 
 		 282 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2718  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.51 
 
 		 230 aa  50.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.566379 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2861  methyltransferase type 12  28.68 
 
 		 508 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.751263  normal  0.700451 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1761  methyltransferase type 11  32.94 
 
 		 257 aa  50.4  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2465  hypothetical protein  30.23 
 
 		 246 aa  50.1  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16743  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3960  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.58 
 
 		 251 aa  50.1  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0746465 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72030  hypothetical protein  28.95 
 
 		 287 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4218  methyltransferase type 11  29.32 
 
 		 261 aa  50.1  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6455  methyltransferase type 11  33.61 
 
 		 316 aa  49.7  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00745461 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0807  methyltransferase type 11  31.75 
 
 		 267 aa  49.7  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1474  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.15 
 
 		 255 aa  49.7  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  34.86 
 
 		 328 aa  49.7  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  27.64 
 
 		 289 aa  49.7  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4146  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.87 
 
 		 251 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4057  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.87 
 
 		 251 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0455  methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 264 aa  49.7  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5274  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.87 
 
 		 251 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.123369  normal  0.211011 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4216  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.87 
 
 		 251 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227535 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4305  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.87 
 
 		 251 aa  49.7  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4175  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.87 
 
 		 251 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0103348 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4354  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.87 
 
 		 251 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.556022  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  29.73 
 
 		 268 aa  49.3  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 273 aa  48.5  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  29.09 
 
 		 265 aa  48.5  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3232  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.85 
 
 		 240 aa  48.9  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  28.18 
 
 		 215 aa  48.9  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2520  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.13 
 
 		 233 aa  48.9  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.783143  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2633  hypothetical protein  30.84 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1078  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.43 
 
 		 330 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.77 
 
 		 280 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4250  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.17 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4357  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.17 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  32.26 
 
 		 261 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4297  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.17 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  24.84 
 
 		 274 aa  48.5  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4201  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.17 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4178  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.17 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.962772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0395  biotin biosynthesis protein BioC  33.04 
 
 		 272 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0883344  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1953  Methyltransferase type 11  44.9 
 
 		 191 aa  48.1  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.520694 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  32.17 
 
 		 279 aa  48.1  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4520  methyltransferase domain protein  29.81 
 
 		 783 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  26.85 
 
 		 261 aa  47.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5629  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 263 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879577  normal  0.697867 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>