More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3942 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1104  glycosyl transferase, group 1  90.66 
 
 		 396 aa  739    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0552505  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3942  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 395 aa  804    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.520896 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3353  glycosyl transferase group 1  47.51 
 
 		 381 aa  356  2.9999999999999997e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207762  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0395  glycosyl transferase group 1  39.11 
 
 		 378 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.988234  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2571  glycosyl transferase group 1  45.67 
 
 		 386 aa  323  4e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0582  glycosyl transferase group 1  39.21 
 
 		 374 aa  315  7e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.838889  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  42.93 
 
 		 375 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3116  glycosyl transferase group 1  34.22 
 
 		 377 aa  220  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.304233 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2306  glycosyl transferase group 1  32.02 
 
 		 379 aa  210  4e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.455622  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2282  glycosyl transferase group 1  35.68 
 
 		 381 aa  202  7e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.823032  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2442  glycosyl transferase, group 1  33.6 
 
 		 382 aa  202  8e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0255  glycosyl transferase group 1  37.06 
 
 		 358 aa  200  3e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0241  lipopolysaccharide transferase family protein  33.8 
 
 		 384 aa  192  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0168  glycosyl transferase  36.21 
 
 		 374 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.627515 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1868  glycosyl transferase  34.14 
 
 		 375 aa  179  8e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4092  glycosyl transferase group 1  36.11 
 
 		 359 aa  170  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2522  glycosyl transferase  34.77 
 
 		 364 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.810552  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2075  glycosyl transferase group 1  31.55 
 
 		 381 aa  163  6e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2856  glycosyl transferase, group 1  32.66 
 
 		 388 aa  161  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0732  group 1 glycosyl transferase  35.52 
 
 		 358 aa  158  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0243925 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0731  glycosyl transferase, group 1  33.6 
 
 		 397 aa  153  4e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.238036 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3865  glycosyl transferase group 1  33.51 
 
 		 666 aa  151  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00141274 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1369  Glycosyltransferase-like protein  32.71 
 
 		 357 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.473124  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3774  glycosyl transferase group 1  30.75 
 
 		 372 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.904998 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  34.43 
 
 		 382 aa  136  5e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5882  glycosyl transferase group 1  32.32 
 
 		 405 aa  129  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1996  glycosyl transferase group 1  30.9 
 
 		 364 aa  123  6e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  30.09 
 
 		 374 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0676  glycosyl transferase, group 1  32.6 
 
 		 396 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.063849  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6430  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 		 366 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.706841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0250  glycosyl transferase, group 1  39.26 
 
 		 374 aa  103  8e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.430935  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5248  glycosyl transferase, group 1  35.45 
 
 		 393 aa  100  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663702 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1498  glycosyl transferase, group 1  37.58 
 
 		 392 aa  100  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3694  glycosyl transferase, group 1  34.29 
 
 		 401 aa  97.4  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.414804 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6234  glycosyl transferase group 1  31.16 
 
 		 366 aa  94.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130468  normal  0.465121 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0095  glycosyl transferase group 1  35.42 
 
 		 378 aa  89  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  26.08 
 
 		 360 aa  88.6  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4250  glycosyl transferase group 1  26.06 
 
 		 388 aa  87  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.142252  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  35.29 
 
 		 419 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  37.01 
 
 		 376 aa  84.3  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3138  glycosyltransferase (group I)  27 
 
 		 797 aa  83.2  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150629  normal  0.748341 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  32.24 
 
 		 378 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.37 
 
 		 360 aa  81.6  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4909  group 1 glycosyl transferase  27.11 
 
 		 364 aa  82  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  35.88 
 
 		 453 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  36.52 
 
 		 385 aa  80.9  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0284  glycosyl transferase group 1  27.97 
 
 		 780 aa  81.3  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  34.27 
 
 		 410 aa  80.1  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  31.46 
 
 		 650 aa  80.5  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0723  glycosyltransferase-like protein  31.91 
 
 		 396 aa  80.5  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  30.56 
 
 		 358 aa  79.7  0.00000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  34.36 
 
 		 376 aa  79.3  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  31.52 
 
 		 378 aa  79.3  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  36.14 
 
 		 440 aa  79.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  33.73 
 
 		 401 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  36.16 
 
 		 374 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0925  glycosyl transferase, group 1  26.86 
 
 		 761 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.259199  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1455  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 		 759 aa  78.6  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.402299  normal  0.663839 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  34.68 
 
 		 415 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  36.2 
 
 		 396 aa  77.4  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0557  glycosyl transferase group 1  32.45 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  32.86 
 
 		 423 aa  76.6  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2900  glycosyl transferase, group 1  34.09 
 
 		 421 aa  77  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  34.73 
 
 		 360 aa  77  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  35 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  35.62 
 
 		 457 aa  76.3  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  33.73 
 
 		 424 aa  76.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  30.94 
 
 		 420 aa  76.3  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 		 420 aa  76.3  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3296  glycosyl transferase, group 1  33.89 
 
 		 375 aa  76.3  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6075  glycosyl transferase group 1  31.19 
 
 		 390 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.353621  normal  0.425913 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1675  glycosyl transferase, group 1  29.72 
 
 		 366 aa  75.5  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.447182  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  32.27 
 
 		 377 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1527  glycosyl transferase, group 1  31.14 
 
 		 384 aa  75.5  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.161562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2023  glycosyl transferase, group 1  27.92 
 
 		 401 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.334553  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  30.82 
 
 		 375 aa  75.1  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  33.54 
 
 		 748 aa  74.7  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  36.73 
 
 		 383 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28310  glycosyltransferase  37.5 
 
 		 417 aa  74.7  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0640064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3285  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 375 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3347  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 375 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0957138  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1060  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 		 789 aa  74.7  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126752 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1066  glycosyl transferase group 1  29.71 
 
 		 385 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.552097 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1240  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 		 395 aa  73.9  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  35.09 
 
 		 420 aa  73.6  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3550  glycosyl transferase, group 1  34.25 
 
 		 378 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.750733 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  25.78 
 
 		 419 aa  73.6  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22830  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 		 385 aa  73.6  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0050  glycosyl transferase  25.2 
 
 		 360 aa  73.2  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000688339  normal  0.0134291 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  32.52 
 
 		 386 aa  73.2  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2186  glycosyl transferase group 1  34.51 
 
 		 378 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4244  glycosyl transferase, group 1  31.91 
 
 		 417 aa  72.4  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.772955 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4124  glycosyl transferase, group 1  33.1 
 
 		 349 aa  72.4  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3514  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 376 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3058  glycosyl transferase, group 1  37.16 
 
 		 453 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376863  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.71 
 
 		 371 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  32.16 
 
 		 419 aa  72  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2909  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 		 362 aa  71.6  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22800  glycosyl transferase group 1  21.92 
 
 		 359 aa  72  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  32.9 
 
 		 386 aa  71.6  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>