38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2753 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2753  FG-GAP repeat-containing protein  100 
 
 		 797 aa  1592    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2511  FG-GAP repeat-containing protein  80.51 
 
 		 785 aa  1132    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.377601  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0837  FG-GAP repeat protein  29.35 
 
 		 895 aa  92.8  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6339  FG-GAP repeat protein  24.79 
 
 		 406 aa  75.1  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3929  FG-GAP repeat protein  24.51 
 
 		 407 aa  64.3  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  24.23 
 
 		 1126 aa  63.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  25.42 
 
 		 872 aa  62.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1655  FG-GAP repeat-containing protein  27.72 
 
 		 389 aa  62  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418657  normal  0.573557 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4537  FG-GAP repeat-containing protein  24.06 
 
 		 402 aa  59.7  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.578932 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  28.45 
 
 		 803 aa  59.3  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3417  esterase  28 
 
 		 379 aa  58.5  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.745885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  30.7 
 
 		 8871 aa  56.2  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1753  FG-GAP repeat-containing protein  22.77 
 
 		 768 aa  55.1  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000543044  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  32.37 
 
 		 1490 aa  53.5  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3594  integrin-like protein  26.36 
 
 		 485 aa  53.5  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  24.45 
 
 		 1289 aa  51.6  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  29.82 
 
 		 616 aa  51.6  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  25.81 
 
 		 1208 aa  50.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  23.46 
 
 		 2807 aa  50.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0487  hypothetical protein  27.15 
 
 		 438 aa  49.7  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  20.95 
 
 		 1348 aa  48.9  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  25.78 
 
 		 447 aa  48.5  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2320  FG-GAP repeat-containing protein  24.46 
 
 		 437 aa  48.5  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600513  normal  0.0195588 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4551  FG-GAP repeat protein  31.36 
 
 		 389 aa  48.1  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.728727 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  24.93 
 
 		 1019 aa  48.1  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3145  FG-GAP repeat protein  24.53 
 
 		 1346 aa  47  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  23.55 
 
 		 3197 aa  47  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1785  FG-GAP repeat protein  27.39 
 
 		 413 aa  47  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320028  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  23.56 
 
 		 1838 aa  46.6  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  22.88 
 
 		 1124 aa  45.8  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  25.11 
 
 		 1557 aa  46.2  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3577  FG-GAP repeat protein  24.88 
 
 		 1022 aa  45.4  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287898 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2985  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.11 
 
 		 620 aa  45.4  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  29.61 
 
 		 1437 aa  45.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  23.81 
 
 		 1129 aa  45.4  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3146  FG-GAP repeat protein  20.49 
 
 		 1337 aa  44.7  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  24.16 
 
 		 1088 aa  44.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0593  hypothetical protein  30.93 
 
 		 435 aa  44.3  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>