More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2030 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2030  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 303 aa  578  1e-164  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550332  normal  0.807952 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1750  porphobilinogen deaminase  88.45 
 
 		 303 aa  515  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3548  porphobilinogen deaminase  67.22 
 
 		 300 aa  377  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0220b  porphobilinogen deaminase  52.7 
 
 		 311 aa  299  5e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.824174  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3642  porphobilinogen deaminase  49.5 
 
 		 310 aa  293  3e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3980  porphobilinogen deaminase  54 
 
 		 313 aa  291  6e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  52.03 
 
 		 314 aa  291  1e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00314  porphobilinogen deaminase  51.17 
 
 		 312 aa  286  2e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1287  porphobilinogen deaminase  51.82 
 
 		 310 aa  285  9e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0373  porphobilinogen deaminase  51.5 
 
 		 310 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4171  porphobilinogen deaminase  53 
 
 		 313 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00534991  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002106  porphobilinogen deaminase  50.84 
 
 		 312 aa  284  1.0000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3063  porphobilinogen deaminase  51.83 
 
 		 315 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4133  porphobilinogen deaminase  50.5 
 
 		 309 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  50.5 
 
 		 317 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4151  porphobilinogen deaminase  52.67 
 
 		 313 aa  282  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4327  porphobilinogen deaminase  52.67 
 
 		 313 aa  282  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4166  porphobilinogen deaminase  52.67 
 
 		 320 aa  282  6.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000281942  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4220  porphobilinogen deaminase  52.67 
 
 		 320 aa  282  6.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.782422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4268  porphobilinogen deaminase  52.67 
 
 		 318 aa  281  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1289  porphobilinogen deaminase  52.41 
 
 		 324 aa  281  8.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0440  porphobilinogen deaminase  50.67 
 
 		 309 aa  280  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  50 
 
 		 309 aa  279  5e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0228  porphobilinogen deaminase  53.31 
 
 		 313 aa  278  6e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  49.5 
 
 		 318 aa  278  7e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2398  porphobilinogen deaminase  51.34 
 
 		 317 aa  278  8e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0564467  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0536  porphobilinogen deaminase  51.51 
 
 		 313 aa  276  2e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4313  porphobilinogen deaminase  49 
 
 		 310 aa  276  2e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0178  porphobilinogen deaminase  51.68 
 
 		 313 aa  277  2e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0266595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0388  porphobilinogen deaminase  49 
 
 		 310 aa  277  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.571998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3638  porphobilinogen deaminase  49 
 
 		 310 aa  277  2e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0386  porphobilinogen deaminase  49 
 
 		 310 aa  277  2e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00551577  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4174  porphobilinogen deaminase  50.5 
 
 		 320 aa  276  3e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.31528  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4025  porphobilinogen deaminase  50.5 
 
 		 320 aa  276  3e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.105851  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0359  porphobilinogen deaminase  48.17 
 
 		 318 aa  276  3e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4170  porphobilinogen deaminase  50.5 
 
 		 318 aa  276  3e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.473943 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4202  porphobilinogen deaminase  50.5 
 
 		 320 aa  276  3e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0198  porphobilinogen deaminase  51.51 
 
 		 313 aa  276  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00764984  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0483  porphobilinogen deaminase  49.5 
 
 		 309 aa  276  3e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03680  porphobilinogen deaminase  50.5 
 
 		 313 aa  275  5e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184348  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03629  hypothetical protein  50.5 
 
 		 313 aa  275  5e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.193331  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5243  porphobilinogen deaminase  50.5 
 
 		 318 aa  275  6e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0342  porphobilinogen deaminase  47.99 
 
 		 309 aa  275  6e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0685  hydroxymethylbilane synthase  49.17 
 
 		 306 aa  275  8e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4320  porphobilinogen deaminase  50.17 
 
 		 320 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.365174  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4094  porphobilinogen deaminase  49 
 
 		 310 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0502  porphobilinogen deaminase  49.01 
 
 		 310 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4264  porphobilinogen deaminase  50.17 
 
 		 320 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0408  porphobilinogen deaminase  47.51 
 
 		 318 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4016  porphobilinogen deaminase  51.17 
 
 		 313 aa  274  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.602391  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3254  porphobilinogen deaminase  49.5 
 
 		 326 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.290134 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3587  porphobilinogen deaminase  48.67 
 
 		 310 aa  273  3e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0388  porphobilinogen deaminase  50.34 
 
 		 315 aa  273  3e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.895145  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0408  porphobilinogen deaminase  47.84 
 
 		 318 aa  273  3e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0179  porphobilinogen deaminase  51.34 
 
 		 322 aa  272  4.0000000000000004e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00121296  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3901  porphobilinogen deaminase  48.67 
 
 		 310 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1025  porphobilinogen deaminase  51 
 
 		 310 aa  271  7e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0857406  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3978  porphobilinogen deaminase  48.67 
 
 		 310 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4000  porphobilinogen deaminase  48.67 
 
 		 310 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.799289  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0502  porphobilinogen deaminase  51.01 
 
 		 312 aa  271  1e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000513467  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2492  porphobilinogen deaminase  51.01 
 
 		 314 aa  269  4e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39329  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2568  porphobilinogen deaminase  52.33 
 
 		 306 aa  268  5.9999999999999995e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0824843 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3060  porphobilinogen deaminase  49.67 
 
 		 351 aa  268  7e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0074  porphobilinogen deaminase  48.37 
 
 		 317 aa  268  8.999999999999999e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3987  porphobilinogen deaminase  50.5 
 
 		 313 aa  267  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  44.92 
 
 		 310 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2032  porphobilinogen deaminase  48.84 
 
 		 320 aa  265  5e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.759518 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2007  porphobilinogen deaminase  48.84 
 
 		 320 aa  266  5e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1363  porphobilinogen deaminase  50.34 
 
 		 314 aa  264  1e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1460  porphobilinogen deaminase  50.34 
 
 		 314 aa  264  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05591  porphobilinogen deaminase  44.88 
 
 		 316 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0584  porphobilinogen deaminase  49.35 
 
 		 317 aa  263  3e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.415079 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3180  porphobilinogen deaminase  44.85 
 
 		 309 aa  263  3e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0012  porphobilinogen deaminase  52.43 
 
 		 315 aa  263  3e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.625024 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3591  porphobilinogen deaminase  46.36 
 
 		 326 aa  263  3e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3234  porphobilinogen deaminase  46.18 
 
 		 318 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00122468  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3109  hydroxymethylbilane synthase  49.83 
 
 		 311 aa  262  4.999999999999999e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.324742  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4621  porphobilinogen deaminase  44.7 
 
 		 320 aa  262  4.999999999999999e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0044  porphobilinogen deaminase  46.82 
 
 		 321 aa  262  6e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3375  porphobilinogen deaminase  48.83 
 
 		 310 aa  261  6.999999999999999e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4774  porphobilinogen deaminase  46.05 
 
 		 336 aa  261  8.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1375  porphobilinogen deaminase  50.34 
 
 		 313 aa  261  8.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3530  porphobilinogen deaminase  52.33 
 
 		 303 aa  261  1e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0061  porphobilinogen deaminase  45.87 
 
 		 311 aa  261  1e-68  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1887  porphobilinogen deaminase  48.18 
 
 		 314 aa  259  3e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2563  porphobilinogen deaminase  47.49 
 
 		 311 aa  259  4e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4600  porphobilinogen deaminase  44.33 
 
 		 309 aa  259  4e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4968  porphobilinogen deaminase  45.87 
 
 		 322 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05521  porphobilinogen deaminase  44.88 
 
 		 316 aa  258  6e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.132832  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1249  porphobilinogen deaminase  50.5 
 
 		 313 aa  259  6e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.280442 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0029  Hydroxymethylbilane synthase  48.68 
 
 		 316 aa  258  7e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.943678  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0112  porphobilinogen deaminase  48.01 
 
 		 309 aa  258  8e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05221  porphobilinogen deaminase  44.55 
 
 		 316 aa  258  9e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1251  porphobilinogen deaminase  45.15 
 
 		 309 aa  258  1e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4555  porphobilinogen deaminase  44.33 
 
 		 309 aa  258  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4197  porphobilinogen deaminase  44.33 
 
 		 309 aa  258  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4551  porphobilinogen deaminase  44 
 
 		 309 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1815  porphobilinogen deaminase  48.01 
 
 		 304 aa  258  1e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4361  porphobilinogen deaminase  44 
 
 		 309 aa  257  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.448902  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0208  porphobilinogen deaminase  46.2 
 
 		 320 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.492293 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>