55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0614 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0614  hypothetical protein  100 
 
 		 402 aa  754    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.0633973 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2294  hypothetical protein  82.61 
 
 		 319 aa  447  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.24692  normal  0.213826 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3486  hypothetical protein  83.2 
 
 		 340 aa  417  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.956349 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3395  hypothetical protein  82.38 
 
 		 376 aa  397  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1441  hypothetical protein  83.12 
 
 		 339 aa  394  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.958123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3867  hypothetical protein  83.83 
 
 		 350 aa  389  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679985  normal  0.332128 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4427  hypothetical protein  81.94 
 
 		 290 aa  387  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145713  normal  0.510849 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3655  hypothetical protein  80.6 
 
 		 314 aa  358  7e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.643  normal  0.782958 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4135  hypothetical protein  74.03 
 
 		 289 aa  354  1e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2797  hypothetical protein  81.12 
 
 		 312 aa  349  4e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0437541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0728  hypothetical protein  81.65 
 
 		 343 aa  346  4e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2241  hypothetical protein  74.79 
 
 		 345 aa  344  1e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1217  hypothetical protein  75.62 
 
 		 314 aa  342  5e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.782404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2909  hypothetical protein  78.88 
 
 		 310 aa  333  2e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3746  hypothetical protein  75.32 
 
 		 321 aa  327  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.55082  hitchhiker  0.000155287 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0652  hypothetical protein  53.59 
 
 		 333 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3709  hypothetical protein  49.2 
 
 		 319 aa  220  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00298451 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3711  hypothetical protein  48.85 
 
 		 332 aa  220  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.642224  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1561  hypothetical protein  50.45 
 
 		 300 aa  219  5e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0918  hypothetical protein  52.8 
 
 		 302 aa  219  8.999999999999998e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176783 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2640  hypothetical protein  50.81 
 
 		 257 aa  218  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.806273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3710  hypothetical protein  48.56 
 
 		 330 aa  206  7e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.395031  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2206  hypothetical protein  54.05 
 
 		 160 aa  155  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.404614  normal  0.720975 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0779  hypothetical protein  45.45 
 
 		 249 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.927601  normal  0.868824 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3885  protein of unknown function DUF820  36 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0724109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4571  hypothetical protein  31.3 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0201  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.41 
 
 		 491 aa  63.2  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00197589  decreased coverage  0.000000348094 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5328  phage minor structural protein  29.74 
 
 		 2196 aa  63.2  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2194  hypothetical protein  33.46 
 
 		 258 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2633  protein of unknown function DUF820  31.8 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.37277 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1520  hypothetical protein  42.35 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3298  flagellar hook-length control protein  28.86 
 
 		 602 aa  56.2  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3409  hypothetical protein  43.53 
 
 		 235 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.186244  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3484  protein of unknown function DUF820  36.15 
 
 		 225 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3408  hypothetical protein  43.53 
 
 		 249 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.316988  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0118  hypothetical protein  36.08 
 
 		 254 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2193  hypothetical protein  31.98 
 
 		 244 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0882  protein of unknown function DUF820  29.38 
 
 		 284 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.010989  normal  0.659091 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3424  protein of unknown function DUF820  33.82 
 
 		 237 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.888337  normal  0.620139 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2759  3D domain-containing protein  42.47 
 
 		 575 aa  50.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00579221  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2205  hypothetical protein  38.03 
 
 		 108 aa  50.1  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.737642  normal  0.905807 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4319  protein of unknown function DUF820  29.71 
 
 		 272 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1058  large adhesin  28.03 
 
 		 2906 aa  49.7  0.00009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3392  hypothetical protein  44.33 
 
 		 2400 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000447967 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2227  hypothetical protein  34.86 
 
 		 241 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0420  hypothetical protein  26.9 
 
 		 236 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0795  hypothetical protein  40 
 
 		 287 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  34.69 
 
 		 926 aa  44.3  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0022  protein of unknown function DUF820  28.57 
 
 		 243 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4205  hypothetical protein  27.03 
 
 		 204 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.398339 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2705  hypothetical protein  39.16 
 
 		 524 aa  44.3  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2077  translation initiation factor IF-2  45.98 
 
 		 990 aa  43.9  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146331  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2165  translation initiation factor IF-2  47.78 
 
 		 959 aa  43.9  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34369  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3319  lytic transglycosylase, catalytic  32.26 
 
 		 718 aa  43.1  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33945  predicted protein  33.86 
 
 		 409 aa  42.7  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.913132  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>