69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0652 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0652  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  665    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3709  hypothetical protein  65.31 
 
 		 319 aa  358  5e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00298451 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3711  hypothetical protein  67.72 
 
 		 332 aa  353  2e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.642224  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3710  hypothetical protein  70.17 
 
 		 330 aa  346  3e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.395031  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2294  hypothetical protein  55.66 
 
 		 319 aa  285  9e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.24692  normal  0.213826 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0779  hypothetical protein  70.62 
 
 		 249 aa  285  9e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.927601  normal  0.868824 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0918  hypothetical protein  61.75 
 
 		 302 aa  269  5e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176783 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2640  hypothetical protein  55.56 
 
 		 257 aa  253  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.806273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3395  hypothetical protein  55.37 
 
 		 376 aa  251  1e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3486  hypothetical protein  54.02 
 
 		 340 aa  249  4e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.956349 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3867  hypothetical protein  55.27 
 
 		 350 aa  243  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679985  normal  0.332128 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4427  hypothetical protein  55.25 
 
 		 290 aa  241  7.999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145713  normal  0.510849 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1441  hypothetical protein  54.51 
 
 		 339 aa  232  7.000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.958123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2797  hypothetical protein  55.79 
 
 		 312 aa  230  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0437541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4135  hypothetical protein  52 
 
 		 289 aa  227  3e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3746  hypothetical protein  53.51 
 
 		 321 aa  224  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.55082  hitchhiker  0.000155287 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0614  hypothetical protein  54.72 
 
 		 402 aa  223  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.0633973 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1217  hypothetical protein  50.79 
 
 		 314 aa  223  4e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.782404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2241  hypothetical protein  50.2 
 
 		 345 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2909  hypothetical protein  54.09 
 
 		 310 aa  219  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3655  hypothetical protein  54.88 
 
 		 314 aa  217  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.643  normal  0.782958 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0728  hypothetical protein  53.6 
 
 		 343 aa  215  7e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2206  hypothetical protein  57.82 
 
 		 160 aa  162  7e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.404614  normal  0.720975 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4571  hypothetical protein  34.18 
 
 		 274 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0215  hypothetical protein  25 
 
 		 259 aa  65.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0180018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0266  protein of unknown function DUF820  27.33 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000132368  decreased coverage  0.00423088 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2205  hypothetical protein  34.52 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.737642  normal  0.905807 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1228  protein of unknown function DUF820  26.71 
 
 		 240 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.706034 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1252  protein of unknown function DUF820  27.22 
 
 		 247 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000809595  normal  0.287908 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1945  protein of unknown function DUF820  27.39 
 
 		 252 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1972  protein of unknown function DUF820  27.39 
 
 		 252 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000213894  normal  0.0132156 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2515  protein of unknown function DUF820  26.75 
 
 		 241 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3591  protein of unknown function DUF820  26.75 
 
 		 241 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0889916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1647  protein of unknown function DUF820  26.67 
 
 		 243 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1620  protein of unknown function DUF820  26.67 
 
 		 243 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0882  protein of unknown function DUF820  23.9 
 
 		 284 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.010989  normal  0.659091 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4319  protein of unknown function DUF820  25.89 
 
 		 272 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3264  protein of unknown function DUF820  28.37 
 
 		 210 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000019093  normal  0.268128 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1545  hypothetical protein  23.35 
 
 		 254 aa  54.3  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4990  protein of unknown function DUF820  29.66 
 
 		 226 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0672756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1780  protein of unknown function DUF820  30.63 
 
 		 281 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3344  hypothetical protein  23.93 
 
 		 256 aa  52  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0719317 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0118  hypothetical protein  27.85 
 
 		 254 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1187  protein of unknown function DUF820  33.76 
 
 		 235 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000133784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1317  protein of unknown function DUF820  23.72 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2287  protein of unknown function DUF820  24.73 
 
 		 239 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815689  hitchhiker  0.00756538 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0022  protein of unknown function DUF820  27.98 
 
 		 243 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2233  protein of unknown function DUF820  26.25 
 
 		 225 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1520  hypothetical protein  37.08 
 
 		 261 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0024  protein of unknown function DUF820  32.47 
 
 		 229 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2553  hypothetical protein  32.14 
 
 		 248 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.346144  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3409  hypothetical protein  33.06 
 
 		 235 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.186244  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2194  hypothetical protein  31.17 
 
 		 258 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3408  hypothetical protein  33.06 
 
 		 249 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.316988  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5551  protein of unknown function DUF820  26.86 
 
 		 212 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.540442 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1345  protein of unknown function DUF820  22.41 
 
 		 281 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.05834  unclonable  0.00000000208542 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1054  protein of unknown function DUF820  25 
 
 		 229 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.172098  hitchhiker  0.00807661 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1335  hypothetical protein  46.88 
 
 		 203 aa  43.9  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3885  protein of unknown function DUF820  28.5 
 
 		 231 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0724109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3484  protein of unknown function DUF820  33.94 
 
 		 225 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1227  protein of unknown function DUF820  29.87 
 
 		 217 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4500  hypothetical protein  24.6 
 
 		 260 aa  43.5  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1751  protein of unknown function DUF820  35.48 
 
 		 191 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0420  hypothetical protein  23.59 
 
 		 236 aa  43.1  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0097  protein of unknown function DUF820  25.2 
 
 		 248 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.609374 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0100  protein of unknown function DUF820  25.2 
 
 		 248 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1336  hypothetical protein  43.06 
 
 		 203 aa  42.7  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3424  protein of unknown function DUF820  28.38 
 
 		 237 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.888337  normal  0.620139 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1737  prevent-host-death family protein  31.25 
 
 		 241 aa  42.4  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000358134  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>