58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3711 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3711  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  648    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.642224  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3709  hypothetical protein  92.38 
 
 		 319 aa  494  1e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00298451 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3710  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  491  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.395031  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0652  hypothetical protein  68.18 
 
 		 333 aa  345  4e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0918  hypothetical protein  62.11 
 
 		 302 aa  283  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176783 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1561  hypothetical protein  58.67 
 
 		 300 aa  271  1e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0779  hypothetical protein  68.93 
 
 		 249 aa  262  4.999999999999999e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.927601  normal  0.868824 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2640  hypothetical protein  53.6 
 
 		 257 aa  253  3e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.806273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2294  hypothetical protein  50 
 
 		 319 aa  238  8e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.24692  normal  0.213826 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1217  hypothetical protein  50.83 
 
 		 314 aa  217  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.782404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2241  hypothetical protein  48.76 
 
 		 345 aa  216  5.9999999999999996e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3486  hypothetical protein  49.23 
 
 		 340 aa  211  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.956349 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3746  hypothetical protein  51.74 
 
 		 321 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.55082  hitchhiker  0.000155287 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4427  hypothetical protein  51.33 
 
 		 290 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145713  normal  0.510849 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4135  hypothetical protein  48.7 
 
 		 289 aa  210  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3395  hypothetical protein  50.41 
 
 		 376 aa  206  4e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3867  hypothetical protein  51.53 
 
 		 350 aa  205  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679985  normal  0.332128 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1441  hypothetical protein  50 
 
 		 339 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.958123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2797  hypothetical protein  51.3 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0437541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3655  hypothetical protein  48.92 
 
 		 314 aa  193  4e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.643  normal  0.782958 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0728  hypothetical protein  50.45 
 
 		 343 aa  190  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2909  hypothetical protein  49.78 
 
 		 310 aa  187  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0614  hypothetical protein  50.47 
 
 		 402 aa  186  7e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.0633973 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2206  hypothetical protein  51.25 
 
 		 160 aa  147  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.404614  normal  0.720975 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2205  hypothetical protein  45.12 
 
 		 108 aa  80.1  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.737642  normal  0.905807 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4571  hypothetical protein  30.21 
 
 		 274 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0882  protein of unknown function DUF820  28.26 
 
 		 284 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.010989  normal  0.659091 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4319  protein of unknown function DUF820  25.91 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2194  hypothetical protein  30.53 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1228  protein of unknown function DUF820  24.26 
 
 		 240 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.706034 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3344  hypothetical protein  28.1 
 
 		 256 aa  53.1  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0719317 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0266  protein of unknown function DUF820  24.48 
 
 		 226 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000132368  decreased coverage  0.00423088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1945  protein of unknown function DUF820  24.1 
 
 		 252 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1780  protein of unknown function DUF820  27.19 
 
 		 281 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0215  hypothetical protein  26.45 
 
 		 259 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0180018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1972  protein of unknown function DUF820  24.24 
 
 		 252 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000213894  normal  0.0132156 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2633  protein of unknown function DUF820  27.27 
 
 		 251 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.37277 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3591  protein of unknown function DUF820  24.55 
 
 		 241 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0889916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2515  protein of unknown function DUF820  24.55 
 
 		 241 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1252  protein of unknown function DUF820  26.47 
 
 		 247 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000809595  normal  0.287908 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1647  protein of unknown function DUF820  27.27 
 
 		 243 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4990  protein of unknown function DUF820  26.02 
 
 		 226 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0672756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1620  protein of unknown function DUF820  27.27 
 
 		 243 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2553  hypothetical protein  35.2 
 
 		 248 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.346144  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2193  hypothetical protein  28.52 
 
 		 244 aa  47  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4249  protein of unknown function DUF820  24.18 
 
 		 250 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000136516  unclonable  0.00000000239983 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4210  protein of unknown function DUF820  24.18 
 
 		 250 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1317  protein of unknown function DUF820  24.1 
 
 		 295 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3264  protein of unknown function DUF820  25.6 
 
 		 210 aa  46.2  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000019093  normal  0.268128 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2447  protein of unknown function DUF820  25.45 
 
 		 255 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0097  protein of unknown function DUF820  26.83 
 
 		 248 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.609374 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0100  protein of unknown function DUF820  26.83 
 
 		 248 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2195  hypothetical protein  26.7 
 
 		 230 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.478956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3663  protein of unknown function DUF820  26.88 
 
 		 255 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.730325  normal  0.78404 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5328  phage minor structural protein  32.38 
 
 		 2196 aa  43.9  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0388  protein of unknown function DUF820  23.12 
 
 		 256 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0379  protein of unknown function DUF820  23.12 
 
 		 256 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3375  hypothetical protein  28.42 
 
 		 245 aa  42.7  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>