55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2294 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2294  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  629  1e-179  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.24692  normal  0.213826 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3395  hypothetical protein  84.84 
 
 		 376 aa  402  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3486  hypothetical protein  83.86 
 
 		 340 aa  404  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.956349 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1441  hypothetical protein  84.1 
 
 		 339 aa  391  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.958123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3867  hypothetical protein  85.36 
 
 		 350 aa  394  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679985  normal  0.332128 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4427  hypothetical protein  81.58 
 
 		 290 aa  381  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145713  normal  0.510849 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2797  hypothetical protein  84.55 
 
 		 312 aa  367  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0437541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0728  hypothetical protein  84.55 
 
 		 343 aa  355  5.999999999999999e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0614  hypothetical protein  87.38 
 
 		 402 aa  354  1e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.0633973 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4135  hypothetical protein  75.66 
 
 		 289 aa  347  1e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3655  hypothetical protein  79.49 
 
 		 314 aa  338  5e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.643  normal  0.782958 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2241  hypothetical protein  74.69 
 
 		 345 aa  338  5.9999999999999996e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1217  hypothetical protein  75.1 
 
 		 314 aa  338  8e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.782404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2909  hypothetical protein  82.11 
 
 		 310 aa  329  3e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3746  hypothetical protein  79.44 
 
 		 321 aa  322  5e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.55082  hitchhiker  0.000155287 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0652  hypothetical protein  55.19 
 
 		 333 aa  263  4e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3709  hypothetical protein  50 
 
 		 319 aa  229  6e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00298451 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3711  hypothetical protein  50.63 
 
 		 332 aa  220  3e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.642224  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2640  hypothetical protein  50.81 
 
 		 257 aa  219  5e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.806273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0918  hypothetical protein  51.14 
 
 		 302 aa  217  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176783 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1561  hypothetical protein  52.15 
 
 		 300 aa  216  5.9999999999999996e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3710  hypothetical protein  50.21 
 
 		 330 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.395031  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2206  hypothetical protein  54.42 
 
 		 160 aa  155  6e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.404614  normal  0.720975 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0779  hypothetical protein  45.96 
 
 		 249 aa  144  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.927601  normal  0.868824 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4571  hypothetical protein  35.43 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2205  hypothetical protein  38.75 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.737642  normal  0.905807 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3484  protein of unknown function DUF820  30.73 
 
 		 225 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3885  protein of unknown function DUF820  31.72 
 
 		 231 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0724109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3409  hypothetical protein  43.53 
 
 		 235 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.186244  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0882  protein of unknown function DUF820  29.17 
 
 		 284 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.010989  normal  0.659091 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3209  hypothetical protein  32.54 
 
 		 200 aa  53.5  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3408  hypothetical protein  43.53 
 
 		 249 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.316988  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1520  hypothetical protein  40.7 
 
 		 261 aa  53.1  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0590  protein of unknown function DUF820  34.06 
 
 		 241 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2633  protein of unknown function DUF820  32.88 
 
 		 251 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.37277 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3424  protein of unknown function DUF820  32.86 
 
 		 237 aa  49.3  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.888337  normal  0.620139 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3403  protein of unknown function DUF820  27.27 
 
 		 256 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.320038 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4500  hypothetical protein  27.59 
 
 		 260 aa  47  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1714  protein of unknown function DUF820  36.25 
 
 		 189 aa  46.2  0.0007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000557218  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2466  hypothetical protein  34.72 
 
 		 245 aa  45.4  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.82595  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2194  hypothetical protein  28.24 
 
 		 258 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0118  hypothetical protein  33.33 
 
 		 254 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4461  hypothetical protein  32.73 
 
 		 201 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0215  hypothetical protein  23.51 
 
 		 259 aa  44.3  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0180018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4350  protein of unknown function DUF820  30.56 
 
 		 201 aa  44.3  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1255  protein of unknown function DUF820  43.94 
 
 		 189 aa  43.9  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1588  hypothetical protein  24.34 
 
 		 194 aa  43.9  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.856601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2193  hypothetical protein  27.96 
 
 		 244 aa  43.9  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2195  hypothetical protein  28.29 
 
 		 230 aa  43.5  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.478956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1187  protein of unknown function DUF820  30.16 
 
 		 235 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000133784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4246  protein of unknown function DUF820  30.12 
 
 		 194 aa  43.5  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  44.16 
 
 		 894 aa  43.1  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2910  hypothetical protein  32.94 
 
 		 265 aa  43.1  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.308542  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0890  protein of unknown function DUF820  32.2 
 
 		 203 aa  43.1  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.288036  normal  0.0388608 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0813  hypothetical protein  31.65 
 
 		 201 aa  42.7  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107511 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>