27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0779 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0779  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  502  1e-141  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.927601  normal  0.868824 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0652  hypothetical protein  71.51 
 
 
333 aa  276  3e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3709  hypothetical protein  69 
 
 
319 aa  268  4e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00298451 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3711  hypothetical protein  68.66 
 
 
332 aa  268  5e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.642224  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3710  hypothetical protein  68.66 
 
 
330 aa  268  8e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.395031  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0918  hypothetical protein  54.76 
 
 
302 aa  178  7e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.176783 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1561  hypothetical protein  52.98 
 
 
300 aa  176  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2640  hypothetical protein  47.85 
 
 
257 aa  170  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.806273  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2294  hypothetical protein  45.25 
 
 
319 aa  158  6e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.24692  normal  0.213826 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4427  hypothetical protein  47.27 
 
 
290 aa  135  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145713  normal  0.510849 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0728  hypothetical protein  47.13 
 
 
343 aa  129  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3486  hypothetical protein  43.94 
 
 
340 aa  129  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.956349 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4135  hypothetical protein  43.83 
 
 
289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1441  hypothetical protein  45.71 
 
 
339 aa  126  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.958123  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3395  hypothetical protein  44.13 
 
 
376 aa  124  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317872  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3867  hypothetical protein  44.13 
 
 
350 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679985  normal  0.332128 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2241  hypothetical protein  42.49 
 
 
345 aa  122  6e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0614  hypothetical protein  44.38 
 
 
402 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.0633973 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1217  hypothetical protein  42.49 
 
 
314 aa  120  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.782404  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2797  hypothetical protein  44.97 
 
 
312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0437541  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3655  hypothetical protein  47.34 
 
 
314 aa  119  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.643  normal  0.782958 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2909  hypothetical protein  45.56 
 
 
310 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11169  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3746  hypothetical protein  43.45 
 
 
321 aa  113  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.55082  hitchhiker  0.000155287 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2206  hypothetical protein  53.54 
 
 
160 aa  97.4  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.404614  normal  0.720975 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2205  hypothetical protein  32.14 
 
 
108 aa  52.4  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.737642  normal  0.905807 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4571  hypothetical protein  28.33 
 
 
274 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0266  protein of unknown function DUF820  26.27 
 
 
226 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000132368  decreased coverage  0.00423088 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>