87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0918 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0918  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  605  9.999999999999999e-173  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176783 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1561  hypothetical protein  80 
 
 		 300 aa  444  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2640  hypothetical protein  61.28 
 
 		 257 aa  292  4e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.806273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3711  hypothetical protein  59.84 
 
 		 332 aa  286  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.642224  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3710  hypothetical protein  61.86 
 
 		 330 aa  280  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.395031  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3709  hypothetical protein  61.25 
 
 		 319 aa  278  6e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00298451 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0652  hypothetical protein  59.31 
 
 		 333 aa  269  5e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2294  hypothetical protein  50.78 
 
 		 319 aa  239  5.999999999999999e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.24692  normal  0.213826 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3486  hypothetical protein  51 
 
 		 340 aa  215  5.9999999999999996e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.956349 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4427  hypothetical protein  51.1 
 
 		 290 aa  215  9e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145713  normal  0.510849 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1441  hypothetical protein  50.63 
 
 		 339 aa  211  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.958123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3395  hypothetical protein  53.1 
 
 		 376 aa  209  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3867  hypothetical protein  52.63 
 
 		 350 aa  209  5e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679985  normal  0.332128 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1217  hypothetical protein  48.36 
 
 		 314 aa  205  7e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.782404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2241  hypothetical protein  47.13 
 
 		 345 aa  205  8e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3746  hypothetical protein  49.34 
 
 		 321 aa  205  8e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.55082  hitchhiker  0.000155287 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0614  hypothetical protein  51.66 
 
 		 402 aa  200  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.0633973 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2797  hypothetical protein  51.63 
 
 		 312 aa  200  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0437541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0728  hypothetical protein  51.58 
 
 		 343 aa  199  7e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4135  hypothetical protein  47.69 
 
 		 289 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3655  hypothetical protein  46.96 
 
 		 314 aa  197  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.643  normal  0.782958 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2909  hypothetical protein  50 
 
 		 310 aa  194  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0779  hypothetical protein  51.74 
 
 		 249 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.927601  normal  0.868824 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2206  hypothetical protein  57.72 
 
 		 160 aa  172  6.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.404614  normal  0.720975 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2205  hypothetical protein  46.24 
 
 		 108 aa  81.6  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.737642  normal  0.905807 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4571  hypothetical protein  32.23 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0215  hypothetical protein  28.63 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0180018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0882  protein of unknown function DUF820  29.56 
 
 		 284 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.010989  normal  0.659091 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0068  protein of unknown function DUF820  25.45 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0022  protein of unknown function DUF820  27.07 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4438  protein of unknown function DUF820  26.29 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4319  protein of unknown function DUF820  29.95 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1228  protein of unknown function DUF820  27.17 
 
 		 240 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.706034 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1780  protein of unknown function DUF820  33.91 
 
 		 281 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2194  hypothetical protein  31.91 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2193  hypothetical protein  32.62 
 
 		 244 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1945  protein of unknown function DUF820  27.01 
 
 		 252 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1972  protein of unknown function DUF820  27.01 
 
 		 252 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000213894  normal  0.0132156 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2553  hypothetical protein  36.61 
 
 		 248 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.346144  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4249  protein of unknown function DUF820  24.07 
 
 		 250 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000136516  unclonable  0.00000000239983 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4210  protein of unknown function DUF820  24.07 
 
 		 250 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0024  protein of unknown function DUF820  26.2 
 
 		 229 aa  52.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0319  protein of unknown function DUF820  24.58 
 
 		 232 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191601 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0266  protein of unknown function DUF820  28.8 
 
 		 226 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000132368  decreased coverage  0.00423088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1620  protein of unknown function DUF820  27.01 
 
 		 243 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1647  protein of unknown function DUF820  27.01 
 
 		 243 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2195  hypothetical protein  32.78 
 
 		 230 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.478956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3264  protein of unknown function DUF820  29.6 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000019093  normal  0.268128 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3900  protein of unknown function DUF820  27.12 
 
 		 232 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0160105  normal  0.148171 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2287  protein of unknown function DUF820  26.01 
 
 		 239 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815689  hitchhiker  0.00756538 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4500  hypothetical protein  24.62 
 
 		 260 aa  50.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2633  protein of unknown function DUF820  32.83 
 
 		 251 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.37277 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1252  protein of unknown function DUF820  33.06 
 
 		 247 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000809595  normal  0.287908 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4990  protein of unknown function DUF820  28.46 
 
 		 226 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0672756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3591  protein of unknown function DUF820  27.53 
 
 		 241 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0889916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2515  protein of unknown function DUF820  27.53 
 
 		 241 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2576  protein of unknown function DUF820  26.96 
 
 		 227 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23751  normal  0.975603 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2233  protein of unknown function DUF820  26.09 
 
 		 225 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0118  hypothetical protein  26.8 
 
 		 254 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1054  protein of unknown function DUF820  23.66 
 
 		 229 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.172098  hitchhiker  0.00807661 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1052  protein of unknown function DUF820  31.62 
 
 		 187 aa  46.2  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.194748  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2447  protein of unknown function DUF820  31.22 
 
 		 255 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1298  hypothetical protein  30.06 
 
 		 262 aa  45.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1198  protein of unknown function DUF820  23.36 
 
 		 217 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3424  protein of unknown function DUF820  32.29 
 
 		 237 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.888337  normal  0.620139 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3571  protein of unknown function DUF820  30.23 
 
 		 222 aa  45.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.195938  normal  0.125466 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1227  protein of unknown function DUF820  23.36 
 
 		 217 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3851  protein of unknown function DUF820  26.89 
 
 		 218 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0601  protein of unknown function DUF820  34.75 
 
 		 222 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2196  hypothetical protein  29.03 
 
 		 217 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.203232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1929  prevent-host-death family protein  35.8 
 
 		 251 aa  44.3  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3484  protein of unknown function DUF820  35.16 
 
 		 225 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3885  protein of unknown function DUF820  34.03 
 
 		 231 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0724109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1545  hypothetical protein  25.95 
 
 		 254 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3663  protein of unknown function DUF820  31.72 
 
 		 255 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.730325  normal  0.78404 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1345  protein of unknown function DUF820  22.71 
 
 		 281 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.05834  unclonable  0.00000000208542 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1942  protein of unknown function DUF820  30.94 
 
 		 187 aa  43.1  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2910  hypothetical protein  28.12 
 
 		 265 aa  43.1  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.308542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1069  hypothetical protein  28.75 
 
 		 259 aa  42.7  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2466  hypothetical protein  39.39 
 
 		 245 aa  42.7  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.82595  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1625  hypothetical protein  31.71 
 
 		 244 aa  42.7  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3344  hypothetical protein  25 
 
 		 256 aa  42.7  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0719317 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1536  protein of unknown function DUF820  25.29 
 
 		 239 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1336  hypothetical protein  42.67 
 
 		 203 aa  42.7  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5551  protein of unknown function DUF820  23.67 
 
 		 212 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.540442 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1317  protein of unknown function DUF820  22.71 
 
 		 295 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1335  hypothetical protein  38.67 
 
 		 203 aa  42.4  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>