59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3710 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3710  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  650    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.395031  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3711  hypothetical protein  96.91 
 
 		 332 aa  508  1e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.642224  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3709  hypothetical protein  99.59 
 
 		 319 aa  500  1e-140  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00298451 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0652  hypothetical protein  68.95 
 
 		 333 aa  349  3e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0918  hypothetical protein  60.76 
 
 		 302 aa  278  6e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176783 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1561  hypothetical protein  58.41 
 
 		 300 aa  267  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0779  hypothetical protein  68.25 
 
 		 249 aa  263  2e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.927601  normal  0.868824 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2640  hypothetical protein  52.76 
 
 		 257 aa  252  5.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.806273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2294  hypothetical protein  51.58 
 
 		 319 aa  242  7.999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.24692  normal  0.213826 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3486  hypothetical protein  50 
 
 		 340 aa  219  7e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.956349 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4427  hypothetical protein  51.53 
 
 		 290 aa  213  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145713  normal  0.510849 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2241  hypothetical protein  48.16 
 
 		 345 aa  212  7.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1217  hypothetical protein  48.98 
 
 		 314 aa  207  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.782404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3867  hypothetical protein  51.72 
 
 		 350 aa  204  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679985  normal  0.332128 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3746  hypothetical protein  50.64 
 
 		 321 aa  204  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.55082  hitchhiker  0.000155287 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3395  hypothetical protein  50 
 
 		 376 aa  203  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4135  hypothetical protein  47.21 
 
 		 289 aa  202  6e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1441  hypothetical protein  50 
 
 		 339 aa  202  7e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.958123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2797  hypothetical protein  52.99 
 
 		 312 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0437541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0728  hypothetical protein  50.45 
 
 		 343 aa  189  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3655  hypothetical protein  47.86 
 
 		 314 aa  186  5e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.643  normal  0.782958 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0614  hypothetical protein  50.47 
 
 		 402 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.0633973 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2909  hypothetical protein  48.72 
 
 		 310 aa  183  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2206  hypothetical protein  55.1 
 
 		 160 aa  153  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.404614  normal  0.720975 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2205  hypothetical protein  45.12 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.737642  normal  0.905807 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2194  hypothetical protein  31.83 
 
 		 258 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0882  protein of unknown function DUF820  28.63 
 
 		 284 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.010989  normal  0.659091 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4319  protein of unknown function DUF820  27.89 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4571  hypothetical protein  29.24 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2633  protein of unknown function DUF820  28.72 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.37277 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0215  hypothetical protein  24.16 
 
 		 259 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0180018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3344  hypothetical protein  24.42 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0719317 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2193  hypothetical protein  28.12 
 
 		 244 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1228  protein of unknown function DUF820  24.26 
 
 		 240 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.706034 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0266  protein of unknown function DUF820  24.48 
 
 		 226 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000132368  decreased coverage  0.00423088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1945  protein of unknown function DUF820  24.1 
 
 		 252 aa  52.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1780  protein of unknown function DUF820  27.19 
 
 		 281 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1972  protein of unknown function DUF820  24.24 
 
 		 252 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000213894  normal  0.0132156 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4249  protein of unknown function DUF820  23.67 
 
 		 250 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000136516  unclonable  0.00000000239983 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4210  protein of unknown function DUF820  23.67 
 
 		 250 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2447  protein of unknown function DUF820  26.52 
 
 		 255 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3591  protein of unknown function DUF820  23.23 
 
 		 241 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0889916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1252  protein of unknown function DUF820  24.85 
 
 		 247 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000809595  normal  0.287908 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2515  protein of unknown function DUF820  23.23 
 
 		 241 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1317  protein of unknown function DUF820  27.34 
 
 		 295 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1620  protein of unknown function DUF820  27.27 
 
 		 243 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1647  protein of unknown function DUF820  27.27 
 
 		 243 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4990  protein of unknown function DUF820  26.02 
 
 		 226 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0672756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2195  hypothetical protein  27.08 
 
 		 230 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.478956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2553  hypothetical protein  35.2 
 
 		 248 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.346144  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1545  hypothetical protein  26.29 
 
 		 254 aa  47.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3264  protein of unknown function DUF820  25.6 
 
 		 210 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000019093  normal  0.268128 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0097  protein of unknown function DUF820  26.61 
 
 		 248 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.609374 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0100  protein of unknown function DUF820  26.61 
 
 		 248 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3663  protein of unknown function DUF820  26.88 
 
 		 255 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.730325  normal  0.78404 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1187  protein of unknown function DUF820  31.16 
 
 		 235 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000133784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0795  hypothetical protein  32.54 
 
 		 287 aa  43.1  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3375  hypothetical protein  28.73 
 
 		 245 aa  43.1  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2287  protein of unknown function DUF820  23.81 
 
 		 239 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815689  hitchhiker  0.00756538 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>