51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1441 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1441  hypothetical protein  100 
 
 		 339 aa  663    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.958123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2294  hypothetical protein  78.14 
 
 		 319 aa  446  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.24692  normal  0.213826 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3486  hypothetical protein  73.45 
 
 		 340 aa  400  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.956349 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3395  hypothetical protein  81.56 
 
 		 376 aa  395  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3867  hypothetical protein  82.83 
 
 		 350 aa  385  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679985  normal  0.332128 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4427  hypothetical protein  78.95 
 
 		 290 aa  366  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145713  normal  0.510849 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0614  hypothetical protein  83.26 
 
 		 402 aa  355  7.999999999999999e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.0633973 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2797  hypothetical protein  79.06 
 
 		 312 aa  350  2e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0437541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0728  hypothetical protein  79.09 
 
 		 343 aa  349  4e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4135  hypothetical protein  72.96 
 
 		 289 aa  340  2e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2241  hypothetical protein  62.5 
 
 		 345 aa  334  1e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2909  hypothetical protein  79.82 
 
 		 310 aa  332  5e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3655  hypothetical protein  76.29 
 
 		 314 aa  331  1e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.643  normal  0.782958 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1217  hypothetical protein  70.85 
 
 		 314 aa  330  2e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.782404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3746  hypothetical protein  70.21 
 
 		 321 aa  313  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.55082  hitchhiker  0.000155287 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0652  hypothetical protein  53.56 
 
 		 333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1561  hypothetical protein  52.04 
 
 		 300 aa  223  4e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0918  hypothetical protein  51.07 
 
 		 302 aa  222  6e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176783 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2640  hypothetical protein  50.38 
 
 		 257 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.806273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3709  hypothetical protein  49.79 
 
 		 319 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00298451 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3711  hypothetical protein  49.21 
 
 		 332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.642224  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3710  hypothetical protein  48.05 
 
 		 330 aa  196  5.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.395031  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2206  hypothetical protein  53.02 
 
 		 160 aa  153  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.404614  normal  0.720975 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0779  hypothetical protein  44.51 
 
 		 249 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.927601  normal  0.868824 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4571  hypothetical protein  32.67 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2194  hypothetical protein  30.09 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0022  protein of unknown function DUF820  26.09 
 
 		 243 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3885  protein of unknown function DUF820  30.84 
 
 		 231 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0724109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3484  protein of unknown function DUF820  30.18 
 
 		 225 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2205  hypothetical protein  42.5 
 
 		 108 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.737642  normal  0.905807 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2193  hypothetical protein  29.41 
 
 		 244 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0882  protein of unknown function DUF820  31.22 
 
 		 284 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.010989  normal  0.659091 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3403  protein of unknown function DUF820  28.26 
 
 		 256 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.320038 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5328  phage minor structural protein  33.03 
 
 		 2196 aa  51.2  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3409  hypothetical protein  47.62 
 
 		 235 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.186244  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3408  hypothetical protein  47.62 
 
 		 249 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.316988  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1520  hypothetical protein  47.62 
 
 		 261 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0024  protein of unknown function DUF820  24.85 
 
 		 229 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2195  hypothetical protein  28.28 
 
 		 230 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.478956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1632  hypothetical protein  45.22 
 
 		 846 aa  47.8  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.790758 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2633  protein of unknown function DUF820  29.69 
 
 		 251 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.37277 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2466  hypothetical protein  34.85 
 
 		 245 aa  46.6  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.82595  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  44.79 
 
 		 894 aa  46.2  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0215  hypothetical protein  23.48 
 
 		 259 aa  46.2  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0180018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1058  large adhesin  35.64 
 
 		 2906 aa  45.8  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3392  hypothetical protein  37.27 
 
 		 2400 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000447967 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1714  protein of unknown function DUF820  34.04 
 
 		 189 aa  44.3  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000557218  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3571  protein of unknown function DUF820  28.82 
 
 		 222 aa  43.5  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.195938  normal  0.125466 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1255  protein of unknown function DUF820  47.76 
 
 		 189 aa  43.5  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3182  hypothetical protein  32.58 
 
 		 200 aa  42.7  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0784851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4205  hypothetical protein  27.52 
 
 		 204 aa  42.7  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.398339 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>