36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4427 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4427  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  570  1e-161  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145713  normal  0.510849 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2294  hypothetical protein  80.69 
 
 		 319 aa  412  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.24692  normal  0.213826 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3486  hypothetical protein  77.1 
 
 		 340 aa  372  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.956349 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3395  hypothetical protein  79.1 
 
 		 376 aa  362  3e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1441  hypothetical protein  78.15 
 
 		 339 aa  359  3e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.958123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3867  hypothetical protein  80.43 
 
 		 350 aa  357  9.999999999999999e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679985  normal  0.332128 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2797  hypothetical protein  77.68 
 
 		 312 aa  341  5.999999999999999e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0437541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4135  hypothetical protein  72.17 
 
 		 289 aa  338  4e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0614  hypothetical protein  82.71 
 
 		 402 aa  335  3.9999999999999995e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.0633973 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0728  hypothetical protein  82.73 
 
 		 343 aa  335  5.999999999999999e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2909  hypothetical protein  77.09 
 
 		 310 aa  332  5e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2241  hypothetical protein  72.73 
 
 		 345 aa  328  5.0000000000000004e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3655  hypothetical protein  75.76 
 
 		 314 aa  328  9e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.643  normal  0.782958 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1217  hypothetical protein  73.55 
 
 		 314 aa  326  3e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.782404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3746  hypothetical protein  72.61 
 
 		 321 aa  310  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.55082  hitchhiker  0.000155287 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0652  hypothetical protein  53.11 
 
 		 333 aa  248  8e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2640  hypothetical protein  49.08 
 
 		 257 aa  224  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.806273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3711  hypothetical protein  49.61 
 
 		 332 aa  223  3e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.642224  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3709  hypothetical protein  50.81 
 
 		 319 aa  221  9e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00298451 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0918  hypothetical protein  50.43 
 
 		 302 aa  216  4e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176783 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1561  hypothetical protein  53.59 
 
 		 300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3710  hypothetical protein  50.42 
 
 		 330 aa  211  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.395031  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2206  hypothetical protein  52.35 
 
 		 160 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.404614  normal  0.720975 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0779  hypothetical protein  46.6 
 
 		 249 aa  145  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.927601  normal  0.868824 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4571  hypothetical protein  31.6 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2205  hypothetical protein  41.25 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.737642  normal  0.905807 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3885  protein of unknown function DUF820  30.43 
 
 		 231 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0724109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0882  protein of unknown function DUF820  27.78 
 
 		 284 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.010989  normal  0.659091 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1520  hypothetical protein  39.77 
 
 		 261 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3403  protein of unknown function DUF820  27.6 
 
 		 256 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.320038 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3409  hypothetical protein  39.05 
 
 		 235 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.186244  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0215  hypothetical protein  24.7 
 
 		 259 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0180018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2633  protein of unknown function DUF820  29.82 
 
 		 251 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.37277 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3209  hypothetical protein  29.69 
 
 		 200 aa  45.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3484  protein of unknown function DUF820  26.73 
 
 		 225 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4148  protein of unknown function DUF820  55.56 
 
 		 182 aa  42.7  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.297117  hitchhiker  0.00000114136 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>