39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2797 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2797  hypothetical protein  100 
 
 		 312 aa  610  1e-173  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0437541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2294  hypothetical protein  79.87 
 
 		 319 aa  432  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.24692  normal  0.213826 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3395  hypothetical protein  84.02 
 
 		 376 aa  390  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3867  hypothetical protein  85.29 
 
 		 350 aa  388  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679985  normal  0.332128 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1441  hypothetical protein  79.08 
 
 		 339 aa  367  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.958123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4427  hypothetical protein  75.16 
 
 		 290 aa  367  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145713  normal  0.510849 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0728  hypothetical protein  80.91 
 
 		 343 aa  350  2e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4135  hypothetical protein  73.91 
 
 		 289 aa  343  2e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2909  hypothetical protein  84.09 
 
 		 310 aa  339  2.9999999999999998e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0614  hypothetical protein  82.79 
 
 		 402 aa  331  1e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.0633973 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2241  hypothetical protein  73.55 
 
 		 345 aa  330  2e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1217  hypothetical protein  73.47 
 
 		 314 aa  325  5e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.782404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3655  hypothetical protein  76.96 
 
 		 314 aa  318  7.999999999999999e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.643  normal  0.782958 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3746  hypothetical protein  74.35 
 
 		 321 aa  311  6.999999999999999e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.55082  hitchhiker  0.000155287 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0652  hypothetical protein  54.55 
 
 		 333 aa  253  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3709  hypothetical protein  52.03 
 
 		 319 aa  224  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00298451 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3711  hypothetical protein  50.39 
 
 		 332 aa  223  3e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.642224  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2640  hypothetical protein  52 
 
 		 257 aa  222  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.806273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1561  hypothetical protein  53.05 
 
 		 300 aa  219  5e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3710  hypothetical protein  51.26 
 
 		 330 aa  213  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.395031  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0918  hypothetical protein  43.6 
 
 		 302 aa  202  4e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176783 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2206  hypothetical protein  53.06 
 
 		 160 aa  150  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.404614  normal  0.720975 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0779  hypothetical protein  41.63 
 
 		 249 aa  136  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.927601  normal  0.868824 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3403  protein of unknown function DUF820  28.57 
 
 		 256 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.320038 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4571  hypothetical protein  31.28 
 
 		 274 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3885  protein of unknown function DUF820  30.37 
 
 		 231 aa  52.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0724109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2633  protein of unknown function DUF820  30.23 
 
 		 251 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.37277 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2205  hypothetical protein  38.27 
 
 		 108 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.737642  normal  0.905807 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3484  protein of unknown function DUF820  29.73 
 
 		 225 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2194  hypothetical protein  29.71 
 
 		 258 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0882  protein of unknown function DUF820  28.57 
 
 		 284 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.010989  normal  0.659091 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2193  hypothetical protein  28.68 
 
 		 244 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3409  hypothetical protein  33.99 
 
 		 235 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.186244  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3408  hypothetical protein  40 
 
 		 249 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.316988  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0215  hypothetical protein  23.68 
 
 		 259 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0180018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4461  hypothetical protein  32.93 
 
 		 201 aa  43.9  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0294  hypothetical protein  31.67 
 
 		 188 aa  43.9  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.223469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1625  hypothetical protein  33.87 
 
 		 244 aa  43.1  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2466  hypothetical protein  37.1 
 
 		 245 aa  42.7  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.82595  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>