127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3409 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3409  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  472  1e-132  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.186244  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3408  hypothetical protein  92.37 
 
 		 249 aa  420  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.316988  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1520  hypothetical protein  70.72 
 
 		 261 aa  352  2.9999999999999997e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4571  hypothetical protein  48.44 
 
 		 274 aa  186  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0118  hypothetical protein  49.2 
 
 		 254 aa  174  8e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3885  protein of unknown function DUF820  43.72 
 
 		 231 aa  152  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0724109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1528  protein of unknown function DUF820  39.55 
 
 		 238 aa  151  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1501  protein of unknown function DUF820  38.77 
 
 		 245 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3484  protein of unknown function DUF820  40.98 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0601  protein of unknown function DUF820  39.15 
 
 		 222 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2633  protein of unknown function DUF820  38.46 
 
 		 251 aa  131  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.37277 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3424  protein of unknown function DUF820  38.46 
 
 		 237 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.888337  normal  0.620139 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1972  protein of unknown function DUF820  38.28 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000213894  normal  0.0132156 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2515  protein of unknown function DUF820  37.68 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3591  protein of unknown function DUF820  37.68 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0889916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1252  protein of unknown function DUF820  38.22 
 
 		 247 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000809595  normal  0.287908 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1945  protein of unknown function DUF820  37.32 
 
 		 252 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1647  protein of unknown function DUF820  35.62 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1620  protein of unknown function DUF820  35.62 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3851  protein of unknown function DUF820  35.15 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0882  protein of unknown function DUF820  37.8 
 
 		 284 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.010989  normal  0.659091 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0215  hypothetical protein  34.8 
 
 		 259 aa  102  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0180018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3900  protein of unknown function DUF820  35.48 
 
 		 232 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0160105  normal  0.148171 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0068  protein of unknown function DUF820  32.11 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0266  protein of unknown function DUF820  33.79 
 
 		 226 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000132368  decreased coverage  0.00423088 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0022  protein of unknown function DUF820  31.25 
 
 		 243 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1227  protein of unknown function DUF820  32.18 
 
 		 217 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2287  protein of unknown function DUF820  34.93 
 
 		 239 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815689  hitchhiker  0.00756538 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0024  protein of unknown function DUF820  31.07 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1198  protein of unknown function DUF820  32.18 
 
 		 217 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1228  protein of unknown function DUF820  33.93 
 
 		 240 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.706034 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2233  protein of unknown function DUF820  34.93 
 
 		 225 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1545  hypothetical protein  35.44 
 
 		 254 aa  93.2  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3222  protein of unknown function DUF820  35.38 
 
 		 227 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.621847 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4438  protein of unknown function DUF820  31.88 
 
 		 229 aa  88.6  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4249  protein of unknown function DUF820  29.95 
 
 		 250 aa  86.3  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000136516  unclonable  0.00000000239983 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4210  protein of unknown function DUF820  29.95 
 
 		 250 aa  86.3  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3344  hypothetical protein  35.94 
 
 		 256 aa  85.9  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0719317 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1054  protein of unknown function DUF820  32.38 
 
 		 229 aa  85.1  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.172098  hitchhiker  0.00807661 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4500  hypothetical protein  31.58 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3264  protein of unknown function DUF820  35.63 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000019093  normal  0.268128 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2223  hypothetical protein  34.12 
 
 		 245 aa  82  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3182  hypothetical protein  37.32 
 
 		 200 aa  81.3  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0784851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3638  protein of unknown function DUF820  33.96 
 
 		 252 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1069  hypothetical protein  34.68 
 
 		 259 aa  80.5  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2195  hypothetical protein  32.44 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.478956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4990  protein of unknown function DUF820  32.43 
 
 		 226 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0672756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2193  hypothetical protein  31.96 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3373  hypothetical protein  32.97 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3374  hypothetical protein  32.97 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4319  protein of unknown function DUF820  33.03 
 
 		 272 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2194  hypothetical protein  32.37 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0319  protein of unknown function DUF820  30.43 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191601 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1536  protein of unknown function DUF820  31.47 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2910  hypothetical protein  35.62 
 
 		 265 aa  78.6  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.308542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2476  protein of unknown function DUF820  36.18 
 
 		 259 aa  78.2  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.133107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3372  hypothetical protein  32.24 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5551  protein of unknown function DUF820  31.84 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.540442 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3375  hypothetical protein  31.87 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3663  protein of unknown function DUF820  36.05 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.730325  normal  0.78404 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2447  protein of unknown function DUF820  35.85 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1780  protein of unknown function DUF820  37.23 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3571  protein of unknown function DUF820  31.25 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.195938  normal  0.125466 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2196  hypothetical protein  31.84 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.203232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3372  protein of unknown function DUF820  32.84 
 
 		 260 aa  71.6  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2576  protein of unknown function DUF820  34.33 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23751  normal  0.975603 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2812  hypothetical protein  32 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00715038  normal  0.857337 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1065  hypothetical protein  33.57 
 
 		 192 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0097  protein of unknown function DUF820  33.06 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.609374 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0100  protein of unknown function DUF820  33.06 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0420  hypothetical protein  30 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0590  protein of unknown function DUF820  30.41 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1187  protein of unknown function DUF820  29.3 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000133784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2640  hypothetical protein  33.04 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.806273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2294  hypothetical protein  36.98 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.24692  normal  0.213826 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2553  hypothetical protein  33.7 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.346144  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1743  hypothetical protein  27.78 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.311817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4443  hypothetical protein  32.47 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000339677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1443  hypothetical protein  30.11 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4148  protein of unknown function DUF820  30 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.297117  hitchhiker  0.00000114136 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0795  hypothetical protein  34.05 
 
 		 287 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0796  hypothetical protein  33.33 
 
 		 261 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4440  hypothetical protein  35.16 
 
 		 249 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0116829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4441  hypothetical protein  32.47 
 
 		 285 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000651212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4442  hypothetical protein  32.24 
 
 		 243 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000374354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4445  hypothetical protein  34.92 
 
 		 298 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.434289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4135  hypothetical protein  33.79 
 
 		 289 aa  52.8  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0614  hypothetical protein  46.27 
 
 		 402 aa  52.8  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.0633973 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3655  hypothetical protein  41.11 
 
 		 314 aa  52.8  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.643  normal  0.782958 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2546  hypothetical protein  31.3 
 
 		 188 aa  52.4  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4444  hypothetical protein  34.38 
 
 		 334 aa  52  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0323466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0797  hypothetical protein  33.17 
 
 		 254 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.530617  normal  0.99318 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1441  hypothetical protein  46.88 
 
 		 339 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.958123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3395  hypothetical protein  44.12 
 
 		 376 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3486  hypothetical protein  44.12 
 
 		 340 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.956349 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0123  protein of unknown function DUF820  33.01 
 
 		 185 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.532678  normal  0.129383 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3867  hypothetical protein  44.12 
 
 		 350 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679985  normal  0.332128 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0276  protein of unknown function DUF820  33.91 
 
 		 207 aa  48.5  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3209  hypothetical protein  33.64 
 
 		 200 aa  47.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4427  hypothetical protein  38.68 
 
 		 290 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145713  normal  0.510849 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>