91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2553 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2553  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  504  9.999999999999999e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.346144  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1780  protein of unknown function DUF820  46.94 
 
 		 281 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4319  protein of unknown function DUF820  42.17 
 
 		 272 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2447  protein of unknown function DUF820  38.62 
 
 		 255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3663  protein of unknown function DUF820  41.67 
 
 		 255 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.730325  normal  0.78404 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5551  protein of unknown function DUF820  43.6 
 
 		 212 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.540442 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0215  hypothetical protein  39.19 
 
 		 259 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0180018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3344  hypothetical protein  44.38 
 
 		 256 aa  142  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0719317 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1545  hypothetical protein  42.22 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0882  protein of unknown function DUF820  39.11 
 
 		 284 aa  135  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.010989  normal  0.659091 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3222  protein of unknown function DUF820  43.65 
 
 		 227 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.621847 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1228  protein of unknown function DUF820  34.96 
 
 		 240 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.706034 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0266  protein of unknown function DUF820  37.67 
 
 		 226 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000132368  decreased coverage  0.00423088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2515  protein of unknown function DUF820  40.54 
 
 		 241 aa  128  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3591  protein of unknown function DUF820  40.54 
 
 		 241 aa  128  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0889916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4990  protein of unknown function DUF820  40.23 
 
 		 226 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0672756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1972  protein of unknown function DUF820  32.32 
 
 		 252 aa  125  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000213894  normal  0.0132156 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1945  protein of unknown function DUF820  32.32 
 
 		 252 aa  125  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2287  protein of unknown function DUF820  38.74 
 
 		 239 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815689  hitchhiker  0.00756538 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1252  protein of unknown function DUF820  39.8 
 
 		 247 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000809595  normal  0.287908 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1647  protein of unknown function DUF820  37.89 
 
 		 243 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1620  protein of unknown function DUF820  37.89 
 
 		 243 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2233  protein of unknown function DUF820  37.97 
 
 		 225 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3264  protein of unknown function DUF820  41.52 
 
 		 210 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000019093  normal  0.268128 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3372  protein of unknown function DUF820  35.75 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2476  protein of unknown function DUF820  33.68 
 
 		 259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.133107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3638  protein of unknown function DUF820  31.67 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1345  protein of unknown function DUF820  33.9 
 
 		 281 aa  79.7  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.05834  unclonable  0.00000000208542 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1317  protein of unknown function DUF820  33.9 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2640  hypothetical protein  36.75 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.806273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2196  hypothetical protein  30.32 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.203232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2193  hypothetical protein  28.69 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2195  hypothetical protein  29.36 
 
 		 230 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.478956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1875  hypothetical protein  31.67 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.631797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2194  hypothetical protein  27.98 
 
 		 258 aa  62  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1298  hypothetical protein  29.05 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0161  protein of unknown function DUF820  26.55 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0379  protein of unknown function DUF820  31.65 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3834  hypothetical protein  28.77 
 
 		 265 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3884  hypothetical protein  28.77 
 
 		 265 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0157  protein of unknown function DUF820  28.8 
 
 		 257 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000154086  normal  0.0157865 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0388  protein of unknown function DUF820  31.01 
 
 		 256 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3885  protein of unknown function DUF820  32.43 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0724109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1561  hypothetical protein  36.21 
 
 		 300 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3484  protein of unknown function DUF820  28.57 
 
 		 225 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0918  hypothetical protein  36.61 
 
 		 302 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176783 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3409  hypothetical protein  32.21 
 
 		 235 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.186244  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4571  hypothetical protein  33.52 
 
 		 274 aa  52.8  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3408  hypothetical protein  32.21 
 
 		 249 aa  52.8  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.316988  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3182  hypothetical protein  29.53 
 
 		 200 aa  52.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0784851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3711  hypothetical protein  35.95 
 
 		 332 aa  52.4  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.642224  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1520  hypothetical protein  33.65 
 
 		 261 aa  52.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0388  hypothetical protein  28.46 
 
 		 227 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.596384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3710  hypothetical protein  35.95 
 
 		 330 aa  52.4  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.395031  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3709  hypothetical protein  35.95 
 
 		 319 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00298451 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0319  protein of unknown function DUF820  33.04 
 
 		 232 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191601 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3529  protein of unknown function DUF820  26.69 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3571  protein of unknown function DUF820  27.06 
 
 		 222 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.195938  normal  0.125466 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1069  hypothetical protein  27.17 
 
 		 259 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1412  protein of unknown function DUF820  27.59 
 
 		 274 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1441  protein of unknown function DUF820  27.59 
 
 		 274 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.828599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1743  hypothetical protein  29.63 
 
 		 245 aa  48.9  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.311817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2223  hypothetical protein  31.34 
 
 		 245 aa  48.9  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0068  protein of unknown function DUF820  28.24 
 
 		 230 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2199  protein of unknown function DUF820  26.92 
 
 		 265 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000553062 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1484  protein of unknown function DUF820  27.4 
 
 		 229 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000078309 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3851  protein of unknown function DUF820  27.04 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0118  hypothetical protein  32.17 
 
 		 254 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0601  protein of unknown function DUF820  31.52 
 
 		 222 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0024  protein of unknown function DUF820  27.17 
 
 		 229 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3900  protein of unknown function DUF820  25.88 
 
 		 232 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0160105  normal  0.148171 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3073  hypothetical protein  31.16 
 
 		 243 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511109 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1198  protein of unknown function DUF820  27.44 
 
 		 217 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2988  hypothetical protein  28.38 
 
 		 240 aa  45.4  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00225611  normal  0.747663 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2910  hypothetical protein  28.46 
 
 		 265 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.308542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4968  protein of unknown function DUF820  29.37 
 
 		 206 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000167718  unclonable  0.00000000000000331839 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0652  hypothetical protein  29.8 
 
 		 333 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1227  protein of unknown function DUF820  27.5 
 
 		 217 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0100  protein of unknown function DUF820  24.23 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0097  protein of unknown function DUF820  24.23 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.609374 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1187  protein of unknown function DUF820  28.38 
 
 		 235 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000133784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0796  hypothetical protein  31.37 
 
 		 261 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3424  protein of unknown function DUF820  28.16 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.888337  normal  0.620139 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0022  protein of unknown function DUF820  27.84 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3403  protein of unknown function DUF820  25.76 
 
 		 256 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.320038 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4500  hypothetical protein  24.22 
 
 		 260 aa  43.1  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0797  hypothetical protein  32.47 
 
 		 254 aa  42.4  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.530617  normal  0.99318 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3374  hypothetical protein  24.86 
 
 		 259 aa  42.4  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3373  hypothetical protein  24.86 
 
 		 245 aa  42.4  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1489  protein of unknown function DUF820  30.51 
 
 		 187 aa  42  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4778  protein of unknown function DUF820  38.1 
 
 		 193 aa  42  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00894932  hitchhiker  0.000613613 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>