65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3867 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3867  hypothetical protein  100 
 
 
350 aa  675    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679985  normal  0.332128 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3486  hypothetical protein  96.75 
 
 
340 aa  460  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.956349 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3395  hypothetical protein  95.83 
 
 
376 aa  452  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317872  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2294  hypothetical protein  80.33 
 
 
319 aa  446  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.24692  normal  0.213826 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1441  hypothetical protein  83.77 
 
 
339 aa  388  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.958123  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2797  hypothetical protein  85.9 
 
 
312 aa  373  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0437541  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4427  hypothetical protein  80.45 
 
 
290 aa  365  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145713  normal  0.510849 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0614  hypothetical protein  86.05 
 
 
402 aa  363  3e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.0633973 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0728  hypothetical protein  79.19 
 
 
343 aa  357  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4135  hypothetical protein  77.68 
 
 
289 aa  357  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2241  hypothetical protein  68.02 
 
 
345 aa  352  5.9999999999999994e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1217  hypothetical protein  78.72 
 
 
314 aa  344  1e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.782404  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3655  hypothetical protein  79.37 
 
 
314 aa  342  5.999999999999999e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.643  normal  0.782958 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2909  hypothetical protein  82.06 
 
 
310 aa  339  5e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11169  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3746  hypothetical protein  79.02 
 
 
321 aa  330  2e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.55082  hitchhiker  0.000155287 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0652  hypothetical protein  55.27 
 
 
333 aa  258  1e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2640  hypothetical protein  51 
 
 
257 aa  224  3e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.806273  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0918  hypothetical protein  52.75 
 
 
302 aa  219  7.999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.176783 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1561  hypothetical protein  50.92 
 
 
300 aa  216  4e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3709  hypothetical protein  50.41 
 
 
319 aa  216  5e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00298451 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3711  hypothetical protein  50.2 
 
 
332 aa  216  5.9999999999999996e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.642224  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3710  hypothetical protein  45.92 
 
 
330 aa  187  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.395031  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2206  hypothetical protein  51.01 
 
 
160 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.404614  normal  0.720975 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0779  hypothetical protein  44.72 
 
 
249 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.927601  normal  0.868824 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4571  hypothetical protein  33.82 
 
 
274 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2194  hypothetical protein  33.19 
 
 
258 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2205  hypothetical protein  43.21 
 
 
108 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.737642  normal  0.905807 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1520  hypothetical protein  43.18 
 
 
261 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2193  hypothetical protein  32.55 
 
 
244 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3403  protein of unknown function DUF820  27.08 
 
 
256 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.320038 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3885  protein of unknown function DUF820  30.13 
 
 
231 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0724109  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2633  protein of unknown function DUF820  27.78 
 
 
251 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.37277 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0882  protein of unknown function DUF820  28.02 
 
 
284 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.010989  normal  0.659091 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3409  hypothetical protein  41.86 
 
 
235 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.186244  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3484  protein of unknown function DUF820  32.32 
 
 
225 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1058  large adhesin  34.78 
 
 
2906 aa  52  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  46.07 
 
 
894 aa  51.2  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3408  hypothetical protein  41.86 
 
 
249 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.316988  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5328  phage minor structural protein  35.09 
 
 
2196 aa  50.4  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1372  phage-related tail fiber protein  32.61 
 
 
762 aa  50.4  0.00005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3319  lytic transglycosylase, catalytic  34.91 
 
 
718 aa  48.9  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4210  protein of unknown function DUF820  28.87 
 
 
250 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4249  protein of unknown function DUF820  28.87 
 
 
250 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000136516  unclonable  0.00000000239983 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2910  hypothetical protein  34.91 
 
 
265 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.308542  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3182  hypothetical protein  37.78 
 
 
200 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0784851  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0598  translation initiation factor IF-2  42.86 
 
 
891 aa  47.4  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223745  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0118  hypothetical protein  30.71 
 
 
254 aa  47  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3346  translation initiation factor IF-2  48.61 
 
 
901 aa  47  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.12411  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0215  hypothetical protein  23.46 
 
 
259 aa  47  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0180018  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2195  hypothetical protein  30.5 
 
 
230 aa  46.6  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.478956  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4955  S-layer domain protein  35.11 
 
 
914 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0795  hypothetical protein  37.65 
 
 
287 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4461  hypothetical protein  34.36 
 
 
201 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4319  protein of unknown function DUF820  28.88 
 
 
272 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3209  hypothetical protein  29.57 
 
 
200 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1545  hypothetical protein  26.2 
 
 
254 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  26.67 
 
 
3242 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1992  Excalibur domain-containing protein  39.25 
 
 
334 aa  43.9  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00268093  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2196  hypothetical protein  30.34 
 
 
217 aa  44.3  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.203232  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1743  hypothetical protein  28.37 
 
 
245 aa  43.1  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.311817  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3160  hypothetical protein  40.4 
 
 
330 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0554413 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3900  protein of unknown function DUF820  30.29 
 
 
232 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0160105  normal  0.148171 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2296  hypothetical protein  37.27 
 
 
331 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396677  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3606  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.69 
 
 
561 aa  42.7  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00455766  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1255  protein of unknown function DUF820  39.13 
 
 
189 aa  42.7  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>