62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0420 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0420  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  486  1e-136  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1065  hypothetical protein  77.48 
 
 		 192 aa  255  5e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3408  hypothetical protein  34.92 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.316988  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3409  hypothetical protein  34.13 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.186244  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0266  protein of unknown function DUF820  30.05 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000132368  decreased coverage  0.00423088 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1520  hypothetical protein  32.54 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1647  protein of unknown function DUF820  28.25 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1620  protein of unknown function DUF820  28.25 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4990  protein of unknown function DUF820  30.05 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0672756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2195  hypothetical protein  29.31 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.478956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0118  hypothetical protein  28.99 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2196  hypothetical protein  28.76 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.203232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1545  hypothetical protein  29.56 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3571  protein of unknown function DUF820  30.91 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.195938  normal  0.125466 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1069  hypothetical protein  29.53 
 
 		 259 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1945  protein of unknown function DUF820  25.76 
 
 		 252 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3264  protein of unknown function DUF820  29.44 
 
 		 210 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000019093  normal  0.268128 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2194  hypothetical protein  29.67 
 
 		 258 aa  52.8  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2193  hypothetical protein  29.67 
 
 		 244 aa  52.8  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1972  protein of unknown function DUF820  25.76 
 
 		 252 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000213894  normal  0.0132156 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4571  hypothetical protein  29.14 
 
 		 274 aa  52.8  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1198  protein of unknown function DUF820  28.31 
 
 		 217 aa  52  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1227  protein of unknown function DUF820  27.85 
 
 		 217 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0097  protein of unknown function DUF820  33.08 
 
 		 248 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.609374 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0100  protein of unknown function DUF820  33.08 
 
 		 248 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3344  hypothetical protein  25.98 
 
 		 256 aa  49.3  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0719317 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3851  protein of unknown function DUF820  27.4 
 
 		 218 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4249  protein of unknown function DUF820  26.24 
 
 		 250 aa  48.5  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000136516  unclonable  0.00000000239983 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4210  protein of unknown function DUF820  26.24 
 
 		 250 aa  48.5  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4500  hypothetical protein  26.83 
 
 		 260 aa  48.5  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3591  protein of unknown function DUF820  23.35 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0889916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1252  protein of unknown function DUF820  27.56 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000809595  normal  0.287908 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2515  protein of unknown function DUF820  23.35 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3885  protein of unknown function DUF820  26.75 
 
 		 231 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0724109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3484  protein of unknown function DUF820  27.42 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1228  protein of unknown function DUF820  26.87 
 
 		 240 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.706034 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3395  hypothetical protein  25.87 
 
 		 376 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1780  protein of unknown function DUF820  28.03 
 
 		 281 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0652  hypothetical protein  23.59 
 
 		 333 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3222  protein of unknown function DUF820  25.94 
 
 		 227 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.621847 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3182  hypothetical protein  28.06 
 
 		 200 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0784851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3373  hypothetical protein  31.03 
 
 		 245 aa  46.2  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3374  hypothetical protein  31.03 
 
 		 259 aa  46.2  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0068  protein of unknown function DUF820  29.63 
 
 		 230 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3486  hypothetical protein  25.87 
 
 		 340 aa  45.8  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.956349 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2223  hypothetical protein  30.68 
 
 		 245 aa  45.4  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2640  hypothetical protein  26.32 
 
 		 257 aa  45.4  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.806273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4135  hypothetical protein  27.21 
 
 		 289 aa  45.4  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2576  protein of unknown function DUF820  31.65 
 
 		 227 aa  45.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23751  normal  0.975603 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1536  protein of unknown function DUF820  30.22 
 
 		 239 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0882  protein of unknown function DUF820  24.73 
 
 		 284 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.010989  normal  0.659091 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3372  hypothetical protein  30.46 
 
 		 259 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3867  hypothetical protein  25.37 
 
 		 350 aa  45.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679985  normal  0.332128 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0215  hypothetical protein  25 
 
 		 259 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0180018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1054  protein of unknown function DUF820  29.51 
 
 		 229 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.172098  hitchhiker  0.00807661 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0614  hypothetical protein  27.72 
 
 		 402 aa  43.5  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.0633973 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2910  hypothetical protein  29.38 
 
 		 265 aa  43.5  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.308542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3375  hypothetical protein  28.11 
 
 		 245 aa  43.5  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1501  protein of unknown function DUF820  24.06 
 
 		 245 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0918  hypothetical protein  24.48 
 
 		 302 aa  42.7  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176783 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3900  protein of unknown function DUF820  26.18 
 
 		 232 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0160105  normal  0.148171 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1528  protein of unknown function DUF820  23.67 
 
 		 238 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>