56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3655 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3655  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  614  1e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.643  normal  0.782958 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2294  hypothetical protein  78.14 
 
 		 319 aa  405  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.24692  normal  0.213826 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3486  hypothetical protein  80.93 
 
 		 340 aa  362  4e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.956349 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3867  hypothetical protein  79.49 
 
 		 350 aa  355  5e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679985  normal  0.332128 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4427  hypothetical protein  76.65 
 
 		 290 aa  350  2e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145713  normal  0.510849 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1441  hypothetical protein  76.76 
 
 		 339 aa  349  3e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.958123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3395  hypothetical protein  76.23 
 
 		 376 aa  349  4e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0614  hypothetical protein  84.19 
 
 		 402 aa  342  4e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.0633973 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2241  hypothetical protein  74.9 
 
 		 345 aa  333  3e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4135  hypothetical protein  72.73 
 
 		 289 aa  333  3e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1217  hypothetical protein  74.9 
 
 		 314 aa  330  1e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.782404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2909  hypothetical protein  79.82 
 
 		 310 aa  325  7e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0728  hypothetical protein  75.91 
 
 		 343 aa  315  9e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3746  hypothetical protein  74.89 
 
 		 321 aa  314  9.999999999999999e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.55082  hitchhiker  0.000155287 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2797  hypothetical protein  76.96 
 
 		 312 aa  312  3.9999999999999997e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0437541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0652  hypothetical protein  51.65 
 
 		 333 aa  232  6e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3711  hypothetical protein  48.63 
 
 		 332 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.642224  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2640  hypothetical protein  45.76 
 
 		 257 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.806273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3709  hypothetical protein  50.83 
 
 		 319 aa  210  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00298451 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0918  hypothetical protein  49.13 
 
 		 302 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176783 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1561  hypothetical protein  49.11 
 
 		 300 aa  209  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3710  hypothetical protein  48.95 
 
 		 330 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.395031  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2206  hypothetical protein  53.47 
 
 		 160 aa  146  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.404614  normal  0.720975 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0779  hypothetical protein  45.63 
 
 		 249 aa  139  7.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.927601  normal  0.868824 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4571  hypothetical protein  30.97 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1520  hypothetical protein  39.09 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2633  protein of unknown function DUF820  30.29 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.37277 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3484  protein of unknown function DUF820  29.49 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3885  protein of unknown function DUF820  34.12 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0724109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0882  protein of unknown function DUF820  31.31 
 
 		 284 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.010989  normal  0.659091 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2194  hypothetical protein  32.74 
 
 		 258 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3424  protein of unknown function DUF820  31.93 
 
 		 237 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.888337  normal  0.620139 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0118  hypothetical protein  36.73 
 
 		 254 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3409  hypothetical protein  37.93 
 
 		 235 aa  52.8  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.186244  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3408  hypothetical protein  41.11 
 
 		 249 aa  52.4  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.316988  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2466  hypothetical protein  32.5 
 
 		 245 aa  52.4  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.82595  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2205  hypothetical protein  39.39 
 
 		 108 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.737642  normal  0.905807 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2193  hypothetical protein  31.22 
 
 		 244 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0022  protein of unknown function DUF820  26.92 
 
 		 243 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3403  protein of unknown function DUF820  27.94 
 
 		 256 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.320038 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0215  hypothetical protein  22.13 
 
 		 259 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0180018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2195  hypothetical protein  30.89 
 
 		 230 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.478956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4205  hypothetical protein  26.85 
 
 		 204 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.398339 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3209  hypothetical protein  30.71 
 
 		 200 aa  44.3  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1945  protein of unknown function DUF820  27.17 
 
 		 252 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5328  phage minor structural protein  35.37 
 
 		 2196 aa  44.3  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0436  hypothetical protein  27.93 
 
 		 204 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0970705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1972  protein of unknown function DUF820  27.17 
 
 		 252 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000213894  normal  0.0132156 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1625  hypothetical protein  35.48 
 
 		 244 aa  43.5  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3319  lytic transglycosylase, catalytic  43.08 
 
 		 718 aa  43.5  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1942  protein of unknown function DUF820  30.58 
 
 		 187 aa  43.1  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0024  protein of unknown function DUF820  25.47 
 
 		 229 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4500  hypothetical protein  24.74 
 
 		 260 aa  42.7  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0294  hypothetical protein  32.41 
 
 		 188 aa  42.7  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.223469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1620  protein of unknown function DUF820  23.01 
 
 		 243 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1647  protein of unknown function DUF820  23.01 
 
 		 243 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>